RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427658.1

AFG3L1P-208, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, human

TSL 2

Gene AFG3L1P, Length 2,758 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PYGB	P11216	843 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PFKFB1	P16118	471 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RBL2	Q08999	1139 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PNOC	Q13519	176 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SPECC1	Q5M775	1068 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	OLFM4	Q6UX06	510 aa		11.74	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	11.74	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ANP32D	O95626	131 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ATP6V1G2	O95670	118 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CDC27	P30260	824 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HHAT	Q5VTY9	493 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MCM10	Q7L590	875 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRIM58	Q8NG06	486 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EPAS1	Q99814	870 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	USP44	Q9H0E7	712 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SPTLC2	O15270	562 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PPP1R37	O75864	691 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FAM107A	O95990	144 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LINGO3	P0C6S8	592 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RANBP1	P43487	201 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NNT	Q13423	1086 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	XRCC4	Q13426	336 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PDIA5	Q14554	519 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NR1I3	Q14994	352 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NBPF14	Q5TI25	921 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CUL5	Q93034	780 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MRC1	P22897	1456 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NEFH	P12036	1026 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BMP6	P22004	513 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SCTR	P47872	440 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TBC1D5	Q92609	795 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BTG4	Q9NY30	223 aa		11.73	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KIF4A	O95239	1232 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZNF18	P17022	549 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MAGEA8	P43361	318 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	APBA1	Q02410	837 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SPATA21	Q7Z572	469 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZNF570	Q96NI8	536 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RGL1	Q9NZL6	768 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TEX33	O43247	280 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ATP2C2	O75185	946 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CMA1	P23946	247 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	POLA2	Q14181	598 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MFN1	Q8IWA4	741 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658		E7EVH7	732 aa		11.71	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	UPP2	O95045	317 aa		11.71	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		11.71	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		11.71	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		11.71	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PCDHGA4	Q9Y5G9	962 aa		11.71	□□□□□ -0.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		11.71	□□□□□ -0.54
AFG3L1P-208	ENST00000427658		H7C1W4	665 aa		11.71	□□□□□ -0.54
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CDKL5	O76039	1030 aa		11.71	□□□□□ -0.54
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRT14	P02533	472 aa		11.71	□□□□□ -0.54
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SYK	P43405	635 aa		11.71	□□□□□ -0.54
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EVI5L	Q96CN4	794 aa		11.71	□□□□□ -0.54
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RUFY1	Q96T51	708 aa		11.71	□□□□□ -0.54
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PICK1	Q9NRD5	415 aa		11.71	□□□□□ -0.54
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		11.71	□□□□□ -0.54
AFG3L1P-208	ENST00000427658		A0A0D9SFI3	127 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54

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