RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431413.5

HERC3-206, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 761 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-206ENST00000431413 TRIM32Q13049 653 aa18.19■□□□□ 0.5
HERC3-206ENST00000431413 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa18.19■□□□□ 0.5
HERC3-206ENST00000431413 POTEEQ6S8J3 1075 aa18.19■□□□□ 0.5
HERC3-206ENST00000431413 MB21D1Q8N884 522 aa18.19■□□□□ 0.5
HERC3-206ENST00000431413 TMX2Q9Y320 296 aa18.19■□□□□ 0.5
HERC3-206ENST00000431413 CEP290O15078 2479 aa18.18■□□□□ 0.5
HERC3-206ENST00000431413 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa18.18■□□□□ 0.5
HERC3-206ENST00000431413 ERC2O15083 957 aa18.18■□□□□ 0.5
HERC3-206ENST00000431413 PTPREP23469 700 aa18.18■□□□□ 0.5
HERC3-206ENST00000431413 MFSD14CQ5VZR4 134 aa18.18■□□□□ 0.5
HERC3-206ENST00000431413 GIMAP6Q6P9H5 292 aa18.18■□□□□ 0.5
HERC3-206ENST00000431413 CTR9Q6PD62 1173 aa18.18■□□□□ 0.5
HERC3-206ENST00000431413 APPBP2Q92624 585 aa18.18■□□□□ 0.5
HERC3-206ENST00000431413 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
HERC3-206ENST00000431413 NBPF3Q9H094 633 aa18.18■□□□□ 0.5
HERC3-206ENST00000431413 KANSL2Q9H9L4 492 aa18.18■□□□□ 0.5
HERC3-206ENST00000431413 BTBD7Q9P203 1132 aa18.18■□□□□ 0.5
HERC3-206ENST00000431413 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
HERC3-206ENST00000431413 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
HERC3-206ENST00000431413 CHGBP05060 677 aa18.17■□□□□ 0.5
HERC3-206ENST00000431413 GNAT2P19087 354 aa18.17■□□□□ 0.5
HERC3-206ENST00000431413 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
HERC3-206ENST00000431413 CHRDL2Q6WN34 429 aa18.17■□□□□ 0.5
HERC3-206ENST00000431413 VCPKMTQ9H867 229 aa18.17■□□□□ 0.5
HERC3-206ENST00000431413 OGDHLQ9ULD0 1010 aa18.17■□□□□ 0.5
HERC3-206ENST00000431413 TTC41PQ6P2S7 1318 aa18.17■□□□□ 0.5
HERC3-206ENST00000431413 WDR46O15213 610 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
HERC3-206ENST00000431413 STRNO43815 780 aa18.16■□□□□ 0.5
HERC3-206ENST00000431413 FLOT1O75955 427 aa18.16■□□□□ 0.5
HERC3-206ENST00000431413 ATP2B2Q01814 1243 aa18.16■□□□□ 0.5
HERC3-206ENST00000431413 CCL14Q16627 93 aa18.16■□□□□ 0.5
HERC3-206ENST00000431413 SBK1Q52WX2 424 aa18.16■□□□□ 0.5
HERC3-206ENST00000431413 ZNF287Q9HBT7 754 aa18.16■□□□□ 0.5
HERC3-206ENST00000431413 GOPCQ9HD26 462 aa18.16■□□□□ 0.5
HERC3-206ENST00000431413 HOXC6P09630 235 aa18.15■□□□□ 0.5
HERC3-206ENST00000431413 DSG3P32926 999 aa18.15■□□□□ 0.5
HERC3-206ENST00000431413 GRB14Q14449 540 aa18.15■□□□□ 0.5
HERC3-206ENST00000431413 TSHZ3Q63HK5 1081 aa18.15■□□□□ 0.5
HERC3-206ENST00000431413 SPICE1Q8N0Z3 855 aa18.15■□□□□ 0.5
HERC3-206ENST00000431413 SHCBP1Q8NEM2 672 aa18.15■□□□□ 0.5
HERC3-206ENST00000431413 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
HERC3-206ENST00000431413 SPATC1LQ9H0A9 340 aa18.15■□□□□ 0.5
HERC3-206ENST00000431413 C11orf49Q9H6J7 331 aa18.15■□□□□ 0.5
HERC3-206ENST00000431413 MKNK2Q9HBH9 465 aa18.15■□□□□ 0.5
HERC3-206ENST00000431413 SLC5A4Q9NY91 659 aa18.15■□□□□ 0.5
HERC3-206ENST00000431413 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa18.15■□□□□ 0.5
HERC3-206ENST00000431413 PLXNB2O15031 1838 aa18.14■□□□□ 0.5
HERC3-206ENST00000431413 GSG1L2A8MUP6 293 aa18.14■□□□□ 0.49
HERC3-206ENST00000431413 APPP05067 770 aa18.14■□□□□ 0.49
HERC3-206ENST00000431413 EEF2P13639 858 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
HERC3-206ENST00000431413 RRP1P56182 461 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
HERC3-206ENST00000431413 PLS1Q14651 629 aa18.14■□□□□ 0.49
HERC3-206ENST00000431413 DPP9Q86TI2 863 aa18.14■□□□□ 0.49
HERC3-206ENST00000431413 CLEC10AQ8IUN9 316 aa18.14■□□□□ 0.49
HERC3-206ENST00000431413 SIAH1Q8IUQ4 282 aa18.14■□□□□ 0.49
HERC3-206ENST00000431413 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
HERC3-206ENST00000431413 OSBP2Q969R2 916 aa18.14■□□□□ 0.49
HERC3-206ENST00000431413 MROH8Q9H579 483 aa18.14■□□□□ 0.49
HERC3-206ENST00000431413 MINDY4BA8MYZ0 360 aa18.13■□□□□ 0.49
HERC3-206ENST00000431413 GPAA1O43292 621 aa18.13■□□□□ 0.49
HERC3-206ENST00000431413 RAD21O60216 631 aa18.13■□□□□ 0.49
HERC3-206ENST00000431413 MSCO60682 206 aa18.13■□□□□ 0.49
HERC3-206ENST00000431413 TDO2P48775 406 aa18.13■□□□□ 0.49
HERC3-206ENST00000431413 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP18.13■□□□□ 0.49
HERC3-206ENST00000431413 NACAP1Q9BZK3 213 aa18.13■□□□□ 0.49
HERC3-206ENST00000431413 MYH7P12883 1935 aa18.13■□□□□ 0.49
HERC3-206ENST00000431413 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
HERC3-206ENST00000431413 SMIM22K7EJ46 135 aa18.12■□□□□ 0.49
HERC3-206ENST00000431413 ERCC3P19447 782 aa18.12■□□□□ 0.49
HERC3-206ENST00000431413 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
HERC3-206ENST00000431413 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa18.12■□□□□ 0.49
HERC3-206ENST00000431413 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
HERC3-206ENST00000431413 NCAPG2Q86XI2 1143 aa18.12■□□□□ 0.49
HERC3-206ENST00000431413 ATG4CQ96DT6 458 aa18.12■□□□□ 0.49
HERC3-206ENST00000431413 SLC25A27O95847 323 aa18.11■□□□□ 0.49
HERC3-206ENST00000431413 MX1P20591 662 aa18.11■□□□□ 0.49
HERC3-206ENST00000431413 ADORA2AP29274 412 aa18.11■□□□□ 0.49
HERC3-206ENST00000431413 CNGA1P29973 690 aa18.11■□□□□ 0.49
HERC3-206ENST00000431413 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
HERC3-206ENST00000431413 ABRAQ8N0Z2 381 aa18.11■□□□□ 0.49
HERC3-206ENST00000431413 FSD1Q9BTV5 496 aa18.11■□□□□ 0.49
HERC3-206ENST00000431413 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
HERC3-206ENST00000431413 MYH8P13535 1937 aa18.11■□□□□ 0.49
HERC3-206ENST00000431413 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
HERC3-206ENST00000431413 OLFML2BQ68BL8 750 aa18.1■□□□□ 0.49
HERC3-206ENST00000431413 LHX8Q68G74 356 aa18.1■□□□□ 0.49
HERC3-206ENST00000431413 NPLOC4Q8TAT6 608 aa18.1■□□□□ 0.49
HERC3-206ENST00000431413 FLRT1Q9NZU1 646 aa18.1■□□□□ 0.49
HERC3-206ENST00000431413 NYAP2Q9P242 653 aa18.1■□□□□ 0.49
HERC3-206ENST00000431413 ROBO3Q96MS0 1386 aa18.09■□□□□ 0.49
HERC3-206ENST00000431413 A0A1W2PPC1 479 aa18.09■□□□□ 0.49
HERC3-206ENST00000431413 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
HERC3-206ENST00000431413 FCER1AP12319 257 aa18.09■□□□□ 0.49
HERC3-206ENST00000431413 RASA1P20936 1047 aa18.09■□□□□ 0.49
HERC3-206ENST00000431413 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
HERC3-206ENST00000431413 C7orf61Q8IZ16 206 aa18.09■□□□□ 0.49
HERC3-206ENST00000431413 IFNL3Q8IZI9 196 aa18.09■□□□□ 0.49
HERC3-206ENST00000431413 STK11IPQ8N1F8 1099 aa18.09■□□□□ 0.49
HERC3-206ENST00000431413 PI4K2BQ8TCG2 481 aa18.09■□□□□ 0.49
HERC3-206ENST00000431413 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms