RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620030.1

PPP1CC-211, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

TSL 2

Gene PPP1CC, Length 582 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-211ENST00000620030 FEZ1Q99689 392 aa28.38■■■□□ 2.13
PPP1CC-211ENST00000620030 SWAP70Q9UH65 585 aa28.38■■■□□ 2.13
PPP1CC-211ENST00000620030 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
PPP1CC-211ENST00000620030 USP17L12C9JPN9 530 aa28.37■■■□□ 2.13
PPP1CC-211ENST00000620030 USP17L21D6R901 530 aa28.37■■■□□ 2.13
PPP1CC-211ENST00000620030 SMIM22K7EJ46 135 aa28.37■■■□□ 2.13
PPP1CC-211ENST00000620030 GJB1P08034 283 aa28.37■■■□□ 2.13
PPP1CC-211ENST00000620030 Q3C1V9 767 aa28.37■■■□□ 2.13
PPP1CC-211ENST00000620030 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa28.37■■■□□ 2.13
PPP1CC-211ENST00000620030 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa28.37■■■□□ 2.13
PPP1CC-211ENST00000620030 DOCK3Q8IZD9 2030 aa28.36■■■□□ 2.13
PPP1CC-211ENST00000620030 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa28.36■■■□□ 2.13
PPP1CC-211ENST00000620030 USP17L15C9J2P7 530 aa28.36■■■□□ 2.13
PPP1CC-211ENST00000620030 USP17L13C9JLJ4 530 aa28.36■■■□□ 2.13
PPP1CC-211ENST00000620030 USP17L11C9JVI0 530 aa28.36■■■□□ 2.13
PPP1CC-211ENST00000620030 USP17L18D6R9N7 530 aa28.36■■■□□ 2.13
PPP1CC-211ENST00000620030 USP17L22D6RA61 530 aa28.36■■■□□ 2.13
PPP1CC-211ENST00000620030 USP17L17D6RBQ6 530 aa28.36■■■□□ 2.13
PPP1CC-211ENST00000620030 USP17L19D6RCP7 530 aa28.36■■■□□ 2.13
PPP1CC-211ENST00000620030 USP17L20D6RJB6 530 aa28.36■■■□□ 2.13
PPP1CC-211ENST00000620030 USP17L24Q0WX57 530 aa28.36■■■□□ 2.13
PPP1CC-211ENST00000620030 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa28.36■■■□□ 2.13
PPP1CC-211ENST00000620030 SHISA4Q96DD7 197 aa28.36■■■□□ 2.13
PPP1CC-211ENST00000620030 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
PPP1CC-211ENST00000620030 RNF208Q9H0X6 261 aa28.36■■■□□ 2.13
PPP1CC-211ENST00000620030 NAV1Q8NEY1 1877 aa28.36■■■□□ 2.13
PPP1CC-211ENST00000620030 A0A1W2PRG0 241 aa28.35■■■□□ 2.13
PPP1CC-211ENST00000620030 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
PPP1CC-211ENST00000620030 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
PPP1CC-211ENST00000620030 UNC93B1Q9H1C4 597 aa28.35■■■□□ 2.13
PPP1CC-211ENST00000620030 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
PPP1CC-211ENST00000620030 VCAM1P19320 739 aa28.34■■■□□ 2.13
PPP1CC-211ENST00000620030 GJA8P48165 433 aa28.34■■■□□ 2.13
PPP1CC-211ENST00000620030 CTR9Q6PD62 1173 aa28.34■■■□□ 2.13
PPP1CC-211ENST00000620030 NKX2-3Q8TAU0 364 aa28.34■■■□□ 2.13
PPP1CC-211ENST00000620030 OSBP2Q969R2 916 aa28.34■■■□□ 2.13
PPP1CC-211ENST00000620030 TTC41PQ6P2S7 1318 aa28.34■■■□□ 2.13
PPP1CC-211ENST00000620030 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
PPP1CC-211ENST00000620030 INHAP05111 366 aa28.33■■■□□ 2.13
PPP1CC-211ENST00000620030 CDK8P49336 464 aa28.33■■■□□ 2.13
PPP1CC-211ENST00000620030 ERVK-9P63128 1117 aa28.33■■■□□ 2.13
PPP1CC-211ENST00000620030 ERVK-24P63145 666 aa28.33■■■□□ 2.13
PPP1CC-211ENST00000620030 TMEM179Q6ZVK1 233 aa28.33■■■□□ 2.13
PPP1CC-211ENST00000620030 SIAH1Q8IUQ4 282 aa28.33■■■□□ 2.13
PPP1CC-211ENST00000620030 PI4K2BQ8TCG2 481 aa28.33■■■□□ 2.13
PPP1CC-211ENST00000620030 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
PPP1CC-211ENST00000620030 C16orf86Q6ZW13 317 aa28.32■■■□□ 2.12
PPP1CC-211ENST00000620030 APPBP2Q92624 585 aa28.32■■■□□ 2.12
PPP1CC-211ENST00000620030 DDRGK1Q96HY6 314 aa28.32■■■□□ 2.12
PPP1CC-211ENST00000620030 CNMDO75829 334 aa28.31■■■□□ 2.12
PPP1CC-211ENST00000620030 AKR1B1P15121 316 aa28.31■■■□□ 2.12
PPP1CC-211ENST00000620030 AMOTL1Q8IY63 956 aa28.31■■■□□ 2.12
PPP1CC-211ENST00000620030 CCDC17Q96LX7 622 aa28.31■■■□□ 2.12
PPP1CC-211ENST00000620030 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa28.31■■■□□ 2.12
PPP1CC-211ENST00000620030 GSG1L2A8MUP6 293 aa28.3■■■□□ 2.12
PPP1CC-211ENST00000620030 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
PPP1CC-211ENST00000620030 MAPK4P31152 587 aa28.3■■■□□ 2.12
PPP1CC-211ENST00000620030 LBX2Q6XYB7 198 aa28.3■■■□□ 2.12
PPP1CC-211ENST00000620030 PAGR1Q9BTK6 254 aa28.3■■■□□ 2.12
PPP1CC-211ENST00000620030 PORCNQ9H237 461 aa28.3■■■□□ 2.12
PPP1CC-211ENST00000620030 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
PPP1CC-211ENST00000620030 ERC2O15083 957 aa28.29■■■□□ 2.12
PPP1CC-211ENST00000620030 SBK1Q52WX2 424 aa28.29■■■□□ 2.12
PPP1CC-211ENST00000620030 GIMAP6Q6P9H5 292 aa28.29■■■□□ 2.12
PPP1CC-211ENST00000620030 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
PPP1CC-211ENST00000620030 MYH7P12883 1935 aa28.28■■■□□ 2.12
PPP1CC-211ENST00000620030 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
PPP1CC-211ENST00000620030 SGPL1O95470 568 aa28.28■■■□□ 2.12
PPP1CC-211ENST00000620030 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa28.28■■■□□ 2.12
PPP1CC-211ENST00000620030 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa28.28■■■□□ 2.12
PPP1CC-211ENST00000620030 USP6NLQ92738 828 aa28.28■■■□□ 2.12
PPP1CC-211ENST00000620030 SALL3Q9BXA9 1300 aa28.27■■■□□ 2.12
PPP1CC-211ENST00000620030 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
PPP1CC-211ENST00000620030 NUDT12Q9BQG2 462 aa28.27■■■□□ 2.12
PPP1CC-211ENST00000620030 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
PPP1CC-211ENST00000620030 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
PPP1CC-211ENST00000620030 TMX2Q9Y320 296 aa28.27■■■□□ 2.12
PPP1CC-211ENST00000620030 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
PPP1CC-211ENST00000620030 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
PPP1CC-211ENST00000620030 HMGCRP04035 888 aa28.26■■■□□ 2.11
PPP1CC-211ENST00000620030 ANKRD45Q5TZF3 282 aa28.26■■■□□ 2.11
PPP1CC-211ENST00000620030 GPR142Q7Z601 462 aa28.26■■■□□ 2.11
PPP1CC-211ENST00000620030 CLEC10AQ8IUN9 316 aa28.26■■■□□ 2.11
PPP1CC-211ENST00000620030 BTBD7Q9P203 1132 aa28.26■■■□□ 2.11
PPP1CC-211ENST00000620030 M0R2C6 588 aa28.25■■■□□ 2.11
PPP1CC-211ENST00000620030 GPAA1O43292 621 aa28.25■■■□□ 2.11
PPP1CC-211ENST00000620030 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
PPP1CC-211ENST00000620030 MX1P20591 662 aa28.25■■■□□ 2.11
PPP1CC-211ENST00000620030 CYP2B6P20813 491 aa28.25■■■□□ 2.11
PPP1CC-211ENST00000620030 COG2Q14746 738 aa28.25■■■□□ 2.11
PPP1CC-211ENST00000620030 MORN1Q5T089 497 aa28.25■■■□□ 2.11
PPP1CC-211ENST00000620030 PLEKHH3Q7Z736 793 aa28.25■■■□□ 2.11
PPP1CC-211ENST00000620030 SOCS4Q8WXH5 440 aa28.25■■■□□ 2.11
PPP1CC-211ENST00000620030 CAPN2P17655 700 aa28.24■■■□□ 2.11
PPP1CC-211ENST00000620030 ICA1Q05084 483 aa28.24■■■□□ 2.11
PPP1CC-211ENST00000620030 TRIM32Q13049 653 aa28.24■■■□□ 2.11
PPP1CC-211ENST00000620030 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
PPP1CC-211ENST00000620030 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
PPP1CC-211ENST00000620030 GCC1Q96CN9 775 aa28.24■■■□□ 2.11
PPP1CC-211ENST00000620030 DEFB118Q96PH6 123 aa28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.5 ms