RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 CNGA1P29973 690 aa22.46■■□□□ 1.19
CTDP1-208ENST00000613122 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa22.46■■□□□ 1.19
CTDP1-208ENST00000613122 POLR2MP0CAP2 368 aa22.46■■□□□ 1.19
CTDP1-208ENST00000613122 CD19P15391 556 aa22.46■■□□□ 1.19
CTDP1-208ENST00000613122 NELFCDQ8IXH7 590 aa22.46■■□□□ 1.19
CTDP1-208ENST00000613122 MLKLQ8NB16 471 aa22.46■■□□□ 1.19
CTDP1-208ENST00000613122 PNMA2Q9UL42 364 aa22.46■■□□□ 1.19
CTDP1-208ENST00000613122 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
CTDP1-208ENST00000613122 SMC6Q96SB8 1091 aa22.46■■□□□ 1.19
CTDP1-208ENST00000613122 NUP58Q9BVL2 599 aa22.46■■□□□ 1.19
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF804BA4D1E1 1349 aa22.45■■□□□ 1.19
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CTDP1-208ENST00000613122 MCF2L2Q86YR7 1114 aa22.45■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 ICA1Q05084 483 aa22.45■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.45■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 MAP7D1Q3KQU3 841 aa22.45■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 ANKRD35Q8N283 1001 aa22.45■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa22.45■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 UBL4BQ8N7F7 174 aa22.45■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 ATRIPQ8WXE1 791 aa22.45■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 PSTPIP2Q9H939 334 aa22.45■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 XDHP47989 1333 aa22.45■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 TLDC2A0PJX2 215 aa22.44■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 CYP26C1Q6V0L0 522 aa22.44■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa22.44■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 NCAPG2Q86XI2 1143 aa22.44■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa22.44■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 DYNC1I1O14576 645 aa22.44■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 BCRP11274 1271 aa22.44■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 PDE6AP16499 860 aa22.44■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 DCUN1D2Q6PH85 259 aa22.44■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 SDR42E1Q8WUS8 393 aa22.44■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC125Q86Z20 511 aa22.44■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.44■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 SH3BP5O60239 455 aa22.43■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 ALDH3A1P30838 453 aa22.43■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 PSMC4P43686 418 aa22.43■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 CFAP157Q5JU67 520 aa22.43■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 CEP128Q6ZU80 1094 aa22.43■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 CLSTN2Q9H4D0 955 aa22.43■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 SYT10Q6XYQ8 523 aa22.43■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 KRT27Q7Z3Y8 459 aa22.43■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 IWS1Q96ST2 819 aa22.43■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 KCNK9Q9NPC2 374 aa22.43■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 TNNI1P19237 187 aa22.43■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 FAM102BQ5T8I3 360 aa22.43■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 NSMCE1Q8WV22 266 aa22.43■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 ZMYND15Q9H091 742 aa22.43■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF202O95125 648 aa22.42■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 HSPA4P34932 840 aa22.42■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF710Q8N1W2 664 aa22.42■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.42■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC6Q16204 474 aa22.42■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa22.42■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 FBXO11Q86XK2 927 aa22.42■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa22.42■■□□□ 1.18
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CTDP1-208ENST00000613122 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.42■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 ANKS4BQ8N8V4 417 aa22.42■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 FLOT1O75955 427 aa22.42■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 SEC24BO95487 1268 aa22.42■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 RHOXF2BP0C7M4 288 aa22.42■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 POSTNQ15063 836 aa22.42■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 RHOXF2Q9BQY4 288 aa22.42■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.42■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.42■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 NR1I2O75469 434 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
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CTDP1-208ENST00000613122 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 SAMD9Q5K651 1589 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 LEMD3Q9Y2U8 911 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 LRRC24Q50LG9 513 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 PRR16Q569H4 304 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF365Q70YC5 407 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 TMC4Q7Z404 712 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 PNMA1Q8ND90 353 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 GREM2Q9H772 168 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 SERPINB2P05120 415 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 RNF169Q8NCN4 708 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 USP44Q9H0E7 712 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 ABCB5Q2M3G0 1257 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 TICAM2Q86XR7 235 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 CCT6BQ92526 530 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 NELFBQ8WX92 580 aa22.4■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 NLRP12P59046 1061 aa22.4■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 FAM173BQ6P4H8 233 aa22.4■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 BLIDQ8IZY5 108 aa22.4■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 SSH3Q8TE77 659 aa22.4■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 GABPAQ06546 454 aa22.4■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 TRIM7Q9C029 511 aa22.4■■□□□ 1.18
CTDP1-208ENST00000613122 NLRP1Q9C000 1473 aa22.4■■□□□ 1.18
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