RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433909.2

CCDC189-201, Transcript of coiled-coil domain containing 189, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC189, Length 1,157 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC189-201ENST00000433909 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa23.49■■□□□ 1.35
CCDC189-201ENST00000433909 PRO3102Q9H379 93 aa23.49■■□□□ 1.35
CCDC189-201ENST00000433909 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa23.49■■□□□ 1.35
CCDC189-201ENST00000433909 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa23.49■■□□□ 1.35
CCDC189-201ENST00000433909 USP17L12C9JPN9 530 aa23.48■■□□□ 1.35
CCDC189-201ENST00000433909 USP17L21D6R901 530 aa23.48■■□□□ 1.35
CCDC189-201ENST00000433909 ICA1Q05084 483 aa23.48■■□□□ 1.35
CCDC189-201ENST00000433909 COG2Q14746 738 aa23.48■■□□□ 1.35
CCDC189-201ENST00000433909 C12orf60Q5U649 245 aa23.48■■□□□ 1.35
CCDC189-201ENST00000433909 CLEC10AQ8IUN9 316 aa23.48■■□□□ 1.35
CCDC189-201ENST00000433909 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa23.48■■□□□ 1.35
CCDC189-201ENST00000433909 HOXC10Q9NYD6 342 aa23.48■■□□□ 1.35
CCDC189-201ENST00000433909 SMIM22K7EJ46 135 aa23.47■■□□□ 1.35
CCDC189-201ENST00000433909 CDK8P49336 464 aa23.47■■□□□ 1.35
CCDC189-201ENST00000433909 MFSD14CQ5VZR4 134 aa23.47■■□□□ 1.35
CCDC189-201ENST00000433909 C7orf61Q8IZ16 206 aa23.47■■□□□ 1.35
CCDC189-201ENST00000433909 CCDC17Q96LX7 622 aa23.47■■□□□ 1.35
CCDC189-201ENST00000433909 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
CCDC189-201ENST00000433909 SH2D4AQ9H788 454 aa23.47■■□□□ 1.35
CCDC189-201ENST00000433909 ECHDC1Q9NTX5 307 aa23.47■■□□□ 1.35
CCDC189-201ENST00000433909 GRB14Q14449 540 aa23.46■■□□□ 1.35
CCDC189-201ENST00000433909 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa23.46■■□□□ 1.35
CCDC189-201ENST00000433909 FLRT1Q9NZU1 646 aa23.46■■□□□ 1.35
CCDC189-201ENST00000433909 ATP2B2Q01814 1243 aa23.45■■□□□ 1.34
CCDC189-201ENST00000433909 C16orf86Q6ZW13 317 aa23.45■■□□□ 1.34
CCDC189-201ENST00000433909 SIAH1Q8IUQ4 282 aa23.45■■□□□ 1.34
CCDC189-201ENST00000433909 SPICE1Q8N0Z3 855 aa23.45■■□□□ 1.34
CCDC189-201ENST00000433909 LPAR1Q92633 364 aa23.45■■□□□ 1.34
CCDC189-201ENST00000433909 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
CCDC189-201ENST00000433909 STAP2Q9UGK3 403 aa23.45■■□□□ 1.34
CCDC189-201ENST00000433909 TMX2Q9Y320 296 aa23.45■■□□□ 1.34
CCDC189-201ENST00000433909 HOXC6P09630 235 aa23.44■■□□□ 1.34
CCDC189-201ENST00000433909 LHX8Q68G74 356 aa23.44■■□□□ 1.34
CCDC189-201ENST00000433909 SPATC1LQ9H0A9 340 aa23.44■■□□□ 1.34
CCDC189-201ENST00000433909 VCPKMTQ9H867 229 aa23.44■■□□□ 1.34
CCDC189-201ENST00000433909 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
CCDC189-201ENST00000433909 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
CCDC189-201ENST00000433909 PFASO15067 1338 aa23.43■■□□□ 1.34
CCDC189-201ENST00000433909 FLOT1O75955 427 aa23.43■■□□□ 1.34
CCDC189-201ENST00000433909 DSG3P32926 999 aa23.43■■□□□ 1.34
CCDC189-201ENST00000433909 CTR9Q6PD62 1173 aa23.43■■□□□ 1.34
CCDC189-201ENST00000433909 MB21D1Q8N884 522 aa23.43■■□□□ 1.34
CCDC189-201ENST00000433909 NPLOC4Q8TAT6 608 aa23.43■■□□□ 1.34
CCDC189-201ENST00000433909 GPATCH3Q96I76 525 aa23.43■■□□□ 1.34
CCDC189-201ENST00000433909 DCTPP1Q9H773 170 aa23.43■■□□□ 1.34
CCDC189-201ENST00000433909 ALPK3Q96L96 1907 aa23.43■■□□□ 1.34
CCDC189-201ENST00000433909 PLS1Q14651 629 aa23.42■■□□□ 1.34
CCDC189-201ENST00000433909 TSHZ3Q63HK5 1081 aa23.42■■□□□ 1.34
CCDC189-201ENST00000433909 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
CCDC189-201ENST00000433909 DPP9Q86TI2 863 aa23.42■■□□□ 1.34
CCDC189-201ENST00000433909 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
CCDC189-201ENST00000433909 LAMA3Q16787 3333 aa23.42■■□□□ 1.34
CCDC189-201ENST00000433909 A0A1W2PPC1 479 aa23.41■■□□□ 1.34
CCDC189-201ENST00000433909 WDR46O15213 610 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
CCDC189-201ENST00000433909 EEF2P13639 858 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
CCDC189-201ENST00000433909 ERCC3P19447 782 aa23.41■■□□□ 1.34
CCDC189-201ENST00000433909 ADORA2AP29274 412 aa23.41■■□□□ 1.34
CCDC189-201ENST00000433909 CNGA1P29973 690 aa23.41■■□□□ 1.34
CCDC189-201ENST00000433909 CYP2C19P33261 490 aa23.41■■□□□ 1.34
CCDC189-201ENST00000433909 KBTBD3Q8NAB2 608 aa23.41■■□□□ 1.34
CCDC189-201ENST00000433909 SHCBP1Q8NEM2 672 aa23.41■■□□□ 1.34
CCDC189-201ENST00000433909 ATG4CQ96DT6 458 aa23.41■■□□□ 1.34
CCDC189-201ENST00000433909 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
CCDC189-201ENST00000433909 MYH7P12883 1935 aa23.4■■□□□ 1.34
CCDC189-201ENST00000433909 MYH8P13535 1937 aa23.4■■□□□ 1.34
CCDC189-201ENST00000433909 STRNO43815 780 aa23.4■■□□□ 1.34
CCDC189-201ENST00000433909 COL6A1P12109 1028 aa23.4■■□□□ 1.34
CCDC189-201ENST00000433909 NCAPG2Q86XI2 1143 aa23.4■■□□□ 1.34
CCDC189-201ENST00000433909 KANSL2Q9H9L4 492 aa23.4■■□□□ 1.34
CCDC189-201ENST00000433909 SYN1P17600 705 aa23.39■■□□□ 1.33
CCDC189-201ENST00000433909 MROH8Q9H579 483 aa23.39■■□□□ 1.33
CCDC189-201ENST00000433909 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
CCDC189-201ENST00000433909 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
CCDC189-201ENST00000433909 RAD21O60216 631 aa23.38■■□□□ 1.33
CCDC189-201ENST00000433909 MSCO60682 206 aa23.38■■□□□ 1.33
CCDC189-201ENST00000433909 APPBP2Q92624 585 aa23.38■■□□□ 1.33
CCDC189-201ENST00000433909 OSBP2Q969R2 916 aa23.38■■□□□ 1.33
CCDC189-201ENST00000433909 GDF15Q99988 308 aa23.38■■□□□ 1.33
CCDC189-201ENST00000433909 GOPCQ9HD26 462 aa23.38■■□□□ 1.33
CCDC189-201ENST00000433909 GSG1L2A8MUP6 293 aa23.37■■□□□ 1.33
CCDC189-201ENST00000433909 SBK1Q52WX2 424 aa23.37■■□□□ 1.33
CCDC189-201ENST00000433909 OLFML2BQ68BL8 750 aa23.37■■□□□ 1.33
CCDC189-201ENST00000433909 STK11IPQ8N1F8 1099 aa23.37■■□□□ 1.33
CCDC189-201ENST00000433909 TRPV1Q8NER1 839 aa23.37■■□□□ 1.33
CCDC189-201ENST00000433909 RLFQ13129 1914 aa23.37■■□□□ 1.33
CCDC189-201ENST00000433909 MINDY4BA8MYZ0 360 aa23.36■■□□□ 1.33
CCDC189-201ENST00000433909 COBLO75128 1261 aa23.36■■□□□ 1.33
CCDC189-201ENST00000433909 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
CCDC189-201ENST00000433909 TMEM132BQ14DG7 1078 aa23.36■■□□□ 1.33
CCDC189-201ENST00000433909 LRRC26Q2I0M4 334 aa23.36■■□□□ 1.33
CCDC189-201ENST00000433909 GIMAP6Q6P9H5 292 aa23.36■■□□□ 1.33
CCDC189-201ENST00000433909 MKNK2Q9HBH9 465 aa23.36■■□□□ 1.33
CCDC189-201ENST00000433909 FBXO28Q9NVF7 368 aa23.36■■□□□ 1.33
CCDC189-201ENST00000433909 SLC5A4Q9NY91 659 aa23.36■■□□□ 1.33
CCDC189-201ENST00000433909 A0A0G2JMZ2 1700 aa23.36■■□□□ 1.33
CCDC189-201ENST00000433909 GPAA1O43292 621 aa23.35■■□□□ 1.33
CCDC189-201ENST00000433909 IGHA2P01877 340 aa23.35■■□□□ 1.33
CCDC189-201ENST00000433909 CYBAP13498 195 aa23.35■■□□□ 1.33
CCDC189-201ENST00000433909 BMP8BP34820 402 aa23.35■■□□□ 1.33
CCDC189-201ENST00000433909 ABRAQ8N0Z2 381 aa23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms