RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 RLBP1P12271 317 aa3.16□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 APOBRQ0VD83 1088 aa3.16□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 MPP2Q14168 576 aa3.16□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 MLC1Q15049 377 aa3.16□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC93Q567U6 631 aa3.16□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF687Q8N1G0 1237 aa3.16□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 TMC1Q8TDI8 760 aa3.16□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 LRCH3Q96II8 777 aa3.16□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 ARHGEF4Q9NR80 690 aa3.16□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 KLK14Q9P0G3 267 aa3.16□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 SUSD2Q9UGT4 822 aa3.16□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 TULP4Q9NRJ4 1543 aa3.16□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 DISP2A7MBM2 1401 aa3.16□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 CEP162Q5TB80 1403 aa3.16□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa3.16□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 SIAH2O43255 324 aa3.16□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 MZT2AQ6P582 158 aa3.16□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 ERP27Q96DN0 273 aa3.16□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 GUCY2FP51841 1108 aa3.15□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 AGERQ15109 404 aa3.15□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 LONRF1Q17RB8 773 aa3.15□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 GRAMD1BQ3KR37 738 aa3.15□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 RINLQ6ZS11 566 aa3.15□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 FAM9BQ8IZU0 186 aa3.15□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 NKD1Q969G9 470 aa3.15□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 AIFM3Q96NN9 605 aa3.15□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 SLC26A8Q96RN1 970 aa3.15□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 PRR14Q9BWN1 585 aa3.15□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa3.15□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 DCCP43146 1447 aa3.15□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 NFKBIEO00221 500 aa3.15□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 TCEA3O75764 348 aa3.15□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 VDRP11473 427 aa3.15□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP3.15□□□□□ -1.913e-6■□□□□ 8.2
CCSAP-202ENST00000366686 FXNQ16595 210 aa3.15□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 SCARA3Q6AZY7 606 aa3.15□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 MORC1Q86VD1 984 aa3.15□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 CABP1Q9NZU7 370 aa3.15□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 KIF27Q86VH2 1401 aa3.15□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 LTBP3Q9NS15 1303 aa3.15□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 DLC1Q96QB1 1528 aa3.15□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 B2RBV5 119 aa3.15□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 TK2O00142 265 aa3.15□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 USP14P54578 494 aa3.15□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 NFKB2Q00653 900 aa3.15□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 GFOD2Q3B7J2 385 aa3.15□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 SLC10A6Q3KNW5 377 aa3.15□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 MENTQ9BUN1 341 aa3.15□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 EPN3Q9H201 632 aa3.15□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 MCM8Q9UJA3 840 aa3.15□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa3.15□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 LOC285556D6RIA3 1793 aa3.15□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 VCANP13611 3396 aa3.15□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 EREGO14944 169 aa3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 F13A1P00488 732 aa3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 LMNB1P20700 586 aa3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 SKOR1P84550 965 aa3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 CREB3L3Q68CJ9 461 aa3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 FAM178BQ8IXR5 827 aa3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 MYRIPQ8NFW9 859 aa3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 GAL3ST3Q96A11 431 aa3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 INTUQ9ULD6 942 aa3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 SCN7AQ01118 1682 aa3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 LTBP1Q14766 1721 aa3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 UBR2Q8IWV8 1755 aa3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 SOWAHBA6NEL2 793 aa3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 SOX5P35711 763 aa3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 TXLNAP40222 546 aa3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 EIF6P56537 245 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 SYDE2Q5VT97 1194 aa3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 RELL1Q8IUW5 271 aa3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 C1orf127Q8N9H9 656 aa3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 SPSB2Q99619 263 aa3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 RUSC1Q9BVN2 902 aa3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 GSX2Q9BZM3 304 aa3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 RSAD1Q9HA92 442 aa3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 ANLNQ9NQW6 1124 aa3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 DISC1Q9NRI5 854 aa3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 SERTAD1Q9UHV2 236 aa3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 SERTM1A2A2V5 107 aa3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 TGFBR3LH3BV60 316 aa3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 PAGE1O75459 146 aa3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 EPB42P16452 691 aa3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 PBX2P40425 430 aa3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 LHX8Q68G74 356 aa3.14□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms