RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368210.7

PTPRK-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRK, Length 5,025 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-204ENST00000368210 CETN3O15182 167 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 DBN1Q16643 649 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 EFCAB13Q8IY85 973 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 BLIDQ8IZY5 108 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 RTEL1Q9NZ71 1219 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 TMTC1Q8IUR5 882 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 STK32BQ9NY57 414 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 PKD2L1Q9P0L9 805 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 CLIC4Q9Y696 253 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 ZEB2O60315 1214 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 PCP11498 1178 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 ALDH1B1P30837 517 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 NDUFA8P51970 172 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 DYMQ7RTS9 669 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 LMTK2Q8IWU2 1503 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 LRRC7Q96NW7 1537 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 ABCA9Q8IUA7 1624 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 A0A1W2PQ27 194 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 A0A1W2PQ64 194 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 A0A1W2PQD8 194 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 ERVV-1B6SEH8 477 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 CHMP2AO43633 222 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 SCG2P13521 617 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 ATP2B4P23634 1241 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 EPHA10Q5JZY3 1008 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 CEP85LQ5SZL2 805 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 NBPF14Q5TI25 921 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 NELFBQ8WX92 580 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 TSGA10Q9BZW7 698 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 USP40Q9NVE5 1235 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 ZNF804BA4D1E1 1349 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 B4DLN1 442 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 EPB41P11171 864 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 TERF2Q15554 542 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 BACH1O14867 736 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 LARGE1O95461 756 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 NUP58Q9BVL2 599 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 CARMIL3Q8ND23 1372 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 SP4Q02446 784 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 CLIC6Q96NY7 704 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 LARGE2Q8N3Y3 721 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 TEKT1Q969V4 418 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 PEX19P40855 299 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 DDAH1O94760 285 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 ACTN2P35609 894 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 SH2D4BQ5SQS7 431 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 NCAPH2Q6IBW4 605 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 SYNCQ9H7C4 482 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 TULP4Q9NRJ4 1543 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 KLRF2D3W0D1 207 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 SLC39A14Q15043 492 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 VCXQ9H320 206 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 USP31Q70CQ4 1352 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 SEMA3EO15041 775 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 SLC8A1P32418 973 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 PCK1P35558 622 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 VAV2P52735 878 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 BRINP3Q76B58 766 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 VWA3BQ502W6 1294 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 SEPT14Q6ZU15 432 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 RGS22Q8NE09 1264 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 TTLL11Q8NHH1 800 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 CEP63Q96MT8 703 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 RASAL2Q9UJF2 1139 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 E2F4Q16254 413 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 CCDC155Q8N6L0 562 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 CARD6Q9BX69 1037 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 FAM184BQ9ULE4 1060 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 DNM3Q9UQ16 869 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 CEP152O94986 1710 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 ERCC3P19447 782 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 CPLX4Q7Z7G2 160 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 CCDC160A6NGH7 325 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 INF2Q27J81 1249 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 USH1GQ495M9 461 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 TRIML1Q8N9V2 468 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 LRMPQ12912 555 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 ZNF827Q17R98 1081 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-204ENST00000368210 POLR3EQ9NVU0 708 aa14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms