RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376392.10

NME1-NME2-201, Transcript of NME1-NME2 readthrough, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NME1-NME2, Length 894 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1-NME2-201ENST00000376392 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 UBE2Q2LH0YL09 131 aa14.97□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 CAVIN2O95810 425 aa14.97□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 CMA1P23946 247 aa14.97□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 SMARCA1P28370 1054 aa14.97□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 NLRP5P59047 1200 aa14.97□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 CAMK4Q16566 473 aa14.97□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 NIM1KQ8IY84 436 aa14.97□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 CEP95Q96GE4 821 aa14.97□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 FUCA2Q9BTY2 467 aa14.97□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 SPZ1Q9BXG8 430 aa14.97□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 MTFR1LQ9H019 292 aa14.97□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa14.97□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 KCNQ5Q9NR82 932 aa14.97□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 PIM2Q9P1W9 311 aa14.97□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 MAD2L2Q9UI95 211 aa14.97□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 SIPA1L1O43166 1804 aa14.96□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 ENTPD3O75355 529 aa14.96□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 NOVP48745 357 aa14.96□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 TYRO3Q06418 890 aa14.96□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 PTPAQ15257 358 aa14.96□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 GALNT17Q6IS24 598 aa14.96□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 RNF214Q8ND24 703 aa14.96□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 ENGASEQ8NFI3 743 aa14.96□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 PPP1R9BQ96SB3 815 aa14.96□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 PI4KBQ9UBF8 816 aa14.96□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa14.95□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa14.95□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 TRIM75PA6NK02 468 aa14.95□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 TTLL1O95922 423 aa14.95□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 NR5A1Q13285 461 aa14.95□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 CFAP100Q494V2 611 aa14.95□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 ASPRV1Q53RT3 343 aa14.95□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 MTMR4Q9NYA4 1195 aa14.95□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa14.94□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 YDJCA8MPS7 323 aa14.94□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 KLRF2D3W0D1 207 aa14.94□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 hCG_1984214I3L0E3 225 aa14.94□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 AKR1B1P15121 316 aa14.94□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 KCNA3P22001 575 aa14.94□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 SHMT1P34896 483 aa14.94□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 TRAPPC10P48553 1259 aa14.94□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 CKAP2LQ8IYA6 745 aa14.94□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 STAG2Q8N3U4 1231 aa14.94□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 OGFOD1Q8N543 542 aa14.94□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 OXER1Q8TDS5 423 aa14.94□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 TIGD1Q96MW7 591 aa14.94□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 SDF4Q9BRK5 362 aa14.94□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 CABP5Q9NP86 173 aa14.94□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 FAM13BQ9NYF5 915 aa14.94□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 MTMR7Q9Y216 660 aa14.94□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 A0A1B0GVL5 298 aa14.93□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZBTB7AO95365 584 aa14.93□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 VIL1P09327 827 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 PFKFB1P16118 471 aa14.93□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 NFIAQ12857 509 aa14.93□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 STX1AQ16623 288 aa14.93□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 BLIDQ8IZY5 108 aa14.93□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 FAM200AQ8TCP9 573 aa14.93□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZNRF3Q9ULT6 936 aa14.93□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 PCDHA4Q9UN74 947 aa14.93□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa14.93□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 ATRNL1Q5VV63 1379 aa14.93□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa14.92□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 SYKP43405 635 aa14.92□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 MMP14P50281 582 aa14.92□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 NDUFA8P51970 172 aa14.92□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 TCP10Q12799 353 aa14.92□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 DLGAP5Q15398 846 aa14.92□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 RESP18Q5W5W9 173 aa14.92□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa14.92□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 DAGLBQ8NCG7 672 aa14.92□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 AGBL3Q8NEM8 1001 aa14.92□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 PIBF1Q8WXW3 757 aa14.92□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 CCDC34Q96HJ3 373 aa14.92□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 FAM198AQ9UFP1 575 aa14.92□□□□□ -0.02
NME1-NME2-201ENST00000376392 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms