RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249499.7

HOXD9-201, Transcript of homeobox D9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD9, Length 1,870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD9-201ENST00000249499 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP26.25■■□□□ 1.79
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HOXD9-201ENST00000249499 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa26.24■■□□□ 1.79
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HOXD9-201ENST00000249499 USP17L4A6NCW7 530 aa26.23■■□□□ 1.79
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HOXD9-201ENST00000249499 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP26.19■■□□□ 1.78
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HOXD9-201ENST00000249499 DPCR1Q3MIW9 517 aa26.18■■□□□ 1.78
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HOXD9-201ENST00000249499 CCDC34Q96HJ3 373 aa26.18■■□□□ 1.78
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HOXD9-201ENST00000249499 PIBF1Q8WXW3 757 aa26.15■■□□□ 1.78
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HOXD9-201ENST00000249499 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
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HOXD9-201ENST00000249499 CYTH3O43739 400 aa26.13■■□□□ 1.77
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HOXD9-201ENST00000249499 PNOCQ13519 176 aa26.13■■□□□ 1.77
HOXD9-201ENST00000249499 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
HOXD9-201ENST00000249499 TRIML1Q8N9V2 468 aa26.13■■□□□ 1.77
HOXD9-201ENST00000249499 SPC24Q8NBT2 197 aa26.13■■□□□ 1.77
HOXD9-201ENST00000249499 EHD4Q9H223 541 aa26.13■■□□□ 1.77
HOXD9-201ENST00000249499 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
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