RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
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ODC1-201ENST00000234111 ATG9AQ7Z3C6 839 aa23.86■■□□□ 1.41
ODC1-201ENST00000234111 C14orf37Q86TY3 774 aa23.86■■□□□ 1.41
ODC1-201ENST00000234111 SLC26A6Q9BXS9 759 aa23.86■■□□□ 1.41
ODC1-201ENST00000234111 KCNJ14Q9UNX9 436 aa23.86■■□□□ 1.41
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ODC1-201ENST00000234111 WLSQ5T9L3 541 aa23.82■■□□□ 1.4
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ODC1-201ENST00000234111 NFXL1Q6ZNB6 911 aa23.81■■□□□ 1.4
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ODC1-201ENST00000234111 DUSP10Q9Y6W6 482 aa23.81■■□□□ 1.4
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ODC1-201ENST00000234111 IP6K1Q92551 441 aa23.8■■□□□ 1.4
ODC1-201ENST00000234111 ZIM3Q96PE6 472 aa23.8■■□□□ 1.4
ODC1-201ENST00000234111 EPN3Q9H201 632 aa23.8■■□□□ 1.4
ODC1-201ENST00000234111 KRT86O43790 486 aa23.8■■□□□ 1.4
ODC1-201ENST00000234111 NEBLO76041 1014 aa23.8■■□□□ 1.4
ODC1-201ENST00000234111 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP23.8■■□□□ 1.4
ODC1-201ENST00000234111 APBA1Q02410 837 aa23.8■■□□□ 1.4
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