RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000290377.9

TUBBP5-201, Transcript of tubulin beta pseudogene 5, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TUBBP5, Length 1,563 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBBP5-201ENST00000290377 CTNNA3Q9UI47 895 aa18.51■□□□□ 0.55
TUBBP5-201ENST00000290377 FOXP2O15409 715 aa18.51■□□□□ 0.55
TUBBP5-201ENST00000290377 PRDM1O75626 825 aa18.51■□□□□ 0.55
TUBBP5-201ENST00000290377 VCAM1P19320 739 aa18.51■□□□□ 0.55
TUBBP5-201ENST00000290377 RASA1P20936 1047 aa18.51■□□□□ 0.55
TUBBP5-201ENST00000290377 CTGFP29279 349 aa18.51■□□□□ 0.55
TUBBP5-201ENST00000290377 HERVK_113P62684 666 aa18.51■□□□□ 0.55
TUBBP5-201ENST00000290377 PDE4BQ07343 736 aa18.51■□□□□ 0.55
TUBBP5-201ENST00000290377 PPARAQ07869 468 aa18.51■□□□□ 0.55
TUBBP5-201ENST00000290377 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa18.51■□□□□ 0.55
TUBBP5-201ENST00000290377 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
TUBBP5-201ENST00000290377 FGAP02671 866 aa18.5■□□□□ 0.55
TUBBP5-201ENST00000290377 PRMT2P55345 433 aa18.5■□□□□ 0.55
TUBBP5-201ENST00000290377 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
TUBBP5-201ENST00000290377 SRRDQ9UH36 339 aa18.5■□□□□ 0.55
TUBBP5-201ENST00000290377 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
TUBBP5-201ENST00000290377 EEF2P13639 858 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
TUBBP5-201ENST00000290377 NECTIN1Q15223 517 aa18.49■□□□□ 0.55
TUBBP5-201ENST00000290377 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
TUBBP5-201ENST00000290377 TMX2Q9Y320 296 aa18.49■□□□□ 0.55
TUBBP5-201ENST00000290377 ZMYM6O95789 1325 aa18.49■□□□□ 0.55
TUBBP5-201ENST00000290377 MYPNQ86TC9 1320 aa18.49■□□□□ 0.55
TUBBP5-201ENST00000290377 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa18.48■□□□□ 0.55
TUBBP5-201ENST00000290377 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa18.48■□□□□ 0.55
TUBBP5-201ENST00000290377 RAET1EQ8TD07 263 aa18.48■□□□□ 0.55
TUBBP5-201ENST00000290377 LPAR1Q92633 364 aa18.48■□□□□ 0.55
TUBBP5-201ENST00000290377 PAGR1Q9BTK6 254 aa18.48■□□□□ 0.55
TUBBP5-201ENST00000290377 TANGO6Q9C0B7 1094 aa18.48■□□□□ 0.55
TUBBP5-201ENST00000290377 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
TUBBP5-201ENST00000290377 RAD21O60216 631 aa18.47■□□□□ 0.55
TUBBP5-201ENST00000290377 MCCP23508 829 aa18.47■□□□□ 0.55
TUBBP5-201ENST00000290377 HSPA4P34932 840 aa18.47■□□□□ 0.55
TUBBP5-201ENST00000290377 NBPF11Q86T75 865 aa18.47■□□□□ 0.55
TUBBP5-201ENST00000290377 SIAH1Q8IUQ4 282 aa18.47■□□□□ 0.55
TUBBP5-201ENST00000290377 C22orf23Q9BZE7 217 aa18.47■□□□□ 0.55
TUBBP5-201ENST00000290377 VCPKMTQ9H867 229 aa18.47■□□□□ 0.55
TUBBP5-201ENST00000290377 MORF4L1Q9UBU8 362 aa18.47■□□□□ 0.55
TUBBP5-201ENST00000290377 TSPY3P0CV98 308 aa18.47■□□□□ 0.55
TUBBP5-201ENST00000290377 TSPY8P0CW00 308 aa18.47■□□□□ 0.55
TUBBP5-201ENST00000290377 RBM25P49756 843 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
TUBBP5-201ENST00000290377 SOX10P56693 466 aa18.47■□□□□ 0.55
TUBBP5-201ENST00000290377 CTDSPL2Q05D32 466 aa18.47■□□□□ 0.55
TUBBP5-201ENST00000290377 RNF20Q5VTR2 975 aa18.47■□□□□ 0.55
TUBBP5-201ENST00000290377 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
TUBBP5-201ENST00000290377 SPICE1Q8N0Z3 855 aa18.47■□□□□ 0.55
TUBBP5-201ENST00000290377 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa18.47■□□□□ 0.55
TUBBP5-201ENST00000290377 KCNB2Q92953 911 aa18.47■□□□□ 0.55
TUBBP5-201ENST00000290377 COA7Q96BR5 231 aa18.47■□□□□ 0.55
TUBBP5-201ENST00000290377 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP18.47■□□□□ 0.55
TUBBP5-201ENST00000290377 GOPCQ9HD26 462 aa18.47■□□□□ 0.55
TUBBP5-201ENST00000290377 MGAMO43451 1857 aa18.46■□□□□ 0.55
TUBBP5-201ENST00000290377 PRKCZQ05513 592 aa18.46■□□□□ 0.55
TUBBP5-201ENST00000290377 PEX10O60683 326 aa18.45■□□□□ 0.54
TUBBP5-201ENST00000290377 TFAP4Q01664 338 aa18.45■□□□□ 0.54
TUBBP5-201ENST00000290377 TSGA10IPQ3SY00 556 aa18.45■□□□□ 0.54
TUBBP5-201ENST00000290377 FAM47AQ5JRC9 791 aa18.45■□□□□ 0.54
TUBBP5-201ENST00000290377 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa18.45■□□□□ 0.54
TUBBP5-201ENST00000290377 TBC1D32Q96NH3 1257 aa18.45■□□□□ 0.54
TUBBP5-201ENST00000290377 TXNRD2Q9NNW7 524 aa18.45■□□□□ 0.54
TUBBP5-201ENST00000290377 TOMM22Q9NS69 142 aa18.45■□□□□ 0.54
TUBBP5-201ENST00000290377 NYAP2Q9P242 653 aa18.45■□□□□ 0.54
TUBBP5-201ENST00000290377 RBPJLQ9UBG7 517 aa18.45■□□□□ 0.54
TUBBP5-201ENST00000290377 ANAPC4Q9UJX5 808 aa18.45■□□□□ 0.54
TUBBP5-201ENST00000290377 HTTP42858 3142 aa18.44■□□□□ 0.54
TUBBP5-201ENST00000290377 TSPY2A6NKD2 308 aa18.44■□□□□ 0.54
TUBBP5-201ENST00000290377 ZNF213O14771 459 aa18.44■□□□□ 0.54
TUBBP5-201ENST00000290377 WDR46O15213 610 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
TUBBP5-201ENST00000290377 ANAPC15P60006 121 aa18.44■□□□□ 0.54
TUBBP5-201ENST00000290377 ERVK-9P63128 1117 aa18.44■□□□□ 0.54
TUBBP5-201ENST00000290377 ERVK-24P63145 666 aa18.44■□□□□ 0.54
TUBBP5-201ENST00000290377 COG2Q14746 738 aa18.44■□□□□ 0.54
TUBBP5-201ENST00000290377 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
TUBBP5-201ENST00000290377 CREB3L3Q68CJ9 461 aa18.44■□□□□ 0.54
TUBBP5-201ENST00000290377 ARMC5Q96C12 935 aa18.44■□□□□ 0.54
TUBBP5-201ENST00000290377 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
TUBBP5-201ENST00000290377 CLIP2Q9UDT6 1046 aa18.44■□□□□ 0.54
TUBBP5-201ENST00000290377 GABRQQ9UN88 632 aa18.44■□□□□ 0.54
TUBBP5-201ENST00000290377 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa18.44■□□□□ 0.54
TUBBP5-201ENST00000290377 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
TUBBP5-201ENST00000290377 FLT3LGP49771 235 aa18.43■□□□□ 0.54
TUBBP5-201ENST00000290377 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
TUBBP5-201ENST00000290377 NEDD1Q8NHV4 660 aa18.43■□□□□ 0.54
TUBBP5-201ENST00000290377 SH3TC2Q8TF17 1288 aa18.43■□□□□ 0.54
TUBBP5-201ENST00000290377 IL17RAQ96F46 866 aa18.43■□□□□ 0.54
TUBBP5-201ENST00000290377 CEP95Q96GE4 821 aa18.43■□□□□ 0.54
TUBBP5-201ENST00000290377 HOXC10Q9NYD6 342 aa18.43■□□□□ 0.54
TUBBP5-201ENST00000290377 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
TUBBP5-201ENST00000290377 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
TUBBP5-201ENST00000290377 SLC27A2O14975 620 aa18.42■□□□□ 0.54
TUBBP5-201ENST00000290377 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
TUBBP5-201ENST00000290377 FLOT1O75955 427 aa18.42■□□□□ 0.54
TUBBP5-201ENST00000290377 CYP21A2P08686 494 aa18.42■□□□□ 0.54
TUBBP5-201ENST00000290377 HAND2P61296 217 aa18.42■□□□□ 0.54
TUBBP5-201ENST00000290377 CCNA1P78396 465 aa18.42■□□□□ 0.54
TUBBP5-201ENST00000290377 INCENPQ9NQS7 918 aa18.42■□□□□ 0.54
TUBBP5-201ENST00000290377 MTMR4Q9NYA4 1195 aa18.42■□□□□ 0.54
TUBBP5-201ENST00000290377 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
TUBBP5-201ENST00000290377 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP18.42■□□□□ 0.54
TUBBP5-201ENST00000290377 PLIN4Q96Q06 1357 aa18.42■□□□□ 0.54
TUBBP5-201ENST00000290377 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms