RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414154.6

SMIM19-201, Transcript of small integral membrane protein 19, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMIM19, Length 793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM19-201ENST00000414154 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
SMIM19-201ENST00000414154 GCC1Q96CN9 775 aa23.52■■□□□ 1.36
SMIM19-201ENST00000414154 DDRGK1Q96HY6 314 aa23.52■■□□□ 1.36
SMIM19-201ENST00000414154 DEFB118Q96PH6 123 aa23.52■■□□□ 1.36
SMIM19-201ENST00000414154 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
SMIM19-201ENST00000414154 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
SMIM19-201ENST00000414154 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SMIM19-201ENST00000414154 FOXP2O15409 715 aa23.51■■□□□ 1.35
SMIM19-201ENST00000414154 PDE1AP54750 535 aa23.51■■□□□ 1.35
SMIM19-201ENST00000414154 CCL14Q16627 93 aa23.51■■□□□ 1.35
SMIM19-201ENST00000414154 PLEKHH3Q7Z736 793 aa23.51■■□□□ 1.35
SMIM19-201ENST00000414154 NUDT12Q9BQG2 462 aa23.51■■□□□ 1.35
SMIM19-201ENST00000414154 FSD1Q9BTV5 496 aa23.51■■□□□ 1.35
SMIM19-201ENST00000414154 COG2Q14746 738 aa23.5■■□□□ 1.35
SMIM19-201ENST00000414154 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa23.5■■□□□ 1.35
SMIM19-201ENST00000414154 AMOTL1Q8IY63 956 aa23.5■■□□□ 1.35
SMIM19-201ENST00000414154 IFNL3Q8IZI9 196 aa23.5■■□□□ 1.35
SMIM19-201ENST00000414154 VCPKMTQ9H867 229 aa23.5■■□□□ 1.35
SMIM19-201ENST00000414154 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
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SMIM19-201ENST00000414154 NKX2-3Q8TAU0 364 aa23.49■■□□□ 1.35
SMIM19-201ENST00000414154 TANGO6Q9C0B7 1094 aa23.49■■□□□ 1.35
SMIM19-201ENST00000414154 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa23.49■■□□□ 1.35
SMIM19-201ENST00000414154 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa23.49■■□□□ 1.35
SMIM19-201ENST00000414154 APPP05067 770 aa23.48■■□□□ 1.35
SMIM19-201ENST00000414154 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
SMIM19-201ENST00000414154 DSG3P32926 999 aa23.48■■□□□ 1.35
SMIM19-201ENST00000414154 ATP2B2Q01814 1243 aa23.48■■□□□ 1.35
SMIM19-201ENST00000414154 SMC5Q8IY18 1101 aa23.48■■□□□ 1.35
SMIM19-201ENST00000414154 LNPKQ9C0E8 428 aa23.48■■□□□ 1.35
SMIM19-201ENST00000414154 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP23.48■■□□□ 1.35
SMIM19-201ENST00000414154 KANSL2Q9H9L4 492 aa23.48■■□□□ 1.35
SMIM19-201ENST00000414154 ROBO3Q96MS0 1386 aa23.48■■□□□ 1.35
SMIM19-201ENST00000414154 PARP14Q460N5 1801 aa23.47■■□□□ 1.35
SMIM19-201ENST00000414154 PRDM1O75626 825 aa23.47■■□□□ 1.35
SMIM19-201ENST00000414154 TFRCP02786 760 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SMIM19-201ENST00000414154 GNAT2P19087 354 aa23.47■■□□□ 1.35
SMIM19-201ENST00000414154 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa23.47■■□□□ 1.35
SMIM19-201ENST00000414154 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa23.47■■□□□ 1.35
SMIM19-201ENST00000414154 ATG4CQ96DT6 458 aa23.47■■□□□ 1.35
SMIM19-201ENST00000414154 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SMIM19-201ENST00000414154 FBXO28Q9NVF7 368 aa23.47■■□□□ 1.35
SMIM19-201ENST00000414154 HOXC10Q9NYD6 342 aa23.47■■□□□ 1.35
SMIM19-201ENST00000414154 FLRT1Q9NZU1 646 aa23.47■■□□□ 1.35
SMIM19-201ENST00000414154 TACC3Q9Y6A5 838 aa23.47■■□□□ 1.35
SMIM19-201ENST00000414154 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa23.46■■□□□ 1.35
SMIM19-201ENST00000414154 PTPREP23469 700 aa23.46■■□□□ 1.35
SMIM19-201ENST00000414154 TDO2P48775 406 aa23.46■■□□□ 1.35
SMIM19-201ENST00000414154 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
SMIM19-201ENST00000414154 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
SMIM19-201ENST00000414154 SOCS4Q8WXH5 440 aa23.46■■□□□ 1.35
SMIM19-201ENST00000414154 LPAR1Q92633 364 aa23.46■■□□□ 1.35
SMIM19-201ENST00000414154 MKNK2Q9HBH9 465 aa23.46■■□□□ 1.35
SMIM19-201ENST00000414154 INCENPQ9NQS7 918 aa23.46■■□□□ 1.35
SMIM19-201ENST00000414154 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
SMIM19-201ENST00000414154 RPTORQ8N122 1335 aa23.45■■□□□ 1.34
SMIM19-201ENST00000414154 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
SMIM19-201ENST00000414154 MAP2K5Q13163 448 aa23.45■■□□□ 1.34
SMIM19-201ENST00000414154 VPS53Q5VIR6 699 aa23.45■■□□□ 1.34
SMIM19-201ENST00000414154 NPLOC4Q8TAT6 608 aa23.45■■□□□ 1.34
SMIM19-201ENST00000414154 A0A0G2JMZ2 1700 aa23.45■■□□□ 1.34
SMIM19-201ENST00000414154 FLOT1O75955 427 aa23.44■■□□□ 1.34
SMIM19-201ENST00000414154 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
SMIM19-201ENST00000414154 RGS2P41220 211 aa23.44■■□□□ 1.34
SMIM19-201ENST00000414154 CCNA1P78396 465 aa23.44■■□□□ 1.34
SMIM19-201ENST00000414154 WDR78Q5VTH9 848 aa23.44■■□□□ 1.34
SMIM19-201ENST00000414154 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
SMIM19-201ENST00000414154 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SMIM19-201ENST00000414154 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
SMIM19-201ENST00000414154 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa23.44■■□□□ 1.34
SMIM19-201ENST00000414154 SLC15A5A6NIM6 579 aa23.43■■□□□ 1.34
SMIM19-201ENST00000414154 WDR46O15213 610 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SMIM19-201ENST00000414154 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SMIM19-201ENST00000414154 AAMPQ13685 434 aa23.43■■□□□ 1.34
SMIM19-201ENST00000414154 GRB14Q14449 540 aa23.43■■□□□ 1.34
SMIM19-201ENST00000414154 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SMIM19-201ENST00000414154 EVI5LQ96CN4 794 aa23.43■■□□□ 1.34
SMIM19-201ENST00000414154 FAM227BQ96M60 508 aa23.43■■□□□ 1.34
SMIM19-201ENST00000414154 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SMIM19-201ENST00000414154 SPATC1LQ9H0A9 340 aa23.43■■□□□ 1.34
SMIM19-201ENST00000414154 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SMIM19-201ENST00000414154 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SMIM19-201ENST00000414154 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SMIM19-201ENST00000414154 H0YGN5 161 aa23.42■■□□□ 1.34
SMIM19-201ENST00000414154 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
SMIM19-201ENST00000414154 TMEM132BQ14DG7 1078 aa23.42■■□□□ 1.34
SMIM19-201ENST00000414154 FAM83BQ5T0W9 1011 aa23.42■■□□□ 1.34
SMIM19-201ENST00000414154 APBA2Q99767 749 aa23.42■■□□□ 1.34
SMIM19-201ENST00000414154 SH2D4AQ9H788 454 aa23.42■■□□□ 1.34
SMIM19-201ENST00000414154 NYAP2Q9P242 653 aa23.42■■□□□ 1.34
SMIM19-201ENST00000414154 CLIP2Q9UDT6 1046 aa23.42■■□□□ 1.34
SMIM19-201ENST00000414154 IGHA2P01877 340 aa23.41■■□□□ 1.34
SMIM19-201ENST00000414154 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
SMIM19-201ENST00000414154 ERCC3P19447 782 aa23.41■■□□□ 1.34
SMIM19-201ENST00000414154 FAM47AQ5JRC9 791 aa23.41■■□□□ 1.34
SMIM19-201ENST00000414154 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa23.41■■□□□ 1.34
SMIM19-201ENST00000414154 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
SMIM19-201ENST00000414154 A0A0D9SFI3 127 aa23.4■■□□□ 1.34
SMIM19-201ENST00000414154 F5H6K3 240 aa23.4■■□□□ 1.34
SMIM19-201ENST00000414154 RAD21O60216 631 aa23.4■■□□□ 1.34
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