RNA–Protein interactions for RNA: YCL028W

RNQ1, Transcript of [PIN(+)] prion, yeastyeast

Gene RNQ1, Length 1,218 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RNQ1YCL028W PIR1Q03178 341 aa11.27□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W RSC2Q06488 889 aa11.27□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W TRE2Q08693 809 aa11.27□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W DAP1Q12091 152 aa11.27□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W HSP26P15992 214 aaKnown RBP RIP-Chip data11.26□□□□□ -0.61not detected
RNQ1YCL028W IMG2P25642 146 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W HRR25P29295 494 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W RIM1P32445 135 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W LIP5P32875 414 aa11.26□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W CYM1P32898 989 aa11.26□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W STE5P32917 917 aa11.26□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W SWE1P32944 819 aa11.26□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W TYE7P33122 291 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W YHI9P38765 294 aa11.26□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W DUN1P39009 513 aa11.26□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W SEO1P39709 593 aa11.26□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W PAN6P40459 309 aa11.26□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W YNR065CP53751 1116 aa11.26□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W UBX4P54730 416 aa11.26□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W GSF2Q04697 403 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W SLP1Q12232 587 aa11.26□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W KEX2P13134 814 aa11.25□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W SEC14P24280 304 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W PPZ1P26570 692 aa11.25□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W BEM1P29366 551 aa11.25□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W RRP14P36080 434 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W MAK5P38112 773 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W OAF1P39720 1047 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W PEP8P40335 379 aa11.25□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W GYP8P43570 497 aa11.25□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W SIP4P46954 829 aa11.25□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W CSN12P47130 423 aa11.25□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W VEL1P53058 206 aa11.25□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W YGL140CP53120 1219 aa11.25□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W IPI3P53877 555 aa11.25□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W ORC3P54790 616 aa11.25□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W RPL34AP87262 121 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W PET117Q02771 107 aa11.25□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W YPR114WQ06107 315 aa11.25□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W KCS1Q12494 1050 aa11.25□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W RGS2Q99188 309 aa11.25□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W NSP1P14907 823 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W AAD3P25612 363 aa11.24□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W GCD11P32481 527 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W AEP1P32493 518 aa11.24□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W IMP3P32899 183 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W LOS1P33418 1100 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W YKL097CP34245 136 aa11.24□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W CTF13P35203 478 aa11.24□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W GDT1P38301 280 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W MEF2P39677 819 aa11.24□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W REF2P42073 533 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W PYK2P52489 506 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W PEX8P53248 589 aa11.24□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W YDR109CQ04585 715 aa11.24□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W ADY3Q07732 790 aa11.24□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W RSB1Q08417 382 aa11.24□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W FLC1Q08967 793 aa11.24□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W MNE1P24720 663 aa11.23□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W ALY1P36117 915 aa11.23□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W YBR032WP38223 100 aa11.23□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W NEM1P38757 446 aa11.23□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W HOS4P40480 1083 aa11.23□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W TES1P41903 349 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W TDA10P42938 290 aa11.23□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W YJL107CP42947 387 aa11.23□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W FLC3P53121 802 aa11.23□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W MRS2Q01926 470 aa11.23□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W YMR209CQ03648 457 aa11.23□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W TAF11Q04226 346 aa11.23□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W SYT1Q06836 1226 aa11.23□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W CLP1Q08685 445 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W PER33Q12144 273 aa11.23□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W YLR149CQ99296 730 aa11.23□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W RPS14AP06367 137 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W PMA2P19657 947 aa11.22□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W PUP3P25451 205 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W EMC1P25574 760 aa11.22□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W BEM3P32873 1128 aa11.22□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W TOM20P35180 183 aa11.22□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W YBR062CP38239 180 aa11.22□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W RPS14BP39516 138 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W PFK26P40433 827 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W YJR124CP47159 448 aa11.22□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W ARH1P48360 493 aa11.22□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W BUD32P53323 261 aa11.22□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W PRM1P53835 661 aa11.22□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W TFB2Q02939 513 aa11.22□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W YLR177WQ06251 628 aa11.22□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W MCP2Q06567 569 aa11.22□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W RAD59Q12223 238 aa11.22□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W YMR030W-AQ3E760 96 aa11.22□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W LEU1P07264 779 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W GCY1P14065 312 aaKnown RBP RIP-Chip data11.21□□□□□ -0.61not detected
RNQ1YCL028W CDC10P25342 322 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W STE13P33894 931 aa11.21□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W PXA2P34230 853 aa11.21□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W SCD5P34758 872 aa11.21□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W RMD8P43620 662 aa11.21□□□□□ -0.61
RNQ1YCL028W PAN2P53010 1115 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
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