RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393503.2

CNGA3-202, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene CNGA3, Length 569 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-202ENST00000393503 KIF1BPQ96EK5 621 aa16.11■□□□□ 0.17
CNGA3-202ENST00000393503 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
CNGA3-202ENST00000393503 BCL11AQ9H165 835 aa16.11■□□□□ 0.17
CNGA3-202ENST00000393503 CABP5Q9NP86 173 aa16.11■□□□□ 0.17
CNGA3-202ENST00000393503 CUL9Q8IWT3 2517 aa16.1■□□□□ 0.17
CNGA3-202ENST00000393503 MBD4O95243 580 aa16.1■□□□□ 0.17
CNGA3-202ENST00000393503 CYBAP13498 195 aa16.1■□□□□ 0.17
CNGA3-202ENST00000393503 ADD2P35612 726 aa16.1■□□□□ 0.17
CNGA3-202ENST00000393503 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
CNGA3-202ENST00000393503 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
CNGA3-202ENST00000393503 BOLA2Q9H3K6 86 aa16.1■□□□□ 0.17
CNGA3-202ENST00000393503 UNC80Q8N2C7 3258 aa16.09■□□□□ 0.17
CNGA3-202ENST00000393503 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
CNGA3-202ENST00000393503 ADORA2AP29274 412 aa16.09■□□□□ 0.17
CNGA3-202ENST00000393503 CCNA1P78396 465 aa16.09■□□□□ 0.17
CNGA3-202ENST00000393503 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa16.09■□□□□ 0.17
CNGA3-202ENST00000393503 C20orf194Q5TEA3 1177 aa16.09■□□□□ 0.17
CNGA3-202ENST00000393503 SPICE1Q8N0Z3 855 aa16.09■□□□□ 0.17
CNGA3-202ENST00000393503 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
CNGA3-202ENST00000393503 PAG1Q9NWQ8 432 aa16.09■□□□□ 0.17
CNGA3-202ENST00000393503 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
CNGA3-202ENST00000393503 ZNF236Q9UL36 1845 aa16.09■□□□□ 0.17
CNGA3-202ENST00000393503 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
CNGA3-202ENST00000393503 PARP14Q460N5 1801 aa16.08■□□□□ 0.17
CNGA3-202ENST00000393503 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 ERCC3P19447 782 aa16.08■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 COG2Q14746 738 aa16.08■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 LRIT3Q3SXY7 679 aa16.08■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 MFSD14CQ5VZR4 134 aa16.08■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 TDHQ8IZJ6 230 aa16.08■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 ATG4CQ96DT6 458 aa16.08■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 SPATC1LQ9H0A9 340 aa16.08■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 ATP5JP18859 108 aa16.07■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 DSG3P32926 999 aa16.07■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 ATP2B2Q01814 1243 aa16.07■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 C12orf60Q5U649 245 aa16.07■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 ANO1Q5XXA6 986 aa16.07■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 TMEM179Q6ZVK1 233 aa16.07■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 HAUS7Q99871 368 aa16.07■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP16.07■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 TANGO6Q9C0B7 1094 aa16.07■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 FBXO28Q9NVF7 368 aa16.07■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 TMX2Q9Y320 296 aa16.07■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 EYSQ5T1H1 3165 aa16.06■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 USP17L12C9JPN9 530 aa16.06■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 USP17L21D6R901 530 aa16.06■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 CDK8P49336 464 aa16.06■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa16.06■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 DEFB123Q8N688 67 aa16.06■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 LPAR1Q92633 364 aa16.06■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 CNGA1P29973 690 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 ICA1Q05084 483 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 TMEM132BQ14DG7 1078 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 OLFML2BQ68BL8 750 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 SHCBP1Q8NEM2 672 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 VCPKMTQ9H867 229 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 MTMR10Q9NXD2 777 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 HOXC10Q9NYD6 342 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 SWAP70Q9UH65 585 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 DDX19BQ9UMR2 479 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa16.05■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 RAB11FIP3O75154 756 aa16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 EEF2P13639 858 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 GPR153Q6NV75 609 aa16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 CTR9Q6PD62 1173 aa16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 C16orf86Q6ZW13 317 aa16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 REPS2Q8NFH8 660 aa16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 CDH23Q9H251 3354 aa16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 LTBP2Q14767 1821 aa16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 DNM1LO00429 736 aa16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 HMMRO75330 724 aa16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 FLOT1O75955 427 aa16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 RTP1P59025 263 aa16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 UBE3CQ15386 1083 aa16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 DPP9Q86TI2 863 aa16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 STRNO43815 780 aa16.02■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 PGK2P07205 417 aa16.02■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 PLS1Q14651 629 aa16.02■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 TSHZ3Q63HK5 1081 aa16.02■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 SLC17A8Q8NDX2 589 aa16.02■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 MAML3Q96JK9 1138 aa16.02■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa16.02■□□□□ 0.16
CNGA3-202ENST00000393503 MYH8P13535 1937 aa16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46 ms