RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607707.1

SNORD11B-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 11B, humanhuman

BASIC

Gene SNORD11B, Length 90 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD11B-201ENST00000607707 CDH24Q86UP0 819 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 SPACA3Q8IXA5 215 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 NETO1Q8TDF5 533 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 TMEM40Q8WWA1 233 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 ATG4CQ96DT6 458 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 TNKS2Q9H2K2 1166 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 CNNM2Q9H8M5 875 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 PPT2Q9UMR5 302 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 CEP131Q9UPN4 1083 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 EFR3BQ9Y2G0 817 aa3.58□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 SCO2A0A1W2PP80 73 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 RGS13O14921 159 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 ADAMTS4O75173 837 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 PRNPP04156 253 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 ACRP10323 421 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 NME1P15531 152 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 ITIH2P19823 946 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 NASPP49321 788 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 NLRC3Q7RTR2 1065 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 PHACTR4Q8IZ21 702 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 Q8N3U1 123 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 MFSD4AQ8N468 514 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 VWCEQ96DN2 955 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 COX4I2Q96KJ9 171 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 SPATA32Q96LK8 384 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 CCDC74BQ96LY2 380 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 Q96M66 194 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 FERD3LQ96RJ6 166 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 KIF2CQ99661 725 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 CAPN10Q9HC96 672 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 ZFP64Q9NPA5 681 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 PCMTD2Q9NV79 361 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa3.57□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 GNAT3A8MTJ3 354 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 IMPDH2P12268 514 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 RAG1P15918 1043 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 ETV3P41162 512 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 TNK2Q07912 1038 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 MLECQ14165 292 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 VSIG10LQ86VR7 867 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 RNF141Q8WVD5 230 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 SHDQ96IW2 340 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 KREMEN1Q96MU8 473 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 CCDC39Q9UFE4 941 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 ST14Q9Y5Y6 855 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 CBX7O95931 251 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 FGRP09769 529 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 CYP7A1P22680 504 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 GBP1P32455 592 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 CD96P40200 585 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 CCNFP41002 786 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 KIR3DL1P43629 444 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 GIPRP48546 466 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 CLCN7P51798 805 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 RUFY4Q6ZNE9 571 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 TMEM192Q8IY95 271 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 DTWD2Q8NBA8 298 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 SEC16BQ96JE7 1060 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 SLC9A7Q96T83 725 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 ASPNQ9BXN1 380 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 SEMA3GQ9NS98 782 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 TMEM265A0A087WTH1 108 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 H3BS24 57 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 LRRN2O75325 713 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 GUCY2CP25092 1073 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 PRKCQQ04759 706 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 BNIP3Q12983 259 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 FBXW10Q5XX13 1052 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 PPFIBP1Q86W92 1011 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 FAM169BQ8N8A8 192 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 MISP3Q96FF7 219 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 HRASLS5Q96KN8 279 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 HSPA12BQ96MM6 686 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 SLC6A18Q96N87 628 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 TM9SF2Q99805 663 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP3.54□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 STRIP2Q9ULQ0 834 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD11B-201ENST00000607707 SNX11Q9Y5W9 270 aa3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 6.3 ms