RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326277.5

SNX18-201, Transcript of sorting nexin 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNX18, Length 2,063 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18-201ENST00000326277 C16orf86Q6ZW13 317 aa26.21■■□□□ 1.79
SNX18-201ENST00000326277 ZNF287Q9HBT7 754 aa26.21■■□□□ 1.79
SNX18-201ENST00000326277 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
SNX18-201ENST00000326277 NLRP5P59047 1200 aa26.21■■□□□ 1.79
SNX18-201ENST00000326277 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
SNX18-201ENST00000326277 CSRNP2Q9H175 543 aa26.21■■□□□ 1.79
SNX18-201ENST00000326277 MAD2L2Q9UI95 211 aa26.21■■□□□ 1.79
SNX18-201ENST00000326277 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
SNX18-201ENST00000326277 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
SNX18-201ENST00000326277 KIAA1524Q8TCG1 905 aa26.2■■□□□ 1.78
SNX18-201ENST00000326277 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa26.2■■□□□ 1.78
SNX18-201ENST00000326277 SNED1Q8TER0 1413 aa26.2■■□□□ 1.78
SNX18-201ENST00000326277 FOXN1O15353 648 aa26.19■■□□□ 1.78
SNX18-201ENST00000326277 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
SNX18-201ENST00000326277 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
SNX18-201ENST00000326277 TMEM47Q9BQJ4 181 aa26.19■■□□□ 1.78
SNX18-201ENST00000326277 STX8Q9UNK0 236 aa26.19■■□□□ 1.78
SNX18-201ENST00000326277 CCDC144BQ3MJ40 725 aa26.19■■□□□ 1.78
SNX18-201ENST00000326277 USP49Q70CQ1 688 aa26.19■■□□□ 1.78
SNX18-201ENST00000326277 EYA3Q99504 573 aa26.19■■□□□ 1.78
SNX18-201ENST00000326277 MMP10P09238 476 aa26.18■■□□□ 1.78
SNX18-201ENST00000326277 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
SNX18-201ENST00000326277 SPTLC3Q9NUV7 552 aa26.18■■□□□ 1.78
SNX18-201ENST00000326277 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
SNX18-201ENST00000326277 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa26.18■■□□□ 1.78
SNX18-201ENST00000326277 ADAMTS3O15072 1205 aa26.18■■□□□ 1.78
SNX18-201ENST00000326277 NCAPHQ15003 741 aa26.18■■□□□ 1.78
SNX18-201ENST00000326277 TTC38Q5R3I4 469 aa26.18■■□□□ 1.78
SNX18-201ENST00000326277 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
SNX18-201ENST00000326277 SERTAD1Q9UHV2 236 aa26.18■■□□□ 1.78
SNX18-201ENST00000326277 ALDH1B1P30837 517 aa26.17■■□□□ 1.78
SNX18-201ENST00000326277 PDE6BP35913 854 aa26.17■■□□□ 1.78
SNX18-201ENST00000326277 GNAQP50148 359 aa26.17■■□□□ 1.78
SNX18-201ENST00000326277 LRMPQ12912 555 aa26.17■■□□□ 1.78
SNX18-201ENST00000326277 ZNF174Q15697 407 aa26.17■■□□□ 1.78
SNX18-201ENST00000326277 MTMR7Q9Y216 660 aa26.17■■□□□ 1.78
SNX18-201ENST00000326277 BMP15O95972 392 aa26.16■■□□□ 1.78
SNX18-201ENST00000326277 SLC35G1Q2M3R5 365 aa26.16■■□□□ 1.78
SNX18-201ENST00000326277 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa26.16■■□□□ 1.78
SNX18-201ENST00000326277 CERS5Q8N5B7 392 aa26.16■■□□□ 1.78
SNX18-201ENST00000326277 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP26.16■■□□□ 1.78
SNX18-201ENST00000326277 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
SNX18-201ENST00000326277 PARP3Q9Y6F1 533 aa26.16■■□□□ 1.78
SNX18-201ENST00000326277 MYH1P12882 1939 aa26.16■■□□□ 1.78
SNX18-201ENST00000326277 SMTNL1A8MU46 457 aa26.16■■□□□ 1.78
SNX18-201ENST00000326277 F8W031 263 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
SNX18-201ENST00000326277 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
SNX18-201ENST00000326277 PDILTQ8N807 584 aa26.16■■□□□ 1.78
SNX18-201ENST00000326277 FLAD1Q8NFF5 587 aa26.16■■□□□ 1.78
SNX18-201ENST00000326277 NEDD1Q8NHV4 660 aa26.16■■□□□ 1.78
SNX18-201ENST00000326277 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
SNX18-201ENST00000326277 POSTNQ15063 836 aa26.15■■□□□ 1.78
SNX18-201ENST00000326277 SH3GLB2Q9NR46 395 aa26.15■■□□□ 1.78
SNX18-201ENST00000326277 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa26.15■■□□□ 1.78
SNX18-201ENST00000326277 IKBKBO14920 756 aa26.15■■□□□ 1.78
SNX18-201ENST00000326277 DOK7Q18PE1 504 aa26.15■■□□□ 1.78
SNX18-201ENST00000326277 FERMT2Q96AC1 680 aa26.15■■□□□ 1.78
SNX18-201ENST00000326277 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 CYTH3O43739 400 aa26.14■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 CALML3P27482 149 aa26.14■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 MSL1Q68DK7 614 aa26.14■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 MASTLQ96GX5 879 aa26.14■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 MXD3Q9BW11 206 aa26.14■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 FOCADQ5VW36 1801 aa26.14■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 PRR29P0C7W0 189 aa26.13■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 TPM4P67936 248 aa26.13■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 EPSTI1Q96J88 318 aa26.13■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 BMP6P22004 513 aa26.13■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 TRAPPC10P48553 1259 aa26.13■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 PTGDRQ13258 359 aa26.13■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 PICALMQ13492 652 aa26.13■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 TYW1BQ6NUM6 668 aa26.13■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 BLIDQ8IZY5 108 aa26.13■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 RASGRP2Q7LDG7 609 aa26.12■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa26.12■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 A0A087X0B3 334 aa26.11■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 GOLGA8HP0CJ92 632 aa26.11■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 NT5DC1Q5TFE4 455 aa26.11■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 CEP95Q96GE4 821 aa26.11■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 HSD3B7Q9H2F3 369 aa26.11■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 MAN1B1Q9UKM7 699 aa26.11■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 PCDHA4Q9UN74 947 aa26.11■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 WWC2Q6AWC2 1192 aa26.11■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 KANK3Q6NY19 840 aa26.11■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 QSER1Q2KHR3 1735 aa26.11■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 SARSP49591 514 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 TERF1P54274 439 aa26.1■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 LZTS2Q9BRK4 669 aa26.1■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 IFNKQ9P0W0 207 aa26.1■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 VWA3AA6NCI4 1184 aa26.1■■□□□ 1.77
SNX18-201ENST00000326277 KLRF2D3W0D1 207 aa26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms