RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313352.11

PUF60-201, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PUF60, Length 1,804 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-201ENST00000313352 TSPY2A6NKD2 308 aa20.31■□□□□ 0.84
PUF60-201ENST00000313352 ZNF213O14771 459 aa20.31■□□□□ 0.84
PUF60-201ENST00000313352 OSBPP22059 807 aa20.31■□□□□ 0.84
PUF60-201ENST00000313352 LAMA4Q16363 1823 aa20.31■□□□□ 0.84
PUF60-201ENST00000313352 AKNAD1Q5T1N1 836 aa20.31■□□□□ 0.84
PUF60-201ENST00000313352 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa20.31■□□□□ 0.84
PUF60-201ENST00000313352 RASGRP2Q7LDG7 609 aa20.31■□□□□ 0.84
PUF60-201ENST00000313352 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PUF60-201ENST00000313352 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PUF60-201ENST00000313352 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa20.31■□□□□ 0.84
PUF60-201ENST00000313352 PLIN4Q96Q06 1357 aa20.3■□□□□ 0.84
PUF60-201ENST00000313352 ORC4O43929 436 aa20.3■□□□□ 0.84
PUF60-201ENST00000313352 HERVK_113P62684 666 aa20.3■□□□□ 0.84
PUF60-201ENST00000313352 STAG1Q8WVM7 1258 aa20.3■□□□□ 0.84
PUF60-201ENST00000313352 PNMA3Q9UL41 463 aa20.3■□□□□ 0.84
PUF60-201ENST00000313352 MYH4Q9Y623 1939 aa20.3■□□□□ 0.84
PUF60-201ENST00000313352 Q3C1V9 767 aa20.3■□□□□ 0.84
PUF60-201ENST00000313352 ERO1AQ96HE7 468 aa20.3■□□□□ 0.84
PUF60-201ENST00000313352 TRIM47Q96LD4 638 aa20.3■□□□□ 0.84
PUF60-201ENST00000313352 NYAP2Q9P242 653 aa20.3■□□□□ 0.84
PUF60-201ENST00000313352 RBPJLQ9UBG7 517 aa20.3■□□□□ 0.84
PUF60-201ENST00000313352 BRCA2P51587 3418 aa20.29■□□□□ 0.84
PUF60-201ENST00000313352 USP17L15C9J2P7 530 aa20.29■□□□□ 0.84
PUF60-201ENST00000313352 USP17L13C9JLJ4 530 aa20.29■□□□□ 0.84
PUF60-201ENST00000313352 USP17L11C9JVI0 530 aa20.29■□□□□ 0.84
PUF60-201ENST00000313352 USP17L18D6R9N7 530 aa20.29■□□□□ 0.84
PUF60-201ENST00000313352 USP17L22D6RA61 530 aa20.29■□□□□ 0.84
PUF60-201ENST00000313352 USP17L17D6RBQ6 530 aa20.29■□□□□ 0.84
PUF60-201ENST00000313352 USP17L19D6RCP7 530 aa20.29■□□□□ 0.84
PUF60-201ENST00000313352 USP17L20D6RJB6 530 aa20.29■□□□□ 0.84
PUF60-201ENST00000313352 USP17L24Q0WX57 530 aa20.29■□□□□ 0.84
PUF60-201ENST00000313352 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP20.29■□□□□ 0.842e-6■■■■■ 90.1
PUF60-201ENST00000313352 MFSD6Q6ZSS7 791 aa20.29■□□□□ 0.84
PUF60-201ENST00000313352 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa20.29■□□□□ 0.84
PUF60-201ENST00000313352 FBXO28Q9NVF7 368 aa20.29■□□□□ 0.84
PUF60-201ENST00000313352 RLFQ13129 1914 aa20.28■□□□□ 0.84
PUF60-201ENST00000313352 CYP21A2P08686 494 aa20.28■□□□□ 0.84
PUF60-201ENST00000313352 PSMC4P43686 418 aa20.28■□□□□ 0.84
PUF60-201ENST00000313352 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
PUF60-201ENST00000313352 TANGO6Q9C0B7 1094 aa20.28■□□□□ 0.84
PUF60-201ENST00000313352 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
PUF60-201ENST00000313352 EFCC1Q9HA90 598 aa20.28■□□□□ 0.84
PUF60-201ENST00000313352 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
PUF60-201ENST00000313352 F5H6K3 240 aa20.27■□□□□ 0.84
PUF60-201ENST00000313352 CNMDO75829 334 aa20.27■□□□□ 0.84
PUF60-201ENST00000313352 KLRC3Q07444 240 aa20.27■□□□□ 0.84
PUF60-201ENST00000313352 FAM83BQ5T0W9 1011 aa20.27■□□□□ 0.84
PUF60-201ENST00000313352 PAGR1Q9BTK6 254 aa20.27■□□□□ 0.84
PUF60-201ENST00000313352 B4E1Z4 1266 aa20.27■□□□□ 0.84
PUF60-201ENST00000313352 TTLL1O95922 423 aa20.27■□□□□ 0.84
PUF60-201ENST00000313352 NDUFB10O96000 172 aa20.27■□□□□ 0.84
PUF60-201ENST00000313352 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
PUF60-201ENST00000313352 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
PUF60-201ENST00000313352 MAP4K1Q92918 833 aa20.27■□□□□ 0.84
PUF60-201ENST00000313352 STX8Q9UNK0 236 aa20.27■□□□□ 0.84
PUF60-201ENST00000313352 MKL1Q969V6 931 aa20.26■□□□□ 0.83
PUF60-201ENST00000313352 BTBD7Q9P203 1132 aa20.26■□□□□ 0.83
PUF60-201ENST00000313352 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
PUF60-201ENST00000313352 KDM4AO75164 1064 aa20.25■□□□□ 0.83
PUF60-201ENST00000313352 FAM110CQ1W6H9 321 aa20.25■□□□□ 0.83
PUF60-201ENST00000313352 STOX1Q6ZVD7 989 aa20.25■□□□□ 0.83
PUF60-201ENST00000313352 LPAR1Q92633 364 aa20.25■□□□□ 0.83
PUF60-201ENST00000313352 ABHD8Q96I13 439 aa20.25■□□□□ 0.83
PUF60-201ENST00000313352 SH2D4AQ9H788 454 aa20.25■□□□□ 0.83
PUF60-201ENST00000313352 CTNNA3Q9UI47 895 aa20.25■□□□□ 0.83
PUF60-201ENST00000313352 MTMR7Q9Y216 660 aa20.25■□□□□ 0.83
PUF60-201ENST00000313352 MGAMO43451 1857 aa20.25■□□□□ 0.83
PUF60-201ENST00000313352 CDC45O75419 566 aa20.25■□□□□ 0.83
PUF60-201ENST00000313352 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
PUF60-201ENST00000313352 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
PUF60-201ENST00000313352 RCSD1Q6JBY9 416 aa20.25■□□□□ 0.83
PUF60-201ENST00000313352 PORCNQ9H237 461 aa20.25■□□□□ 0.83
PUF60-201ENST00000313352 GOPCQ9HD26 462 aa20.25■□□□□ 0.83
PUF60-201ENST00000313352 GABRQQ9UN88 632 aa20.25■□□□□ 0.83
PUF60-201ENST00000313352 PARP14Q460N5 1801 aa20.25■□□□□ 0.83
PUF60-201ENST00000313352 WDR46O15213 610 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PUF60-201ENST00000313352 FLOT1O75955 427 aa20.24■□□□□ 0.83
PUF60-201ENST00000313352 NOVP48745 357 aa20.24■□□□□ 0.83
PUF60-201ENST00000313352 ATG4CQ96DT6 458 aa20.24■□□□□ 0.83
PUF60-201ENST00000313352 ANO2Q9NQ90 1003 aa20.24■□□□□ 0.83
PUF60-201ENST00000313352 ZSWIM5Q9P217 1185 aa20.24■□□□□ 0.83
PUF60-201ENST00000313352 MORF4L1Q9UBU8 362 aa20.24■□□□□ 0.83
PUF60-201ENST00000313352 PTPN22Q9Y2R2 807 aa20.24■□□□□ 0.83
PUF60-201ENST00000313352 DOCK3Q8IZD9 2030 aa20.23■□□□□ 0.83
PUF60-201ENST00000313352 COG2Q14746 738 aa20.23■□□□□ 0.83
PUF60-201ENST00000313352 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PUF60-201ENST00000313352 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa20.23■□□□□ 0.83
PUF60-201ENST00000313352 CAPN15O75808 1086 aa20.23■□□□□ 0.83
PUF60-201ENST00000313352 DSG3P32926 999 aa20.23■□□□□ 0.83
PUF60-201ENST00000313352 ERVK-9P63128 1117 aa20.23■□□□□ 0.83
PUF60-201ENST00000313352 ERVK-24P63145 666 aa20.23■□□□□ 0.83
PUF60-201ENST00000313352 KIF22Q14807 665 aa20.23■□□□□ 0.83
PUF60-201ENST00000313352 CYB5R4Q7L1T6 521 aa20.23■□□□□ 0.83
PUF60-201ENST00000313352 HPS5Q9UPZ3 1129 aa20.23■□□□□ 0.83
PUF60-201ENST00000313352 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PUF60-201ENST00000313352 PRKCZQ05513 592 aa20.22■□□□□ 0.83
PUF60-201ENST00000313352 SLFN13Q68D06 897 aa20.22■□□□□ 0.83
PUF60-201ENST00000313352 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
PUF60-201ENST00000313352 ESR2Q92731 530 aa20.22■□□□□ 0.83
PUF60-201ENST00000313352 TMEM47Q9BQJ4 181 aa20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms