RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417284.1

RGPD4-AS1-201, Transcript of RGPD4 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2

Gene RGPD4-AS1, Length 461 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 STAG1Q8WVM7 1258 aa6.25□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 AIDAQ96BJ3 306 aa6.25□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TIGD1Q96MW7 591 aa6.25□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MPHOSPH8Q99549 860 aa6.25□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NYXQ9GZU5 481 aa6.25□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SPTLC3Q9NUV7 552 aa6.25□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DACT1Q9NYF0 836 aa6.25□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa6.25□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ARAP2Q8WZ64 1704 aa6.25□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CPLX1O14810 134 aa6.24□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 JAK2O60674 1132 aa6.24□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TOM1O60784 492 aa6.24□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PPP6R2O75170 966 aa6.24□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ADCY5O95622 1261 aa6.24□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FGRP09769 529 aa6.24□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 USP17L8P0C7I0 530 aa6.24□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CMA1P23946 247 aa6.24□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP6.24□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 APOBRQ0VD83 1088 aa6.24□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CBLBQ13191 982 aa6.24□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 AGERQ15109 404 aa6.24□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 VPS72Q15906 364 aa6.24□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 STX1AQ16623 288 aa6.24□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SASS6Q6UVJ0 657 aa6.24□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa6.24□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa6.24□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LINC00301Q8NCQ3 95 aa6.24□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa6.24□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LRRN4Q8WUT4 740 aa6.24□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PIBF1Q8WXW3 757 aa6.24□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PGBD1Q96JS3 809 aa6.24□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 C8orf76Q96K31 380 aa6.24□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PRIMPOLQ96LW4 560 aa6.24□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ANO10Q9NW15 660 aa6.24□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa6.24□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MYH3P11055 1940 aa6.24□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NRAPQ86VF7 1730 aa6.24□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 AKAP11Q9UKA4 1901 aa6.23□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 BCL9LQ86UU0 1499 aa6.23□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa6.23□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KINO60870 393 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TUBB4AP04350 444 aa6.23□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FDPSP14324 419 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 IFNAR1P17181 557 aa6.23□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LIG1P18858 919 aa6.23□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GPTP24298 496 aa6.23□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PHKA1P46020 1223 aa6.23□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP6.23□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ANTXR2P58335 489 aa6.23□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MAP3K10Q02779 954 aa6.23□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 STK3Q13188 491 aa6.23□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SLC39A14Q15043 492 aa6.23□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TMEM132AQ24JP5 1023 aa6.23□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 AKNAD1Q5T1N1 836 aa6.23□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SUSD4Q5VX71 490 aa6.23□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 APOA5Q6Q788 366 aa6.23□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PLA2G4DQ86XP0 818 aa6.23□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 IFNL3Q8IZI9 196 aa6.23□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa6.23□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CHAMP1Q96JM3 812 aa6.23□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MAP3K14Q99558 947 aa6.23□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 BRIP1Q9BX63 1249 aa6.23□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ANKRD2Q9GZV1 360 aa6.23□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KCND1Q9NSA2 647 aa6.23□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DENND2AQ9ULE3 1009 aa6.23□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MRVI1Q9Y6F6 885 aa6.23□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa6.23□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LAMB2P55268 1798 aa6.23□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZNF532Q9HCE3 1301 aa6.23□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NUP98P52948 1817 aa6.22□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TIAM2Q8IVF5 1701 aa6.22□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GOLGA8BA8MQT2 603 aa6.22□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GSG1L2A8MUP6 293 aa6.22□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SOCS7O14512 581 aa6.22□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZBTB43O43298 467 aa6.22□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 IDH1O75874 414 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 BMP15O95972 392 aa6.22□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PTMAP06454 111 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CALM1P0DP23 149 aa6.22□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CALM2P0DP24 149 aa6.22□□□□□ -1.41
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CALM3P0DP25 149 aa6.22□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.6 ms