RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296098.4

TRIM54-201, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 2,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54-201ENST00000296098 WNT7AO00755 349 aa27.38■■□□□ 1.97
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TRIM54-201ENST00000296098 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
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TRIM54-201ENST00000296098 USP17L4A6NCW7 530 aa27.36■■□□□ 1.97
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TRIM54-201ENST00000296098 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
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TRIM54-201ENST00000296098 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP27.34■■□□□ 1.97
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TRIM54-201ENST00000296098 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
TRIM54-201ENST00000296098 C16orf86Q6ZW13 317 aa27.33■■□□□ 1.97
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TRIM54-201ENST00000296098 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa27.29■■□□□ 1.96
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TRIM54-201ENST00000296098 CCDC148Q8NFR7 591 aa27.29■■□□□ 1.96
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