RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000174113.7

Sumo3-209, Transcript of Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene Sumo3, Length 512 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Dpp9Q8BVG4 862 aa22.97■■□□□ 1.27
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Cetn4Q8K4K1 168 aa22.97■■□□□ 1.27
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Pcgf6Q99NA9 353 aa22.97■■□□□ 1.27
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Mettl16Q9CQG2 553 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
Sumo3-209ENSMUST00000174113 A430078G23RikE9Q7Y4 484 aa22.96■■□□□ 1.27
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Kiaa1211Q5PR69 1207 aa22.96■■□□□ 1.27
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Zswim3Q8CFL8 695 aa22.96■■□□□ 1.27
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Ttll1Q91V51 423 aa22.96■■□□□ 1.27
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Ppp1r9aH3BJD6 1292 aa22.95■■□□□ 1.26
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Ftl1P29391 183 aa22.95■■□□□ 1.26
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Cyp2c39P56656 490 aa22.95■■□□□ 1.26
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Q3TYL0 343 aa22.95■■□□□ 1.26
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Tpd52Q62393 224 aa22.95■■□□□ 1.26
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Tacc1Q6Y685 774 aa22.95■■□□□ 1.26
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Tdrd3Q91W18 743 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Ivns1abpQ920Q8 642 aa22.95■■□□□ 1.26
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Mfap1aC0HKD8 439 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Mfap1bC0HKD9 439 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Zscan18E9PUD6 809 aa22.94■■□□□ 1.26
Sumo3-209ENSMUST00000174113 AoahO35298 574 aa22.94■■□□□ 1.26
Sumo3-209ENSMUST00000174113 SqleP52019 572 aa22.94■■□□□ 1.26
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Zfp957Q3UT76 567 aa22.94■■□□□ 1.26
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Nek11Q8C0Q4 628 aa22.94■■□□□ 1.26
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Pspc1Q8R326 523 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Xrn2Q9DBR1 951 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
Sumo3-209ENSMUST00000174113 SerhlQ9EPB5 311 aa22.94■■□□□ 1.26
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Clip2Q9Z0H8 1047 aa22.94■■□□□ 1.26
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Rabgap1A2AWA9 1064 aa22.93■■□□□ 1.26
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Gm3138K7N754 218 aa22.93■■□□□ 1.26
Sumo3-209ENSMUST00000174113 TxnP10639 105 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Filip1lQ6P6L0 1131 aa22.93■■□□□ 1.26
Sumo3-209ENSMUST00000174113 BcrQ6PAJ1 1270 aa22.93■■□□□ 1.26
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Ube2q1Q7TSS2 422 aa22.93■■□□□ 1.26
Sumo3-209ENSMUST00000174113 GlmnQ8BZM1 596 aa22.93■■□□□ 1.26
Sumo3-209ENSMUST00000174113 RptorQ8K4Q0 1335 aa22.92■■□□□ 1.26
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Gml2G5E8L7 176 aa22.92■■□□□ 1.26
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Hand2Q61039 217 aa22.92■■□□□ 1.26
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Cep131Q62036 1060 aa22.92■■□□□ 1.26
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Copb2O55029 905 aa22.91■■□□□ 1.26
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Nmt2O70311 529 aa22.91■■□□□ 1.26
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Cd3dP04235 173 aa22.91■■□□□ 1.26
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Hoxc6P10629 235 aa22.91■■□□□ 1.26
Sumo3-209ENSMUST00000174113 GabpaQ00422 454 aa22.91■■□□□ 1.26
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Tekt3Q6X6Z7 490 aa22.91■■□□□ 1.26
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Htatsf1Q8BGC0 757 aa22.91■■□□□ 1.26
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Trmt112Q9DCG9 125 aa22.91■■□□□ 1.26
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Btbd1P58544 488 aa22.9■■□□□ 1.26
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Nploc4P60670 608 aa22.9■■□□□ 1.26
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Tshz1Q5DTH5 1084 aa22.9■■□□□ 1.26
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Ecm1Q61508 559 aa22.9■■□□□ 1.26
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Tbc1d10bQ8BHL3 798 aa22.9■■□□□ 1.26
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Shisa4Q8CA71 197 aa22.9■■□□□ 1.26
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Alppl2P24823 529 aa22.89■■□□□ 1.25
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Lig1P37913 916 aa22.89■■□□□ 1.25
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Adgrg6Q6F3F9 1165 aa22.89■■□□□ 1.25
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Pgrmc2Q80UU9 217 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Spata7Q80VP2 582 aa22.89■■□□□ 1.25
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Ms4a5Q810P8 197 aa22.89■■□□□ 1.25
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Bclaf1Q8K019 919 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Fez1Q8K0X8 392 aa22.89■■□□□ 1.25
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Pof1bQ8K4L4 587 aa22.89■■□□□ 1.25
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Bst2Q8R2Q8 172 aa22.89■■□□□ 1.25
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Atl3Q91YH5 541 aa22.89■■□□□ 1.25
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Sh2b2Q9JID9 621 aa22.89■■□□□ 1.25
Sumo3-209ENSMUST00000174113 PatjQ63ZW7 1834 aa22.88■■□□□ 1.25
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Pnmal2G3X9N3 661 aa22.88■■□□□ 1.25
Sumo3-209ENSMUST00000174113 MecomP14404 1042 aa22.88■■□□□ 1.25
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Tph1P17532 447 aa22.88■■□□□ 1.25
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Cyp26b1Q811W2 512 aa22.88■■□□□ 1.25
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Senp7Q8BUH8 1037 aa22.88■■□□□ 1.25
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Gprasp2Q8BUY8 826 aa22.88■■□□□ 1.25
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Arhgef6Q8K4I3 771 aa22.88■■□□□ 1.25
Sumo3-209ENSMUST00000174113 StrbpQ91WM1 672 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
Sumo3-209ENSMUST00000174113 PhaxQ9JJT9 385 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Tjp3Q9QXY1 905 aa22.88■■□□□ 1.25
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Scn3aA2ASI5 1947 aa22.88■■□□□ 1.25
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Btnl4A2CG29 586 aa22.87■■□□□ 1.25
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Slc4a3P16283 1227 aa22.87■■□□□ 1.25
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Stat3P42227 770 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Hmgcs2P54869 508 aa22.87■■□□□ 1.25
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Ptpn18Q61152 453 aa22.87■■□□□ 1.25
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Morc2bQ8C5W4 1022 aa22.87■■□□□ 1.25
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Nr3c2Q8VII8 978 aa22.87■■□□□ 1.25
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Lrrfip2Q91WK0 415 aa22.87■■□□□ 1.25
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Dnajc17Q91WT4 303 aa22.87■■□□□ 1.25
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Smc1bQ920F6 1248 aa22.87■■□□□ 1.25
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Pidd1Q9ERV7 915 aa22.87■■□□□ 1.25
Sumo3-209ENSMUST00000174113 NfiaQ02780 532 aa22.86■■□□□ 1.25
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Usp17leQ7M764 540 aa22.86■■□□□ 1.25
Sumo3-209ENSMUST00000174113 DnerQ8JZM4 737 aa22.86■■□□□ 1.25
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Slc4a8Q8JZR6 1089 aa22.86■■□□□ 1.25
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Ero1aQ8R180 464 aa22.86■■□□□ 1.25
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Pqbp1Q91VJ5 263 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Gmcl1Q920G9 524 aa22.86■■□□□ 1.25
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Fkbp1bQ9Z2I2 108 aa22.86■■□□□ 1.25
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Ppfia1B2RXQ2 1266 aa22.85■■□□□ 1.25
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Slc6a20bO88575 635 aa22.85■■□□□ 1.25
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Traf1P39428 409 aa22.85■■□□□ 1.25
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Babam1Q3UI43 333 aa22.85■■□□□ 1.25
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Miga1Q4QQM5 600 aa22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 20.2 ms