RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250495.9

NEDD8-201, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD8, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-201ENST00000250495 CCL14Q16627 93 aa25.34■■□□□ 1.65
NEDD8-201ENST00000250495 DCTPP1Q9H773 170 aa25.34■■□□□ 1.65
NEDD8-201ENST00000250495 SH2D4AQ9H788 454 aa25.34■■□□□ 1.65
NEDD8-201ENST00000250495 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa25.34■■□□□ 1.65
NEDD8-201ENST00000250495 CDK8P49336 464 aa25.33■■□□□ 1.65
NEDD8-201ENST00000250495 LPAR1Q92633 364 aa25.33■■□□□ 1.65
NEDD8-201ENST00000250495 TANGO6Q9C0B7 1094 aa25.33■■□□□ 1.65
NEDD8-201ENST00000250495 C11orf49Q9H6J7 331 aa25.33■■□□□ 1.65
NEDD8-201ENST00000250495 MYH7P12883 1935 aa25.32■■□□□ 1.64
NEDD8-201ENST00000250495 MYH8P13535 1937 aa25.32■■□□□ 1.64
NEDD8-201ENST00000250495 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
NEDD8-201ENST00000250495 AKR1B1P15121 316 aa25.32■■□□□ 1.64
NEDD8-201ENST00000250495 MFSD14CQ5VZR4 134 aa25.32■■□□□ 1.64
NEDD8-201ENST00000250495 GPATCH3Q96I76 525 aa25.32■■□□□ 1.64
NEDD8-201ENST00000250495 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
NEDD8-201ENST00000250495 TMX2Q9Y320 296 aa25.32■■□□□ 1.64
NEDD8-201ENST00000250495 CHGBP05060 677 aa25.31■■□□□ 1.64
NEDD8-201ENST00000250495 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
NEDD8-201ENST00000250495 ICA1Q05084 483 aa25.31■■□□□ 1.64
NEDD8-201ENST00000250495 C16orf86Q6ZW13 317 aa25.31■■□□□ 1.64
NEDD8-201ENST00000250495 PRO3102Q9H379 93 aa25.31■■□□□ 1.64
NEDD8-201ENST00000250495 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa25.3■■□□□ 1.64
NEDD8-201ENST00000250495 HOXC6P09630 235 aa25.3■■□□□ 1.64
NEDD8-201ENST00000250495 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
NEDD8-201ENST00000250495 ATP2B2Q01814 1243 aa25.3■■□□□ 1.64
NEDD8-201ENST00000250495 GRB14Q14449 540 aa25.3■■□□□ 1.64
NEDD8-201ENST00000250495 SIAH1Q8IUQ4 282 aa25.3■■□□□ 1.64
NEDD8-201ENST00000250495 MB21D1Q8N884 522 aa25.3■■□□□ 1.64
NEDD8-201ENST00000250495 STRNO43815 780 aa25.29■■□□□ 1.64
NEDD8-201ENST00000250495 DSG3P32926 999 aa25.29■■□□□ 1.64
NEDD8-201ENST00000250495 LHX8Q68G74 356 aa25.29■■□□□ 1.64
NEDD8-201ENST00000250495 CTR9Q6PD62 1173 aa25.29■■□□□ 1.64
NEDD8-201ENST00000250495 VCPKMTQ9H867 229 aa25.29■■□□□ 1.64
NEDD8-201ENST00000250495 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa25.28■■□□□ 1.64
NEDD8-201ENST00000250495 KBTBD3Q8NAB2 608 aa25.28■■□□□ 1.64
NEDD8-201ENST00000250495 SHCBP1Q8NEM2 672 aa25.28■■□□□ 1.64
NEDD8-201ENST00000250495 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
NEDD8-201ENST00000250495 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
NEDD8-201ENST00000250495 SPATC1LQ9H0A9 340 aa25.28■■□□□ 1.64
NEDD8-201ENST00000250495 KANSL2Q9H9L4 492 aa25.28■■□□□ 1.64
NEDD8-201ENST00000250495 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
NEDD8-201ENST00000250495 A0A1W2PPC1 479 aa25.27■■□□□ 1.64
NEDD8-201ENST00000250495 FLOT1O75955 427 aa25.27■■□□□ 1.64
NEDD8-201ENST00000250495 DPP9Q86TI2 863 aa25.27■■□□□ 1.64
NEDD8-201ENST00000250495 C7orf61Q8IZ16 206 aa25.27■■□□□ 1.64
NEDD8-201ENST00000250495 SPICE1Q8N0Z3 855 aa25.27■■□□□ 1.64
NEDD8-201ENST00000250495 FLRT1Q9NZU1 646 aa25.27■■□□□ 1.64
NEDD8-201ENST00000250495 ALPK3Q96L96 1907 aa25.26■■□□□ 1.63
NEDD8-201ENST00000250495 SMIM22K7EJ46 135 aa25.26■■□□□ 1.63
NEDD8-201ENST00000250495 WDR46O15213 610 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
NEDD8-201ENST00000250495 GIMAP6Q6P9H5 292 aa25.26■■□□□ 1.63
NEDD8-201ENST00000250495 CLEC10AQ8IUN9 316 aa25.26■■□□□ 1.63
NEDD8-201ENST00000250495 NPLOC4Q8TAT6 608 aa25.26■■□□□ 1.63
NEDD8-201ENST00000250495 EEF2P13639 858 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
NEDD8-201ENST00000250495 ERCC3P19447 782 aa25.25■■□□□ 1.63
NEDD8-201ENST00000250495 SBK1Q52WX2 424 aa25.25■■□□□ 1.63
NEDD8-201ENST00000250495 APPBP2Q92624 585 aa25.25■■□□□ 1.63
NEDD8-201ENST00000250495 MROH8Q9H579 483 aa25.25■■□□□ 1.63
NEDD8-201ENST00000250495 SLC5A4Q9NY91 659 aa25.25■■□□□ 1.63
NEDD8-201ENST00000250495 STAP2Q9UGK3 403 aa25.25■■□□□ 1.63
NEDD8-201ENST00000250495 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
NEDD8-201ENST00000250495 MSCO60682 206 aa25.24■■□□□ 1.63
NEDD8-201ENST00000250495 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
NEDD8-201ENST00000250495 PLS1Q14651 629 aa25.24■■□□□ 1.63
NEDD8-201ENST00000250495 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
NEDD8-201ENST00000250495 RLFQ13129 1914 aa25.24■■□□□ 1.63
NEDD8-201ENST00000250495 COL6A1P12109 1028 aa25.23■■□□□ 1.63
NEDD8-201ENST00000250495 ADORA2AP29274 412 aa25.23■■□□□ 1.63
NEDD8-201ENST00000250495 CNGA1P29973 690 aa25.23■■□□□ 1.63
NEDD8-201ENST00000250495 ATG4CQ96DT6 458 aa25.23■■□□□ 1.63
NEDD8-201ENST00000250495 GOPCQ9HD26 462 aa25.23■■□□□ 1.63
NEDD8-201ENST00000250495 PFASO15067 1338 aa25.22■■□□□ 1.63
NEDD8-201ENST00000250495 GSG1L2A8MUP6 293 aa25.22■■□□□ 1.63
NEDD8-201ENST00000250495 CYP2C19P33261 490 aa25.22■■□□□ 1.63
NEDD8-201ENST00000250495 OLFML2BQ68BL8 750 aa25.22■■□□□ 1.63
NEDD8-201ENST00000250495 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
NEDD8-201ENST00000250495 NCAPG2Q86XI2 1143 aa25.22■■□□□ 1.63
NEDD8-201ENST00000250495 OSBP2Q969R2 916 aa25.22■■□□□ 1.63
NEDD8-201ENST00000250495 MKNK2Q9HBH9 465 aa25.22■■□□□ 1.63
NEDD8-201ENST00000250495 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
NEDD8-201ENST00000250495 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
NEDD8-201ENST00000250495 MINDY4BA8MYZ0 360 aa25.21■■□□□ 1.63
NEDD8-201ENST00000250495 SLC25A27O95847 323 aa25.21■■□□□ 1.63
NEDD8-201ENST00000250495 GNAT2P19087 354 aa25.21■■□□□ 1.63
NEDD8-201ENST00000250495 BMP8BP34820 402 aa25.21■■□□□ 1.63
NEDD8-201ENST00000250495 TSHZ3Q63HK5 1081 aa25.21■■□□□ 1.63
NEDD8-201ENST00000250495 ABRAQ8N0Z2 381 aa25.21■■□□□ 1.63
NEDD8-201ENST00000250495 TTC41PQ6P2S7 1318 aa25.2■■□□□ 1.62
NEDD8-201ENST00000250495 ERC2O15083 957 aa25.2■■□□□ 1.62
NEDD8-201ENST00000250495 IGHA2P01877 340 aa25.2■■□□□ 1.62
NEDD8-201ENST00000250495 GDF15Q99988 308 aa25.2■■□□□ 1.62
NEDD8-201ENST00000250495 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa25.2■■□□□ 1.62
NEDD8-201ENST00000250495 GPAA1O43292 621 aa25.19■■□□□ 1.62
NEDD8-201ENST00000250495 RAD21O60216 631 aa25.19■■□□□ 1.62
NEDD8-201ENST00000250495 FCER1AP12319 257 aa25.19■■□□□ 1.62
NEDD8-201ENST00000250495 TMEM132BQ14DG7 1078 aa25.19■■□□□ 1.62
NEDD8-201ENST00000250495 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP25.19■■□□□ 1.62
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF287Q9HBT7 754 aa25.19■■□□□ 1.62
NEDD8-201ENST00000250495 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa25.19■■□□□ 1.62
NEDD8-201ENST00000250495 A0A0G2JMZ2 1700 aa25.19■■□□□ 1.62
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