RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299299.3

PCBD1-201, Transcript of pterin-4 alpha-carbinolamine dehydratase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PCBD1, Length 1,006 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBD1-201ENST00000299299 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
PCBD1-201ENST00000299299 TDO2P48775 406 aa16.03■□□□□ 0.16
PCBD1-201ENST00000299299 SBK1Q52WX2 424 aa16.03■□□□□ 0.16
PCBD1-201ENST00000299299 TMEM179Q6ZVK1 233 aa16.03■□□□□ 0.16
PCBD1-201ENST00000299299 C16orf86Q6ZW13 317 aa16.03■□□□□ 0.16
PCBD1-201ENST00000299299 USP26Q9BXU7 913 aa16.03■□□□□ 0.16
PCBD1-201ENST00000299299 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa16.03■□□□□ 0.16
PCBD1-201ENST00000299299 NAPBQ9H115 298 aa16.03■□□□□ 0.16
PCBD1-201ENST00000299299 TAOK2Q9UL54 1235 aa16.03■□□□□ 0.16
PCBD1-201ENST00000299299 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PCBD1-201ENST00000299299 ROBO3Q96MS0 1386 aa16.02■□□□□ 0.16
PCBD1-201ENST00000299299 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
PCBD1-201ENST00000299299 HOXD10P28358 340 aa16.02■□□□□ 0.16
PCBD1-201ENST00000299299 CDK8P49336 464 aa16.02■□□□□ 0.16
PCBD1-201ENST00000299299 USP14P54578 494 aa16.02■□□□□ 0.16
PCBD1-201ENST00000299299 RAET1EQ8TD07 263 aa16.02■□□□□ 0.16
PCBD1-201ENST00000299299 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
PCBD1-201ENST00000299299 PEX10O60683 326 aa16.01■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 HERVK_113P62684 666 aa16.01■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 ICA1Q05084 483 aa16.01■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 NECTIN1Q15223 517 aa16.01■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 TXNRD2Q9NNW7 524 aa16.01■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 CTNNA3Q9UI47 895 aa16.01■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 GABRQQ9UN88 632 aa16.01■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 A0A1W2PRG0 241 aa16■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 CHRDL2Q6WN34 429 aa16■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 NKX2-3Q8TAU0 364 aa16■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 DPF3Q92784 378 aa16■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 NBPF3Q9H094 633 aa16■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa16■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 CEP290O15078 2479 aa16■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 MINDY4BA8MYZ0 360 aa15.99■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 CYP21A2P08686 494 aa15.99■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 HSPA4P34932 840 aa15.99■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 FLT3LGP49771 235 aa15.99■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 HAND2P61296 217 aa15.99■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 PPARAQ07869 468 aa15.99■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 STK11IPQ8N1F8 1099 aa15.99■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 CCDC17Q96LX7 622 aa15.99■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 PAGR1Q9BTK6 254 aa15.99■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 MORF4L1Q9UBU8 362 aa15.99■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 ANAPC4Q9UJX5 808 aa15.99■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 MYH4Q9Y623 1939 aa15.98■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 USP17L15C9J2P7 530 aa15.98■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 USP17L13C9JLJ4 530 aa15.98■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 USP17L11C9JVI0 530 aa15.98■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 USP17L18D6R9N7 530 aa15.98■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 USP17L22D6RA61 530 aa15.98■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 USP17L17D6RBQ6 530 aa15.98■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 USP17L19D6RCP7 530 aa15.98■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 USP17L20D6RJB6 530 aa15.98■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 SLC27A2O14975 620 aa15.98■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 GRK4P32298 578 aa15.98■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 USP17L24Q0WX57 530 aa15.98■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 CREB3L3Q68CJ9 461 aa15.98■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 SLAIN1Q8ND83 568 aa15.98■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 KCNB2Q92953 911 aa15.98■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 COA7Q96BR5 231 aa15.98■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 HTATIP2Q9BUP3 242 aa15.98■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa15.98■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 TAF6LQ9Y6J9 622 aa15.98■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 ZNF213O14771 459 aa15.97■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 ERVK-9P63128 1117 aa15.97■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 ERVK-24P63145 666 aa15.97■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 CTDSPL2Q05D32 466 aa15.97■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 MTFR1Q15390 333 aa15.97■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa15.97■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 POTEEQ6S8J3 1075 aa15.97■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa15.97■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa15.97■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 SHISA4Q96DD7 197 aa15.97■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 SH2D4AQ9H788 454 aa15.97■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 TACC3Q9Y6A5 838 aa15.97■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 ELNP15502 786 aa15.96■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 RASA1P20936 1047 aa15.96■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 UBXN2AP68543 259 aa15.96■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 ATP2B2Q01814 1243 aa15.96■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 SIAH1Q8IUQ4 282 aa15.96■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 TBC1D10CQ8IV04 446 aa15.96■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 RASEFQ8IZ41 740 aa15.96■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 SPICE1Q8N0Z3 855 aa15.96■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP15.96■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 TANGO6Q9C0B7 1094 aa15.96■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 RBPJLQ9UBG7 517 aa15.96■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 MGAMO43451 1857 aa15.96■□□□□ 0.15
PCBD1-201ENST00000299299 ADCY3O60266 1144 aa15.95■□□□□ 0.14
PCBD1-201ENST00000299299 PRDM1O75626 825 aa15.95■□□□□ 0.14
PCBD1-201ENST00000299299 CNMDO75829 334 aa15.95■□□□□ 0.14
PCBD1-201ENST00000299299 FGRP09769 529 aa15.95■□□□□ 0.14
PCBD1-201ENST00000299299 EEF2P13639 858 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PCBD1-201ENST00000299299 IRF5Q13568 498 aa15.95■□□□□ 0.14
PCBD1-201ENST00000299299 TSGA10IPQ3SY00 556 aa15.95■□□□□ 0.14
PCBD1-201ENST00000299299 AKNAD1Q5T1N1 836 aa15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.5 ms