RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409006.3

KDELR3-202, Transcript of KDEL endoplasmic reticulum protein retention receptor 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene KDELR3, Length 931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3-202ENST00000409006 DDRGK1Q96HY6 314 aa27.02■■□□□ 1.92
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KDELR3-202ENST00000409006 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
KDELR3-202ENST00000409006 M0R2C6 588 aa27.01■■□□□ 1.91
KDELR3-202ENST00000409006 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa27.01■■□□□ 1.91
KDELR3-202ENST00000409006 SPICE1Q8N0Z3 855 aa27.01■■□□□ 1.91
KDELR3-202ENST00000409006 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
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KDELR3-202ENST00000409006 TMX2Q9Y320 296 aa27.01■■□□□ 1.91
KDELR3-202ENST00000409006 TTC41PQ6P2S7 1318 aa27■■□□□ 1.91
KDELR3-202ENST00000409006 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
KDELR3-202ENST00000409006 RGS2P41220 211 aa27■■□□□ 1.91
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KDELR3-202ENST00000409006 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa27■■□□□ 1.91
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KDELR3-202ENST00000409006 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
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KDELR3-202ENST00000409006 SBK1Q52WX2 424 aa26.99■■□□□ 1.91
KDELR3-202ENST00000409006 WDR78Q5VTH9 848 aa26.99■■□□□ 1.91
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KDELR3-202ENST00000409006 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP26.99■■□□□ 1.91
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KDELR3-202ENST00000409006 PTPREP23469 700 aa26.98■■□□□ 1.91
KDELR3-202ENST00000409006 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
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KDELR3-202ENST00000409006 APBA2Q99767 749 aa26.98■■□□□ 1.91
KDELR3-202ENST00000409006 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
KDELR3-202ENST00000409006 MYH4Q9Y623 1939 aa26.98■■□□□ 1.91
KDELR3-202ENST00000409006 MINDY4BA8MYZ0 360 aa26.97■■□□□ 1.91
KDELR3-202ENST00000409006 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
KDELR3-202ENST00000409006 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
KDELR3-202ENST00000409006 LPAR1Q92633 364 aa26.97■■□□□ 1.91
KDELR3-202ENST00000409006 HOXC10Q9NYD6 342 aa26.97■■□□□ 1.91
KDELR3-202ENST00000409006 FLRT1Q9NZU1 646 aa26.97■■□□□ 1.91
KDELR3-202ENST00000409006 SALL3Q9BXA9 1300 aa26.96■■□□□ 1.91
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KDELR3-202ENST00000409006 DSG3P32926 999 aa26.96■■□□□ 1.91
KDELR3-202ENST00000409006 ATP2B2Q01814 1243 aa26.96■■□□□ 1.91
KDELR3-202ENST00000409006 GIMAP6Q6P9H5 292 aa26.96■■□□□ 1.91
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KDELR3-202ENST00000409006 MX1P20591 662 aa26.95■■□□□ 1.9
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KDELR3-202ENST00000409006 NPLOC4Q8TAT6 608 aa26.94■■□□□ 1.9
KDELR3-202ENST00000409006 SPATC1LQ9H0A9 340 aa26.94■■□□□ 1.9
KDELR3-202ENST00000409006 OGDHLQ9ULD0 1010 aa26.94■■□□□ 1.9
KDELR3-202ENST00000409006 ZNF236Q9UL36 1845 aa26.94■■□□□ 1.9
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KDELR3-202ENST00000409006 NECAB2Q7Z6G3 386 aa26.92■■□□□ 1.9
KDELR3-202ENST00000409006 IFNL3Q8IZI9 196 aa26.92■■□□□ 1.9
KDELR3-202ENST00000409006 ANKLE1Q8NAG6 615 aa26.92■■□□□ 1.9
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KDELR3-202ENST00000409006 FBXO28Q9NVF7 368 aa26.92■■□□□ 1.9
KDELR3-202ENST00000409006 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa26.92■■□□□ 1.9
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KDELR3-202ENST00000409006 GNAT2P19087 354 aa26.91■■□□□ 1.9
KDELR3-202ENST00000409006 ERCC3P19447 782 aa26.91■■□□□ 1.9
KDELR3-202ENST00000409006 TDO2P48775 406 aa26.91■■□□□ 1.9
KDELR3-202ENST00000409006 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa26.91■■□□□ 1.9
KDELR3-202ENST00000409006 LHX8Q68G74 356 aa26.91■■□□□ 1.9
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KDELR3-202ENST00000409006 MKNK2Q9HBH9 465 aa26.91■■□□□ 1.9
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KDELR3-202ENST00000409006 PLS1Q14651 629 aa26.9■■□□□ 1.9
KDELR3-202ENST00000409006 IGHA2P01877 340 aa26.89■■□□□ 1.9
KDELR3-202ENST00000409006 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
KDELR3-202ENST00000409006 TMEM132BQ14DG7 1078 aa26.89■■□□□ 1.9
KDELR3-202ENST00000409006 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
KDELR3-202ENST00000409006 MB21D1Q8N884 522 aa26.89■■□□□ 1.9
KDELR3-202ENST00000409006 SHCBP1Q8NEM2 672 aa26.89■■□□□ 1.9
KDELR3-202ENST00000409006 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa26.89■■□□□ 1.9
KDELR3-202ENST00000409006 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa26.89■■□□□ 1.89
KDELR3-202ENST00000409006 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa26.88■■□□□ 1.89
KDELR3-202ENST00000409006 RAD21O60216 631 aa26.88■■□□□ 1.89
KDELR3-202ENST00000409006 EVI5O60447 810 aa26.88■■□□□ 1.89
KDELR3-202ENST00000409006 ADORA2AP29274 412 aa26.88■■□□□ 1.89
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