RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222305.7

USF2-201, Transcript of upstream transcription factor 2, c-fos interacting, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USF2, Length 1,634 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2-201ENST00000222305 RCAN1P53805 252 aa26.84■■□□□ 1.89
USF2-201ENST00000222305 RTN1Q16799 776 aa26.84■■□□□ 1.89
USF2-201ENST00000222305 CHADLQ6NUI6 762 aa26.84■■□□□ 1.89
USF2-201ENST00000222305 FANCBQ8NB91 859 aa26.84■■□□□ 1.89
USF2-201ENST00000222305 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
USF2-201ENST00000222305 A0A1W2PRG0 241 aa26.83■■□□□ 1.89
USF2-201ENST00000222305 CALM1P0DP23 149 aa26.83■■□□□ 1.89
USF2-201ENST00000222305 CALM2P0DP24 149 aa26.83■■□□□ 1.89
USF2-201ENST00000222305 CALM3P0DP25 149 aa26.83■■□□□ 1.89
USF2-201ENST00000222305 ECE1P42892 770 aa26.83■■□□□ 1.89
USF2-201ENST00000222305 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
USF2-201ENST00000222305 ACER1Q8TDN7 264 aa26.83■■□□□ 1.89
USF2-201ENST00000222305 MKL1Q969V6 931 aa26.83■■□□□ 1.88
USF2-201ENST00000222305 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.88
USF2-201ENST00000222305 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa26.83■■□□□ 1.88
USF2-201ENST00000222305 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
USF2-201ENST00000222305 PPFIA3O75145 1194 aa26.82■■□□□ 1.88
USF2-201ENST00000222305 CTDNEP1O95476 244 aa26.82■■□□□ 1.88
USF2-201ENST00000222305 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
USF2-201ENST00000222305 GINM1Q9NU53 330 aa26.82■■□□□ 1.88
USF2-201ENST00000222305 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
USF2-201ENST00000222305 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
USF2-201ENST00000222305 IREB2P48200 963 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
USF2-201ENST00000222305 VGLL4Q14135 290 aa26.81■■□□□ 1.88
USF2-201ENST00000222305 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
USF2-201ENST00000222305 PICK1Q9NRD5 415 aa26.81■■□□□ 1.88
USF2-201ENST00000222305 CPLX1O14810 134 aa26.8■■□□□ 1.88
USF2-201ENST00000222305 RAD21O60216 631 aa26.8■■□□□ 1.88
USF2-201ENST00000222305 JAK2O60674 1132 aa26.8■■□□□ 1.88
USF2-201ENST00000222305 MAP3K9P80192 1104 aa26.8■■□□□ 1.88
USF2-201ENST00000222305 GRM4Q14833 912 aa26.8■■□□□ 1.88
USF2-201ENST00000222305 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
USF2-201ENST00000222305 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
USF2-201ENST00000222305 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
USF2-201ENST00000222305 PTPRFP10586 1907 aa26.8■■□□□ 1.88
USF2-201ENST00000222305 USP17L5A8MUK1 530 aa26.79■■□□□ 1.88
USF2-201ENST00000222305 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
USF2-201ENST00000222305 PDHBP11177 359 aa26.79■■□□□ 1.88
USF2-201ENST00000222305 PTPRAP18433 802 aa26.79■■□□□ 1.88
USF2-201ENST00000222305 PLEKHA8P1O95397 391 aa26.79■■□□□ 1.88
USF2-201ENST00000222305 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
USF2-201ENST00000222305 USP17L2Q6R6M4 530 aa26.79■■□□□ 1.88
USF2-201ENST00000222305 STAG2Q8N3U4 1231 aa26.79■■□□□ 1.88
USF2-201ENST00000222305 MAD2L2Q9UI95 211 aa26.79■■□□□ 1.88
USF2-201ENST00000222305 SMC3Q9UQE7 1217 aa26.79■■□□□ 1.88
USF2-201ENST00000222305 TMX2Q9Y320 296 aa26.79■■□□□ 1.88
USF2-201ENST00000222305 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa26.79■■□□□ 1.88
USF2-201ENST00000222305 GOLGA8HP0CJ92 632 aa26.78■■□□□ 1.88
USF2-201ENST00000222305 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
USF2-201ENST00000222305 NTRK3Q16288 839 aa26.78■■□□□ 1.88
USF2-201ENST00000222305 MAP3K11Q16584 847 aa26.78■■□□□ 1.88
USF2-201ENST00000222305 ARMC9Q7Z3E5 817 aa26.78■■□□□ 1.88
USF2-201ENST00000222305 MAP3K14Q99558 947 aa26.78■■□□□ 1.88
USF2-201ENST00000222305 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
USF2-201ENST00000222305 CSADQ9Y600 493 aa26.78■■□□□ 1.88
USF2-201ENST00000222305 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
USF2-201ENST00000222305 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa26.77■■□□□ 1.88
USF2-201ENST00000222305 PTPDC1A2A3K4 754 aa26.77■■□□□ 1.88
USF2-201ENST00000222305 KIF5BP33176 963 aa26.77■■□□□ 1.88
USF2-201ENST00000222305 CCDC82Q8N4S0 544 aa26.77■■□□□ 1.88
USF2-201ENST00000222305 DDX11Q96FC9 970 aa26.77■■□□□ 1.88
USF2-201ENST00000222305 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
USF2-201ENST00000222305 F5H6K3 240 aa26.76■■□□□ 1.87
USF2-201ENST00000222305 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
USF2-201ENST00000222305 SNHG28P0DPA3 235 aa26.76■■□□□ 1.87
USF2-201ENST00000222305 GJB2P29033 226 aa26.76■■□□□ 1.87
USF2-201ENST00000222305 KLRC3Q07444 240 aa26.76■■□□□ 1.87
USF2-201ENST00000222305 PPP2R5BQ15173 497 aa26.76■■□□□ 1.87
USF2-201ENST00000222305 SLFN13Q68D06 897 aa26.76■■□□□ 1.87
USF2-201ENST00000222305 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa26.76■■□□□ 1.87
USF2-201ENST00000222305 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa26.76■■□□□ 1.87
USF2-201ENST00000222305 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa26.76■■□□□ 1.87
USF2-201ENST00000222305 PHKBQ93100 1093 aa26.76■■□□□ 1.87
USF2-201ENST00000222305 CLMNQ96JQ2 1002 aa26.76■■□□□ 1.87
USF2-201ENST00000222305 FEZ1Q99689 392 aa26.76■■□□□ 1.87
USF2-201ENST00000222305 UBE2Q2LH0YL09 131 aa26.76■■□□□ 1.87
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USF2-201ENST00000222305 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa26.76■■□□□ 1.87
USF2-201ENST00000222305 TMTC3Q6ZXV5 915 aa26.76■■□□□ 1.87
USF2-201ENST00000222305 ELP3Q9H9T3 547 aa26.76■■□□□ 1.87
USF2-201ENST00000222305 ZHX2Q9Y6X8 837 aa26.76■■□□□ 1.87
USF2-201ENST00000222305 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
USF2-201ENST00000222305 NDUFB10O96000 172 aa26.75■■□□□ 1.87
USF2-201ENST00000222305 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
USF2-201ENST00000222305 SPICE1Q8N0Z3 855 aa26.75■■□□□ 1.87
USF2-201ENST00000222305 SH2D4AQ9H788 454 aa26.75■■□□□ 1.87
USF2-201ENST00000222305 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa26.75■■□□□ 1.87
USF2-201ENST00000222305 IFNAR1P17181 557 aa26.74■■□□□ 1.87
USF2-201ENST00000222305 CCDC96Q2M329 555 aa26.74■■□□□ 1.87
USF2-201ENST00000222305 NBPF11Q86T75 865 aa26.74■■□□□ 1.87
USF2-201ENST00000222305 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
USF2-201ENST00000222305 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa26.74■■□□□ 1.87
USF2-201ENST00000222305 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
USF2-201ENST00000222305 AS3MTQ9HBK9 375 aa26.74■■□□□ 1.87
USF2-201ENST00000222305 GOPCQ9HD26 462 aa26.74■■□□□ 1.87
USF2-201ENST00000222305 CDKL5O76039 1030 aa26.73■■□□□ 1.87
USF2-201ENST00000222305 TOMM70O94826 608 aa26.73■■□□□ 1.87
USF2-201ENST00000222305 ZNF543Q08ER8 600 aa26.73■■□□□ 1.87
USF2-201ENST00000222305 SPP2Q13103 211 aa26.73■■□□□ 1.87
USF2-201ENST00000222305 DGKZQ13574 1117 aa26.73■■□□□ 1.87
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