RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa8.36□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 TEKT1Q969V4 418 aa8.36□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 GRPEL1Q9HAV7 217 aa8.36□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 BDP1A6H8Y1 2624 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 MYH2Q9UKX2 1941 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 SMAPO00193 183 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 TNFRSF10AO00220 468 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 SRGAP3O43295 1099 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 MBD3O95983 291 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 NEK4P51957 841 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 BEND3Q5T5X7 828 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM83AQ86UY5 434 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 RHPN1Q8TCX5 695 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 COA7Q96BR5 231 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM122AQ96E09 287 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 HOOK2Q96ED9 719 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 IL17RAQ96F46 866 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 ANO2Q9NQ90 1003 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 NCOR1O75376 2440 aa8.34□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP8.34□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 FOSL2P15408 326 aa8.34□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 CAPN2P17655 700 aa8.34□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 FOXO4P98177 505 aa8.34□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP8.34□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 MTX1Q13505 466 aa8.34□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 TAF7LQ5H9L4 462 aa8.34□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 USP38Q8NB14 1042 aa8.34□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 TRIB2Q92519 343 aa8.34□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 TATDN2Q93075 761 aa8.34□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 ZDHHC15Q96MV8 337 aa8.34□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 SEMA6BQ9H3T3 888 aa8.34□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 IL21Q9HBE4 155 aa8.34□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 CNNM1Q9NRU3 951 aa8.34□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 OGDHLQ9ULD0 1010 aa8.34□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 ZHX2Q9Y6X8 837 aa8.34□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 RLFQ13129 1914 aa8.34□□□□□ -1.07
SMARCE1-201ENST00000264640 TRIM75PA6NK02 468 aa8.33□□□□□ -1.08
SMARCE1-201ENST00000264640 CXCL11O14625 94 aa8.33□□□□□ -1.08
SMARCE1-201ENST00000264640 GFRA3O60609 400 aa8.33□□□□□ -1.08
SMARCE1-201ENST00000264640 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
SMARCE1-201ENST00000264640 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
SMARCE1-201ENST00000264640 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
SMARCE1-201ENST00000264640 SLURP2P0DP57 97 aa8.33□□□□□ -1.08
SMARCE1-201ENST00000264640 NFIAQ12857 509 aa8.33□□□□□ -1.08
SMARCE1-201ENST00000264640 CUL4AQ13619 759 aa8.33□□□□□ -1.08
SMARCE1-201ENST00000264640 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
SMARCE1-201ENST00000264640 MCTP1Q6DN14 999 aa8.33□□□□□ -1.08
SMARCE1-201ENST00000264640 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa8.33□□□□□ -1.08
SMARCE1-201ENST00000264640 LINS1Q8NG48 757 aa8.33□□□□□ -1.08
SMARCE1-201ENST00000264640 MTRQ99707 1265 aa8.33□□□□□ -1.08
SMARCE1-201ENST00000264640 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
SMARCE1-201ENST00000264640 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa8.33□□□□□ -1.08
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF112Q9UJU3 913 aa8.33□□□□□ -1.08
SMARCE1-201ENST00000264640 COL6A1P12109 1028 aa8.32□□□□□ -1.08
SMARCE1-201ENST00000264640 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC173Q0VFZ6 552 aa8.32□□□□□ -1.08
SMARCE1-201ENST00000264640 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa8.32□□□□□ -1.08
SMARCE1-201ENST00000264640 EPHA10Q5JZY3 1008 aa8.32□□□□□ -1.08
SMARCE1-201ENST00000264640 C9orf50Q5SZB4 431 aa8.32□□□□□ -1.08
SMARCE1-201ENST00000264640 TREML2Q5T2D2 321 aa8.32□□□□□ -1.08
SMARCE1-201ENST00000264640 FKBP1CQ5VVH2 108 aa8.32□□□□□ -1.08
SMARCE1-201ENST00000264640 TRAF7Q6Q0C0 670 aa8.32□□□□□ -1.08
SMARCE1-201ENST00000264640 LMBR1LQ6UX01 489 aa8.32□□□□□ -1.08
SMARCE1-201ENST00000264640 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
SMARCE1-201ENST00000264640 VPS37DQ86XT2 251 aa8.32□□□□□ -1.08
SMARCE1-201ENST00000264640 ZFPM1Q8IX07 1006 aa8.32□□□□□ -1.08
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM151AQ8WW52 585 aa8.32□□□□□ -1.08
SMARCE1-201ENST00000264640 TMX3Q96JJ7 454 aa8.32□□□□□ -1.08
SMARCE1-201ENST00000264640 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
SMARCE1-201ENST00000264640 PRKD2Q9BZL6 878 aa8.32□□□□□ -1.08
SMARCE1-201ENST00000264640 PICK1Q9NRD5 415 aa8.32□□□□□ -1.08
SMARCE1-201ENST00000264640 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa8.32□□□□□ -1.08
SMARCE1-201ENST00000264640 MYO9BQ13459 2157 aa8.31□□□□□ -1.08
SMARCE1-201ENST00000264640 SGSM2O43147 1006 aa8.31□□□□□ -1.08
SMARCE1-201ENST00000264640 PEX10O60683 326 aa8.31□□□□□ -1.08
SMARCE1-201ENST00000264640 PTPRAP18433 802 aa8.31□□□□□ -1.08
SMARCE1-201ENST00000264640 CYP2B6P20813 491 aa8.31□□□□□ -1.08
SMARCE1-201ENST00000264640 HSPA4P34932 840 aa8.31□□□□□ -1.08
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF445P59923 1031 aa8.31□□□□□ -1.08
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