RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364043.1

SNORD46-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 46, humanhuman

BASIC

Gene SNORD46, Length 104 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD46-201ENST00000364043 ATP2B2Q01814 1243 aa9.43□□□□□ -0.9
SNORD46-201ENST00000364043 MAP3K10Q02779 954 aa9.43□□□□□ -0.9
SNORD46-201ENST00000364043 FAAP100Q0VG06 881 aa9.43□□□□□ -0.9
SNORD46-201ENST00000364043 NFIAQ12857 509 aa9.43□□□□□ -0.9
SNORD46-201ENST00000364043 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
SNORD46-201ENST00000364043 LRRC41Q15345 812 aa9.43□□□□□ -0.9
SNORD46-201ENST00000364043 G2E3Q7L622 706 aa9.43□□□□□ -0.9
SNORD46-201ENST00000364043 TMEM199Q8N511 208 aa9.43□□□□□ -0.9
SNORD46-201ENST00000364043 MEIS3Q99687 375 aa9.43□□□□□ -0.9
SNORD46-201ENST00000364043 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP9.43□□□□□ -0.9
SNORD46-201ENST00000364043 TBX21Q9UL17 535 aa9.43□□□□□ -0.9
SNORD46-201ENST00000364043 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa9.43□□□□□ -0.9
SNORD46-201ENST00000364043 FASNP49327 2511 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
SNORD46-201ENST00000364043 SOWAHBA6NEL2 793 aa9.42□□□□□ -0.9
SNORD46-201ENST00000364043 SEPT4O43236 478 aa9.42□□□□□ -0.9
SNORD46-201ENST00000364043 DDX58O95786 925 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
SNORD46-201ENST00000364043 IGHA2P01877 340 aa9.42□□□□□ -0.9
SNORD46-201ENST00000364043 HMGCS2P54868 508 aa9.42□□□□□ -0.9
SNORD46-201ENST00000364043 HERVK_113P62684 666 aa9.42□□□□□ -0.9
SNORD46-201ENST00000364043 ERVK-9P63128 1117 aa9.42□□□□□ -0.9
SNORD46-201ENST00000364043 ERVK-24P63145 666 aa9.42□□□□□ -0.9
SNORD46-201ENST00000364043 SPP2Q13103 211 aa9.42□□□□□ -0.9
SNORD46-201ENST00000364043 EPHA10Q5JZY3 1008 aa9.42□□□□□ -0.9
SNORD46-201ENST00000364043 ZNF280CQ8ND82 737 aa9.42□□□□□ -0.9
SNORD46-201ENST00000364043 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
SNORD46-201ENST00000364043 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
SNORD46-201ENST00000364043 GBF1Q92538 1859 aa9.42□□□□□ -0.9
SNORD46-201ENST00000364043 SLC15A5A6NIM6 579 aa9.41□□□□□ -0.9
SNORD46-201ENST00000364043 GNAI2P04899 355 aa9.41□□□□□ -0.9
SNORD46-201ENST00000364043 IGKV5-2P06315 115 aa9.41□□□□□ -0.9
SNORD46-201ENST00000364043 IL9P15248 144 aa9.41□□□□□ -0.9
SNORD46-201ENST00000364043 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
SNORD46-201ENST00000364043 RBM25P49756 843 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
SNORD46-201ENST00000364043 UBE4AQ14139 1066 aa9.41□□□□□ -0.9
SNORD46-201ENST00000364043 LEXMQ3ZCV2 418 aa9.41□□□□□ -0.9
SNORD46-201ENST00000364043 SH3D19Q5HYK7 790 aa9.41□□□□□ -0.9
SNORD46-201ENST00000364043 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa9.41□□□□□ -0.9
SNORD46-201ENST00000364043 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
SNORD46-201ENST00000364043 C22orf23Q9BZE7 217 aa9.41□□□□□ -0.9
SNORD46-201ENST00000364043 RBPJLQ9UBG7 517 aa9.41□□□□□ -0.9
SNORD46-201ENST00000364043 FAM198AQ9UFP1 575 aa9.41□□□□□ -0.9
SNORD46-201ENST00000364043 FAM208BQ5VWN6 2430 aa9.41□□□□□ -0.9
SNORD46-201ENST00000364043 TECTAO75443 2155 aa9.4□□□□□ -0.9
SNORD46-201ENST00000364043 PROB1E7EW31 1015 aa9.4□□□□□ -0.9
SNORD46-201ENST00000364043 H7C1W4 665 aa9.4□□□□□ -0.9
SNORD46-201ENST00000364043 APBB1O00213 710 aa9.4□□□□□ -0.9
SNORD46-201ENST00000364043 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
SNORD46-201ENST00000364043 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
SNORD46-201ENST00000364043 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa9.4□□□□□ -0.9
SNORD46-201ENST00000364043 ASCL5Q7RTU5 278 aa9.4□□□□□ -0.9
SNORD46-201ENST00000364043 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa9.4□□□□□ -0.9
SNORD46-201ENST00000364043 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa9.4□□□□□ -0.9
SNORD46-201ENST00000364043 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
SNORD46-201ENST00000364043 NPLOC4Q8TAT6 608 aa9.4□□□□□ -0.9
SNORD46-201ENST00000364043 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
SNORD46-201ENST00000364043 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
SNORD46-201ENST00000364043 MROH7Q68CQ1 1323 aa9.39□□□□□ -0.91
SNORD46-201ENST00000364043 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
SNORD46-201ENST00000364043 A0A1W2PQY0 241 aa9.39□□□□□ -0.91
SNORD46-201ENST00000364043 F6X3S4 739 aa9.39□□□□□ -0.91
SNORD46-201ENST00000364043 ENTPD3O75355 529 aa9.39□□□□□ -0.91
SNORD46-201ENST00000364043 CCNA1P78396 465 aa9.39□□□□□ -0.91
SNORD46-201ENST00000364043 NEXNQ0ZGT2 675 aa9.39□□□□□ -0.91
SNORD46-201ENST00000364043 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
SNORD46-201ENST00000364043 TTC22Q5TAA0 569 aa9.39□□□□□ -0.91
SNORD46-201ENST00000364043 OLFML2BQ68BL8 750 aa9.39□□□□□ -0.91
SNORD46-201ENST00000364043 OTOP2Q7RTS6 562 aa9.39□□□□□ -0.91
SNORD46-201ENST00000364043 PAGR1Q9BTK6 254 aa9.39□□□□□ -0.91
SNORD46-201ENST00000364043 OSBPL3Q9H4L5 887 aa9.39□□□□□ -0.91
SNORD46-201ENST00000364043 IL23AQ9NPF7 189 aa9.39□□□□□ -0.91
SNORD46-201ENST00000364043 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
SNORD46-201ENST00000364043 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa9.39□□□□□ -0.91
SNORD46-201ENST00000364043 TRIOO75962 3097 aa9.38□□□□□ -0.91
SNORD46-201ENST00000364043 MYO15AQ9UKN7 3530 aa9.38□□□□□ -0.91
SNORD46-201ENST00000364043 CDC45O75419 566 aa9.38□□□□□ -0.91
SNORD46-201ENST00000364043 FGBP02675 491 aa9.38□□□□□ -0.91
SNORD46-201ENST00000364043 PTPREP23469 700 aa9.38□□□□□ -0.91
SNORD46-201ENST00000364043 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
SNORD46-201ENST00000364043 ATP8B2P98198 1209 aa9.38□□□□□ -0.91
SNORD46-201ENST00000364043 GRB14Q14449 540 aa9.38□□□□□ -0.91
SNORD46-201ENST00000364043 FAM47AQ5JRC9 791 aa9.38□□□□□ -0.91
SNORD46-201ENST00000364043 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa9.38□□□□□ -0.91
SNORD46-201ENST00000364043 WDR78Q5VTH9 848 aa9.38□□□□□ -0.91
SNORD46-201ENST00000364043 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
SNORD46-201ENST00000364043 SLC4A10Q6U841 1118 aa9.38□□□□□ -0.91
SNORD46-201ENST00000364043 RNF180Q86T96 592 aa9.38□□□□□ -0.91
SNORD46-201ENST00000364043 VPS37DQ86XT2 251 aa9.38□□□□□ -0.91
SNORD46-201ENST00000364043 ARNTL2Q8WYA1 636 aa9.38□□□□□ -0.91
SNORD46-201ENST00000364043 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
SNORD46-201ENST00000364043 LMCD1Q9NZU5 365 aa9.38□□□□□ -0.91
SNORD46-201ENST00000364043 TRPC6Q9Y210 931 aa9.38□□□□□ -0.91
SNORD46-201ENST00000364043 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa9.38□□□□□ -0.91
SNORD46-201ENST00000364043 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa9.38□□□□□ -0.91
SNORD46-201ENST00000364043 GPR179Q6PRD1 2367 aa9.38□□□□□ -0.91
SNORD46-201ENST00000364043 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
SNORD46-201ENST00000364043 ZNF536O15090 1300 aa9.37□□□□□ -0.91
SNORD46-201ENST00000364043 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
SNORD46-201ENST00000364043 NEURL1BA8MQ27 555 aa9.37□□□□□ -0.91
SNORD46-201ENST00000364043 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
SNORD46-201ENST00000364043 CA3P07451 260 aa9.37□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms