RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa19.76■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa19.76■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 AS3MTQ9HBK9 375 aa19.76■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 FZD1Q9UP38 647 aa19.76■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMX2Q9Y320 296 aa19.76■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 CSADQ9Y600 493 aa19.76■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 CPLX1O14810 134 aa19.75■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 CDKL5O76039 1030 aa19.75■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 PTPRAP18433 802 aa19.75■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 RXRAP19793 462 aa19.75■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa19.75■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 SNHG28P0DPA3 235 aa19.74■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 GNAQP50148 359 aa19.74■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 VGLL4Q14135 290 aa19.74■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 GRM4Q14833 912 aa19.74■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa19.74■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 WDR18Q9BV38 432 aa19.74■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 GOPCQ9HD26 462 aa19.74■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A1W2PRG0 241 aa19.73■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIF3CO14782 793 aa19.73■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 CDC27P30260 824 aa19.73■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 ADD1P35611 737 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 ASPRV1Q53RT3 343 aa19.73■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 F5H6K3 240 aa19.72■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 PDHBP11177 359 aa19.72■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 ECE1P42892 770 aa19.72■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 KLRC3Q07444 240 aa19.72■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 LDLRAD1Q5T700 205 aa19.72■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 ACER1Q8TDN7 264 aa19.72■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 DCAF4Q8WV16 495 aa19.72■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 GMCL1Q96IK5 515 aa19.72■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 LZTS2Q9BRK4 669 aa19.72■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa19.72■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF408Q9H9D4 720 aa19.72■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 SMC3Q9UQE7 1217 aa19.72■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa19.72■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 CELF2O95319 508 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 IFNAR1P17181 557 aa19.71■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 USP14P54578 494 aa19.71■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMTC3Q6ZXV5 915 aa19.71■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 C2orf69Q8N8R5 385 aa19.71■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa19.71■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF280CQ8ND82 737 aa19.71■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 SMC1BQ8NDV3 1235 aa19.71■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa19.71■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 VCPKMTQ9H867 229 aa19.71■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAD2L2Q9UI95 211 aa19.71■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZHX2Q9Y6X8 837 aa19.71■□□□□ 0.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 USP17L10C9JJH3 530 aa19.7■□□□□ 0.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 CTDNEP1O95476 244 aa19.7■□□□□ 0.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF543Q08ER8 600 aa19.7■□□□□ 0.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 NTRK3Q16288 839 aa19.7■□□□□ 0.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLFN13Q68D06 897 aa19.7■□□□□ 0.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 LPAR1Q92633 364 aa19.7■□□□□ 0.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 FEZ1Q99689 392 aa19.7■□□□□ 0.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 FOXD4L1Q9NU39 408 aa19.7■□□□□ 0.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 MTMR7Q9Y216 660 aa19.7■□□□□ 0.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIF3AQ9Y496 699 aa19.7■□□□□ 0.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 PTPDC1A2A3K4 754 aa19.7■□□□□ 0.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 NDUFB10O96000 172 aa19.7■□□□□ 0.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 YY1P25490 414 aa19.7■□□□□ 0.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 SMARCA1P28370 1054 aa19.7■□□□□ 0.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC1A4P43007 532 aa19.7■□□□□ 0.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 PPATQ06203 517 aa19.7■□□□□ 0.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP19.7■□□□□ 0.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 USP17L2Q6R6M4 530 aa19.7■□□□□ 0.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 MOB2Q70IA6 237 aa19.7■□□□□ 0.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 ERO1BQ86YB8 467 aa19.7■□□□□ 0.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 C19orf81C9J6K1 198 aa19.69■□□□□ 0.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 KLRF2D3W0D1 207 aa19.69■□□□□ 0.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 UBE2Q2LH0YL09 131 aa19.69■□□□□ 0.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 RAD21O60216 631 aa19.69■□□□□ 0.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 TOMM70O94826 608 aa19.69■□□□□ 0.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 BACE1P56817 501 aa19.69■□□□□ 0.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPP2Q13103 211 aa19.69■□□□□ 0.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRIM22Q8IYM9 498 aa19.69■□□□□ 0.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 STAG2Q8N3U4 1231 aa19.69■□□□□ 0.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa19.69■□□□□ 0.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPDYE5A6NIY4 337 aa19.68■□□□□ 0.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 PLEKHA8P1O95397 391 aa19.68■□□□□ 0.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 BMP3P12645 472 aa19.68■□□□□ 0.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 GJB2P29033 226 aa19.68■□□□□ 0.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms