RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF710Q8N1W2 664 aa30.46■■■□□ 2.47
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC44A5Q8NCS7 719 aa30.46■■■□□ 2.47
CAPNS1-201ENST00000246533 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP30.45■■■□□ 2.47
CAPNS1-201ENST00000246533 SYCP1Q15431 976 aa30.45■■■□□ 2.47
CAPNS1-201ENST00000246533 STK11IPQ8N1F8 1099 aa30.45■■■□□ 2.47
CAPNS1-201ENST00000246533 NECAB1Q8N987 351 aa30.45■■■□□ 2.47
CAPNS1-201ENST00000246533 SPATA32Q96LK8 384 aa30.45■■■□□ 2.47
CAPNS1-201ENST00000246533 CLSTN2Q9H4D0 955 aa30.45■■■□□ 2.47
CAPNS1-201ENST00000246533 HLA-DOAP06340 250 aa30.45■■■□□ 2.46
CAPNS1-201ENST00000246533 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP30.45■■■□□ 2.46
CAPNS1-201ENST00000246533 IFNL3Q8IZI9 196 aa30.45■■■□□ 2.46
CAPNS1-201ENST00000246533 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP30.45■■■□□ 2.46
CAPNS1-201ENST00000246533 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP30.44■■■□□ 2.46
CAPNS1-201ENST00000246533 C12orf60Q5U649 245 aa30.43■■■□□ 2.46
CAPNS1-201ENST00000246533 SERPINB13Q9UIV8 391 aa30.43■■■□□ 2.46
CAPNS1-201ENST00000246533 CTIFO43310 598 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
CAPNS1-201ENST00000246533 OPTNQ96CV9 577 aa30.43■■■□□ 2.46
CAPNS1-201ENST00000246533 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
CAPNS1-201ENST00000246533 PYCARDQ9ULZ3 195 aa30.43■■■□□ 2.46
CAPNS1-201ENST00000246533 CSADQ9Y600 493 aa30.43■■■□□ 2.46
CAPNS1-201ENST00000246533 GABPAQ06546 454 aa30.42■■■□□ 2.46
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC102AQ96A19 550 aa30.42■■■□□ 2.46
CAPNS1-201ENST00000246533 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
CAPNS1-201ENST00000246533 GNAT2P19087 354 aa30.41■■■□□ 2.46
CAPNS1-201ENST00000246533 ECE1P42892 770 aa30.41■■■□□ 2.46
CAPNS1-201ENST00000246533 SPRYD7Q5W111 196 aa30.41■■■□□ 2.46
CAPNS1-201ENST00000246533 PRDM4Q9UKN5 801 aa30.41■■■□□ 2.46
CAPNS1-201ENST00000246533 MINDY4BA8MYZ0 360 aa30.41■■■□□ 2.46
CAPNS1-201ENST00000246533 GDF11O95390 407 aa30.41■■■□□ 2.46
CAPNS1-201ENST00000246533 LIG1P18858 919 aa30.41■■■□□ 2.46
CAPNS1-201ENST00000246533 CDC25BP30305 580 aa30.41■■■□□ 2.46
CAPNS1-201ENST00000246533 TDO2P48775 406 aa30.41■■■□□ 2.46
CAPNS1-201ENST00000246533 TICAM2Q86XR7 235 aa30.41■■■□□ 2.46
CAPNS1-201ENST00000246533 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP30.41■■■□□ 2.46
CAPNS1-201ENST00000246533 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP30.41■■■□□ 2.46
CAPNS1-201ENST00000246533 OTUD5Q96G74 571 aa30.41■■■□□ 2.46
CAPNS1-201ENST00000246533 WNK4Q96J92 1243 aa30.41■■■□□ 2.46
CAPNS1-201ENST00000246533 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
CAPNS1-201ENST00000246533 SHMT1P34896 483 aa30.4■■■□□ 2.46
CAPNS1-201ENST00000246533 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP30.4■■■□□ 2.46
CAPNS1-201ENST00000246533 EHD4Q9H223 541 aa30.4■■■□□ 2.46
CAPNS1-201ENST00000246533 DACT1Q9NYF0 836 aa30.4■■■□□ 2.46
CAPNS1-201ENST00000246533 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP30.39■■■□□ 2.46
CAPNS1-201ENST00000246533 PLA2G4DQ86XP0 818 aa30.39■■■□□ 2.46
CAPNS1-201ENST00000246533 CAP2P40123 477 aa30.39■■■□□ 2.46
CAPNS1-201ENST00000246533 TPRNQ4KMQ1 711 aa30.39■■■□□ 2.46
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKRD7Q92527 254 aa30.39■■■□□ 2.46
CAPNS1-201ENST00000246533 CBX8Q9HC52 389 aa30.39■■■□□ 2.46
CAPNS1-201ENST00000246533 CFAP45Q9UL16 551 aa30.39■■■□□ 2.46
CAPNS1-201ENST00000246533 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
CAPNS1-201ENST00000246533 SPC24Q8NBT2 197 aa30.38■■■□□ 2.45
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM34Q9BYJ4 488 aa30.38■■■□□ 2.45
CAPNS1-201ENST00000246533 ANO6Q4KMQ2 910 aa30.37■■■□□ 2.45
CAPNS1-201ENST00000246533 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
CAPNS1-201ENST00000246533 TATDN1Q6P1N9 297 aa30.37■■■□□ 2.45
CAPNS1-201ENST00000246533 SCYL3Q8IZE3 742 aa30.37■■■□□ 2.45
CAPNS1-201ENST00000246533 SPDYE5A6NIY4 337 aa30.37■■■□□ 2.45
CAPNS1-201ENST00000246533 UNCXA6NJT0 531 aa30.37■■■□□ 2.45
CAPNS1-201ENST00000246533 IRF6O14896 467 aa30.37■■■□□ 2.45
CAPNS1-201ENST00000246533 CTAGE5O15320 804 aa30.37■■■□□ 2.45
CAPNS1-201ENST00000246533 FGAP02671 866 aa30.37■■■□□ 2.45
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF75DP51815 510 aa30.37■■■□□ 2.45
CAPNS1-201ENST00000246533 NOGQ13253 232 aa30.37■■■□□ 2.45
CAPNS1-201ENST00000246533 NAPBQ9H115 298 aa30.37■■■□□ 2.45
CAPNS1-201ENST00000246533 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
CAPNS1-201ENST00000246533 PTPRAP18433 802 aa30.36■■■□□ 2.45
CAPNS1-201ENST00000246533 SBK1Q52WX2 424 aa30.36■■■□□ 2.45
CAPNS1-201ENST00000246533 INCENPQ9NQS7 918 aa30.36■■■□□ 2.45
CAPNS1-201ENST00000246533 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP30.36■■■□□ 2.45
CAPNS1-201ENST00000246533 ATAD5Q96QE3 1844 aa30.36■■■□□ 2.45
CAPNS1-201ENST00000246533 NEMFO60524 1076 aa30.35■■■□□ 2.45
CAPNS1-201ENST00000246533 PDCL2Q8N4E4 241 aa30.35■■■□□ 2.45
CAPNS1-201ENST00000246533 GTF3C6Q969F1 213 aa30.35■■■□□ 2.45
CAPNS1-201ENST00000246533 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
CAPNS1-201ENST00000246533 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa30.35■■■□□ 2.45
CAPNS1-201ENST00000246533 DOCK1Q14185 1865 aa30.35■■■□□ 2.45
CAPNS1-201ENST00000246533 ATL3Q6DD88 541 aa30.35■■■□□ 2.45
CAPNS1-201ENST00000246533 FERMT3Q86UX7 667 aa30.35■■■□□ 2.45
CAPNS1-201ENST00000246533 LUZP1Q86V48 1076 aa30.35■■■□□ 2.45
CAPNS1-201ENST00000246533 ERO1BQ86YB8 467 aa30.35■■■□□ 2.45
CAPNS1-201ENST00000246533 JMYQ8N9B5 988 aa30.35■■■□□ 2.45
CAPNS1-201ENST00000246533 TACC3Q9Y6A5 838 aa30.35■■■□□ 2.45
CAPNS1-201ENST00000246533 ZHX2Q9Y6X8 837 aa30.35■■■□□ 2.45
CAPNS1-201ENST00000246533 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
CAPNS1-201ENST00000246533 PTGS1P23219 599 aa30.34■■■□□ 2.45
CAPNS1-201ENST00000246533 CDK8P49336 464 aa30.34■■■□□ 2.45
CAPNS1-201ENST00000246533 CHMP4CQ96CF2 233 aa30.34■■■□□ 2.45
CAPNS1-201ENST00000246533 NACAP1Q9BZK3 213 aa30.34■■■□□ 2.45
CAPNS1-201ENST00000246533 SMTNL1A8MU46 457 aa30.34■■■□□ 2.45
CAPNS1-201ENST00000246533 CAMK4Q16566 473 aa30.34■■■□□ 2.45
CAPNS1-201ENST00000246533 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
CAPNS1-201ENST00000246533 MAP2K2P36507 400 aa30.33■■■□□ 2.45
CAPNS1-201ENST00000246533 DMTNQ08495 405 aa30.33■■■□□ 2.45
CAPNS1-201ENST00000246533 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP30.33■■■□□ 2.45
CAPNS1-201ENST00000246533 SARM1Q6SZW1 724 aa30.33■■■□□ 2.45
CAPNS1-201ENST00000246533 C16orf86Q6ZW13 317 aa30.33■■■□□ 2.45
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM5Q9C035 493 aa30.33■■■□□ 2.45
CAPNS1-201ENST00000246533 PICK1Q9NRD5 415 aa30.33■■■□□ 2.45
CAPNS1-201ENST00000246533 PHIPQ8WWQ0 1821 aa30.33■■■□□ 2.45
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