RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635861.1

CLN3-241, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 5

Gene CLN3, Length 1,404 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-241ENST00000635861 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.31■■□□□ 1.16
CLN3-241ENST00000635861 USP17L19D6RCP7 530 aa22.31■■□□□ 1.16
CLN3-241ENST00000635861 USP17L20D6RJB6 530 aa22.31■■□□□ 1.16
CLN3-241ENST00000635861 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
CLN3-241ENST00000635861 USP17L24Q0WX57 530 aa22.31■■□□□ 1.16
CLN3-241ENST00000635861 TXNRD2Q9NNW7 524 aa22.31■■□□□ 1.16
CLN3-241ENST00000635861 COG6Q9Y2V7 657 aa22.31■■□□□ 1.16
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CLN3-241ENST00000635861 ZNF532Q9HCE3 1301 aa22.3■■□□□ 1.16
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CLN3-241ENST00000635861 GABPAQ06546 454 aa22.3■■□□□ 1.16
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CLN3-241ENST00000635861 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa22.29■■□□□ 1.16
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CLN3-241ENST00000635861 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa22.29■■□□□ 1.16
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CLN3-241ENST00000635861 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa22.29■■□□□ 1.16
CLN3-241ENST00000635861 TRIB2Q92519 343 aa22.29■■□□□ 1.16
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CLN3-241ENST00000635861 PLEKHH3Q7Z736 793 aa22.28■■□□□ 1.16
CLN3-241ENST00000635861 USP6NLQ92738 828 aa22.28■■□□□ 1.16
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CLN3-241ENST00000635861 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
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CLN3-241ENST00000635861 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
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CLN3-241ENST00000635861 UBE3CQ15386 1083 aa22.23■■□□□ 1.15
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CLN3-241ENST00000635861 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.23■■□□□ 1.15
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CLN3-241ENST00000635861 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
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CLN3-241ENST00000635861 CCDC17Q96LX7 622 aa22.21■■□□□ 1.15
CLN3-241ENST00000635861 C11orf49Q9H6J7 331 aa22.21■■□□□ 1.15
CLN3-241ENST00000635861 ARMT1Q9H993 441 aa22.21■■□□□ 1.15
CLN3-241ENST00000635861 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa22.21■■□□□ 1.15
CLN3-241ENST00000635861 MBD4O95243 580 aa22.2■■□□□ 1.14
CLN3-241ENST00000635861 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
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