RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433557.1

UTRN-208, Transcript of utrophin, humanhuman

TSL 4

Gene UTRN, Length 354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRN-208ENST00000433557 TANGO6Q9C0B7 1094 aa26■■□□□ 1.75
UTRN-208ENST00000433557 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
UTRN-208ENST00000433557 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
UTRN-208ENST00000433557 VCPKMTQ9H867 229 aa26■■□□□ 1.75
UTRN-208ENST00000433557 CNNM2Q9H8M5 875 aa26■■□□□ 1.75
UTRN-208ENST00000433557 CPA4Q9UI42 421 aa26■■□□□ 1.75
UTRN-208ENST00000433557 USP17L15C9J2P7 530 aa25.99■■□□□ 1.75
UTRN-208ENST00000433557 USP17L13C9JLJ4 530 aa25.99■■□□□ 1.75
UTRN-208ENST00000433557 USP17L11C9JVI0 530 aa25.99■■□□□ 1.75
UTRN-208ENST00000433557 USP17L18D6R9N7 530 aa25.99■■□□□ 1.75
UTRN-208ENST00000433557 USP17L22D6RA61 530 aa25.99■■□□□ 1.75
UTRN-208ENST00000433557 USP17L17D6RBQ6 530 aa25.99■■□□□ 1.75
UTRN-208ENST00000433557 USP17L19D6RCP7 530 aa25.99■■□□□ 1.75
UTRN-208ENST00000433557 USP17L20D6RJB6 530 aa25.99■■□□□ 1.75
UTRN-208ENST00000433557 SP3Q02447 781 aa25.99■■□□□ 1.75
UTRN-208ENST00000433557 USP17L24Q0WX57 530 aa25.99■■□□□ 1.75
UTRN-208ENST00000433557 CYP21A2P08686 494 aa25.98■■□□□ 1.75
UTRN-208ENST00000433557 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
UTRN-208ENST00000433557 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
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UTRN-208ENST00000433557 NMT2O60551 498 aa25.97■■□□□ 1.75
UTRN-208ENST00000433557 KDM4AO75164 1064 aa25.97■■□□□ 1.75
UTRN-208ENST00000433557 NT5C2P49902 561 aa25.97■■□□□ 1.75
UTRN-208ENST00000433557 KIF22Q14807 665 aa25.97■■□□□ 1.75
UTRN-208ENST00000433557 ERO1AQ96HE7 468 aa25.97■■□□□ 1.75
UTRN-208ENST00000433557 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
UTRN-208ENST00000433557 IQCA1Q86XH1 822 aa25.96■■□□□ 1.75
UTRN-208ENST00000433557 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
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UTRN-208ENST00000433557 C17orf99Q6UX52 265 aa25.95■■□□□ 1.74
UTRN-208ENST00000433557 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa25.95■■□□□ 1.74
UTRN-208ENST00000433557 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa25.95■■□□□ 1.74
UTRN-208ENST00000433557 IL17RBQ9NRM6 502 aa25.95■■□□□ 1.74
UTRN-208ENST00000433557 ADGRA2Q96PE1 1338 aa25.94■■□□□ 1.74
UTRN-208ENST00000433557 F5H6K3 240 aa25.94■■□□□ 1.74
UTRN-208ENST00000433557 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
UTRN-208ENST00000433557 HERVK_113P62684 666 aa25.94■■□□□ 1.74
UTRN-208ENST00000433557 KLRC3Q07444 240 aa25.94■■□□□ 1.74
UTRN-208ENST00000433557 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa25.94■■□□□ 1.74
UTRN-208ENST00000433557 RNF20Q5VTR2 975 aa25.94■■□□□ 1.74
UTRN-208ENST00000433557 CD99L2Q8TCZ2 262 aa25.94■■□□□ 1.74
UTRN-208ENST00000433557 MKL1Q969V6 931 aa25.94■■□□□ 1.74
UTRN-208ENST00000433557 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
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UTRN-208ENST00000433557 REC8O95072 547 aa25.93■■□□□ 1.74
UTRN-208ENST00000433557 ARHGEF6Q15052 776 aa25.93■■□□□ 1.74
UTRN-208ENST00000433557 CCDC178Q5BJE1 867 aa25.93■■□□□ 1.74
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UTRN-208ENST00000433557 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa25.93■■□□□ 1.74
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UTRN-208ENST00000433557 E7EWF7 191 aa25.92■■□□□ 1.74
UTRN-208ENST00000433557 FLOT1O75955 427 aa25.92■■□□□ 1.74
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UTRN-208ENST00000433557 FAM83BQ5T0W9 1011 aa25.92■■□□□ 1.74
UTRN-208ENST00000433557 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
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UTRN-208ENST00000433557 PAGR1Q9BTK6 254 aa25.92■■□□□ 1.74
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UTRN-208ENST00000433557 SLC27A2O14975 620 aa25.91■■□□□ 1.74
UTRN-208ENST00000433557 BCRP11274 1271 aa25.91■■□□□ 1.74
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UTRN-208ENST00000433557 CHMP4CQ96CF2 233 aa25.91■■□□□ 1.74
UTRN-208ENST00000433557 ZSWIM5Q9P217 1185 aa25.91■■□□□ 1.74
UTRN-208ENST00000433557 TOP1P11387 765 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
UTRN-208ENST00000433557 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
UTRN-208ENST00000433557 FAM110CQ1W6H9 321 aa25.9■■□□□ 1.74
UTRN-208ENST00000433557 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
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UTRN-208ENST00000433557 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa25.9■■□□□ 1.74
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UTRN-208ENST00000433557 NKX2-3Q8TAU0 364 aa25.89■■□□□ 1.74
UTRN-208ENST00000433557 TAF6LQ9Y6J9 622 aa25.89■■□□□ 1.74
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UTRN-208ENST00000433557 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
UTRN-208ENST00000433557 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
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UTRN-208ENST00000433557 EFCC1Q9HA90 598 aa25.88■■□□□ 1.73
UTRN-208ENST00000433557 TRIM17Q9Y577 477 aa25.88■■□□□ 1.73
UTRN-208ENST00000433557 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa25.88■■□□□ 1.73
UTRN-208ENST00000433557 TNKSO95271 1327 aa25.88■■□□□ 1.73
UTRN-208ENST00000433557 RLFQ13129 1914 aa25.87■■□□□ 1.73
UTRN-208ENST00000433557 ERICH2A1L162 156 aa25.87■■□□□ 1.73
UTRN-208ENST00000433557 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
UTRN-208ENST00000433557 BMP3P12645 472 aa25.87■■□□□ 1.73
UTRN-208ENST00000433557 SLC1A4P43007 532 aa25.87■■□□□ 1.73
UTRN-208ENST00000433557 PSMC4P43686 418 aa25.87■■□□□ 1.73
UTRN-208ENST00000433557 FCGRTP55899 365 aa25.87■■□□□ 1.73
UTRN-208ENST00000433557 IKQ13123 557 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
UTRN-208ENST00000433557 SART3Q15020 963 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
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