RNA–Protein interactions for RNA: YHR119W

SET1, Transcript of Histone methyltransferase, subunit of the COMPASS (Set1C) complex, yeast

Gene SET1, Length 3,243 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SET1	YHR119W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	SUR2	P38992	349 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	SCC4	P40090	624 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	YGL138C	P53122	345 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	YGR111W	P53265	400 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	DAM1	P53267	343 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	YSA1	Q01976	231 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	PEX29	Q03370	554 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	PPM1	Q04081	328 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	YDR514C	Q04408	483 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	SEC10	Q06245	871 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	PEX19	Q07418	342 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	ULA1	Q12059	462 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	PUS9	Q12069	462 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	UBX3	Q12229	455 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	YLR302C	O13544	120 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	DAP2	P18962	818 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	VPS34	P22543	875 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	REG2	P38232	338 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	BNA6	P43619	295 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.37	□□□□□ -1.87	not detected
SET1	YHR119W	BRO1	P48582	844 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	MRK1	P50873	501 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	YMR102C	Q03177	834 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	BNA7	Q04066	261 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	ROY1	Q04847	553 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	GMC2	Q06201	188 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	SRN2	Q99176	213 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	APM4	Q99186	491 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	UTR1	P21373	530 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	ELM1	P32801	640 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	SEF1	P34228	1148 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	VAC7	P53950	1165 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	SAM50	P53969	484 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	ICL2	Q12031	575 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	YDL109C	Q12103	647 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	YPR089W	O13585	888 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	CMK2	P22517	447 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	STE13	P33894	931 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	FAT1	P38225	669 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	YHR045W	P38775	560 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	VMA22	P38784	181 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	YER085C	P40058	173 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	QDR2	P40474	542 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	MPH1	P40562	993 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	MPS3	P47069	682 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	YNL181W	P53878	407 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	ARP4	P80428	489 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	ARG7	Q04728	441 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	ARO10	Q06408	635 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	GET4	Q12125	312 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	TRP3	P00937	484 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	DOT5	P40553	215 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	LIF1	P53150	421 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	ATP25	Q03153	612 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	ARP10	Q04549	284 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	YLR278C	Q05854	1341 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	GAL4	P04386	881 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	YCK1	P23291	538 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	CTF13	P35203	478 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	YMR262W	P38430	313 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	SSO2	P39926	295 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SET1	YHR119W	PCL6	P40038	420 aa		3.35	□□□□□ -1.87

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