RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 GYG1P46976 350 aa25.61■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 SIK1P57059 783 aa25.61■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 E2F4Q16254 413 aa25.61■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 IGSF22Q8N9C0 903 aa25.61■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa25.61■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 PLA2G4AP47712 749 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 ITPK1Q13572 414 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 PPFIBP1Q86W92 1011 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 RABGGTAQ92696 567 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 ADGRG1Q9Y653 693 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 MFAP3LO75121 409 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 CTR9Q6PD62 1173 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF384Q8TF68 577 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 DESI2Q9BSY9 194 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF652Q9Y2D9 606 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 RBL2Q08999 1139 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 FILIP1LQ4L180 1135 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 XDHP47989 1333 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 SOWAHDA6NJG2 315 aa25.58■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 CAVIN4Q5BKX8 364 aa25.58■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 TAF3Q5VWG9 929 aa25.58■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 RAD9BQ6WBX8 426 aa25.58■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 CNGA4Q8IV77 575 aa25.58■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 UBXN6Q9BZV1 441 aa25.58■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa25.58■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 PTGDRQ13258 359 aa25.58■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 MTF1Q14872 753 aa25.58■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 CLEC4GQ6UXB4 293 aa25.58■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 RASGRP2Q7LDG7 609 aa25.58■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 IQUBQ8NA54 791 aa25.58■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 ST7Q9NRC1 585 aa25.58■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 LRRC10BA6NIK2 292 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD1-201ENST00000331462 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF174Q15697 407 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD1-201ENST00000331462 KLHL10Q6JEL2 608 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD1-201ENST00000331462 PDXDC2PQ6P474 469 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD1-201ENST00000331462 MAST2Q6P0Q8 1798 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD1-201ENST00000331462 CASZ1Q86V15 1759 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD1-201ENST00000331462 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXD1-201ENST00000331462 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
HOXD1-201ENST00000331462 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
HOXD1-201ENST00000331462 GOLGA1Q92805 767 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXD1-201ENST00000331462 CASP1P29466 404 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXD1-201ENST00000331462 STX17P56962 302 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXD1-201ENST00000331462 TUBB2AQ13885 445 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXD1-201ENST00000331462 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
HOXD1-201ENST00000331462 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
HOXD1-201ENST00000331462 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
HOXD1-201ENST00000331462 TUBB2BQ9BVA1 445 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXD1-201ENST00000331462 RWDD2AQ9UIY3 292 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF831Q5JPB2 1677 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXD1-201ENST00000331462 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXD1-201ENST00000331462 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
HOXD1-201ENST00000331462 SCG2P13521 617 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXD1-201ENST00000331462 SPAG1Q07617 926 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXD1-201ENST00000331462 KARSQ15046 597 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
HOXD1-201ENST00000331462 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
HOXD1-201ENST00000331462 GYPCP04921 128 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXD1-201ENST00000331462 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
HOXD1-201ENST00000331462 FBXO33Q7Z6M2 555 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXD1-201ENST00000331462 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
HOXD1-201ENST00000331462 MINPP1Q9UNW1 487 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXD1-201ENST00000331462 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
HOXD1-201ENST00000331462 USP17L12C9JPN9 530 aa25.54■■□□□ 1.68
HOXD1-201ENST00000331462 USP17L21D6R901 530 aa25.54■■□□□ 1.68
HOXD1-201ENST00000331462 TBC1D8O95759 1140 aa25.54■■□□□ 1.68
HOXD1-201ENST00000331462 NT5C2P49902 561 aa25.54■■□□□ 1.68
HOXD1-201ENST00000331462 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
HOXD1-201ENST00000331462 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
HOXD1-201ENST00000331462 CTNND2Q9UQB3 1225 aa25.54■■□□□ 1.68
HOXD1-201ENST00000331462 NRAPQ86VF7 1730 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXD1-201ENST00000331462 ZBTB22O15209 634 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXD1-201ENST00000331462 RGL2O15211 777 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXD1-201ENST00000331462 TRIM14Q14142 442 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXD1-201ENST00000331462 SBK1Q52WX2 424 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXD1-201ENST00000331462 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXD1-201ENST00000331462 KIF5CO60282 957 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXD1-201ENST00000331462 TEX35Q5T0J7 233 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXD1-201ENST00000331462 C3orf67Q6ZVT6 689 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXD1-201ENST00000331462 RMND1Q9NWS8 449 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXD1-201ENST00000331462 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
HOXD1-201ENST00000331462 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
HOXD1-201ENST00000331462 CASP14P31944 242 aa25.52■■□□□ 1.68
HOXD1-201ENST00000331462 KRT31Q15323 416 aa25.52■■□□□ 1.68
HOXD1-201ENST00000331462 DDB1Q16531 1140 aa25.52■■□□□ 1.68
HOXD1-201ENST00000331462 ERFEQ4G0M1 354 aa25.52■■□□□ 1.68
HOXD1-201ENST00000331462 MTRQ99707 1265 aa25.52■■□□□ 1.68
HOXD1-201ENST00000331462 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms