RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000277010.8

SIGMAR1-201, Transcript of sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIGMAR1, Length 1,656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1-201ENST00000277010 VCPKMTQ9H867 229 aa26.86■■□□□ 1.89
SIGMAR1-201ENST00000277010 ANTXR2P58335 489 aa26.85■■□□□ 1.89
SIGMAR1-201ENST00000277010 RCSD1Q6JBY9 416 aa26.85■■□□□ 1.89
SIGMAR1-201ENST00000277010 C12orf42Q96LP6 360 aa26.85■■□□□ 1.89
SIGMAR1-201ENST00000277010 NEK1Q96PY6 1258 aa26.85■■□□□ 1.89
SIGMAR1-201ENST00000277010 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa26.85■■□□□ 1.89
SIGMAR1-201ENST00000277010 TNKSO95271 1327 aa26.85■■□□□ 1.89
SIGMAR1-201ENST00000277010 PTPRFP10586 1907 aa26.85■■□□□ 1.89
SIGMAR1-201ENST00000277010 ANKRD23Q86SG2 305 aa26.85■■□□□ 1.89
SIGMAR1-201ENST00000277010 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
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SIGMAR1-201ENST00000277010 GOPCQ9HD26 462 aa26.84■■□□□ 1.89
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SIGMAR1-201ENST00000277010 WBP1LQ9NX94 342 aa26.83■■□□□ 1.89
SIGMAR1-201ENST00000277010 F5H6K3 240 aa26.82■■□□□ 1.88
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SIGMAR1-201ENST00000277010 PRC1O43663 620 aa26.82■■□□□ 1.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 MCM5P33992 734 aa26.82■■□□□ 1.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 KLRC3Q07444 240 aa26.82■■□□□ 1.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 CCDC178Q5BJE1 867 aa26.82■■□□□ 1.88
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SIGMAR1-201ENST00000277010 CHMP4CQ96CF2 233 aa26.82■■□□□ 1.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 RNF186Q9NXI6 227 aa26.82■■□□□ 1.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 TRPA1O75762 1119 aa26.82■■□□□ 1.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 NDUFB10O96000 172 aa26.82■■□□□ 1.88
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SIGMAR1-201ENST00000277010 LPAR1Q92633 364 aa26.82■■□□□ 1.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 MTMR7Q9Y216 660 aa26.82■■□□□ 1.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 LOC285556D6RIA3 1793 aa26.81■■□□□ 1.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 SEC23AQ15436 765 aa26.81■■□□□ 1.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 BEGAINQ9BUH8 593 aa26.81■■□□□ 1.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa26.81■■□□□ 1.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 ALDH1A1P00352 501 aa26.8■■□□□ 1.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 CPA1P15085 419 aa26.8■■□□□ 1.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 SART3Q15020 963 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa26.8■■□□□ 1.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 LRRC2Q9BYS8 371 aa26.8■■□□□ 1.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 ERICH2A1L162 156 aa26.79■■□□□ 1.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 TMEM67Q5HYA8 995 aa26.79■■□□□ 1.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 RASGRP2Q7LDG7 609 aa26.79■■□□□ 1.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 ANKS1AQ92625 1134 aa26.79■■□□□ 1.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 TCEANC2Q96MN5 208 aa26.79■■□□□ 1.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 CYP2C8P10632 490 aa26.79■■□□□ 1.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 SLFN13Q68D06 897 aa26.79■■□□□ 1.88
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SIGMAR1-201ENST00000277010 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa26.79■■□□□ 1.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 SENP2Q9HC62 589 aa26.79■■□□□ 1.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa26.79■■□□□ 1.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 WDR46O15213 610 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
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SIGMAR1-201ENST00000277010 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP26.78■■□□□ 1.883e-7■■■□□ 14.6
SIGMAR1-201ENST00000277010 FAM83BQ5T0W9 1011 aa26.78■■□□□ 1.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 KAT14Q9H8E8 782 aa26.78■■□□□ 1.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 MYH4Q9Y623 1939 aa26.78■■□□□ 1.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 USP17L15C9J2P7 530 aa26.77■■□□□ 1.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 USP17L13C9JLJ4 530 aa26.77■■□□□ 1.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 USP17L11C9JVI0 530 aa26.77■■□□□ 1.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 USP17L18D6R9N7 530 aa26.77■■□□□ 1.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 USP17L22D6RA61 530 aa26.77■■□□□ 1.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 USP17L17D6RBQ6 530 aa26.77■■□□□ 1.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 USP17L19D6RCP7 530 aa26.77■■□□□ 1.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 USP17L20D6RJB6 530 aa26.77■■□□□ 1.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 TBC1D8O95759 1140 aa26.77■■□□□ 1.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 PSMA5P28066 241 aa26.77■■□□□ 1.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 USP17L24Q0WX57 530 aa26.77■■□□□ 1.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 CRHR2Q13324 411 aa26.77■■□□□ 1.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 WTAPQ15007 396 aa26.77■■□□□ 1.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa26.77■■□□□ 1.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 BACH2Q9BYV9 841 aa26.77■■□□□ 1.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 TANGO6Q9C0B7 1094 aa26.77■■□□□ 1.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa26.77■■□□□ 1.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 TSKSQ9UJT2 592 aa26.77■■□□□ 1.88
SIGMAR1-201ENST00000277010 CA12O43570 354 aa26.76■■□□□ 1.87
SIGMAR1-201ENST00000277010 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
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SIGMAR1-201ENST00000277010 PNMA1Q8ND90 353 aa26.76■■□□□ 1.87
SIGMAR1-201ENST00000277010 TMEM87BQ96K49 555 aa26.76■■□□□ 1.87
SIGMAR1-201ENST00000277010 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
SIGMAR1-201ENST00000277010 OSBPP22059 807 aa26.76■■□□□ 1.87
SIGMAR1-201ENST00000277010 ANAPC15P60006 121 aa26.76■■□□□ 1.87
SIGMAR1-201ENST00000277010 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
SIGMAR1-201ENST00000277010 MTA3Q9BTC8 594 aa26.76■■□□□ 1.87
SIGMAR1-201ENST00000277010 LY9Q9HBG7 655 aa26.76■■□□□ 1.87
SIGMAR1-201ENST00000277010 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa26.76■■□□□ 1.87
SIGMAR1-201ENST00000277010 SAGE1Q9NXZ1 904 aa26.76■■□□□ 1.87
SIGMAR1-201ENST00000277010 PNMA3Q9UL41 463 aa26.76■■□□□ 1.87
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