RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607066.1

TRAF3IP2-AS1-212, TRAF3IP2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene TRAF3IP2-AS1, Length 435 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 HMGCS2P54868 508 aa10.14□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 HAND2P61296 217 aa10.14□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 ICA1Q05084 483 aa10.14□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 CLEC10AQ8IUN9 316 aa10.14□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 PTPN18Q99952 460 aa10.14□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 TSKSQ9UJT2 592 aa10.14□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP10.14□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 MGAMO43451 1857 aa10.14□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa10.14□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 A0A0G2JMZ2 1700 aa10.13□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 USP17L10C9JJH3 530 aa10.13□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 MOGSQ13724 837 aa10.13□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 SH3D19Q5HYK7 790 aa10.13□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 ANKRD23Q86SG2 305 aa10.13□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 FAM43AQ8N2R8 423 aa10.13□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 TBC1D32Q96NH3 1257 aa10.13□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa10.13□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 TOMM22Q9NS69 142 aa10.13□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 CTNNA3Q9UI47 895 aa10.13□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa10.13□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 RLFQ13129 1914 aa10.12□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 TSPY2A6NKD2 308 aa10.12□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 C19orf81C9J6K1 198 aa10.12□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 PDHXO00330 501 aa10.12□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 ZNF213O14771 459 aa10.12□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 TBC1D8O95759 1140 aa10.12□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 TSPY3P0CV98 308 aa10.12□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 TSPY8P0CW00 308 aa10.12□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 RBM25P49756 843 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 BACE1P56817 501 aa10.12□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 PTH1RQ03431 593 aa10.12□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 CRHR2Q13324 411 aa10.12□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 DGKZQ13574 1117 aa10.12□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa10.12□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 TBC1D10CQ8IV04 446 aa10.12□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 ACER1Q8TDN7 264 aa10.12□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 STAG1Q8WVM7 1258 aa10.12□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 IL17RAQ96F46 866 aa10.12□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 CFHR5Q9BXR6 569 aa10.12□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 NBPF3Q9H094 633 aa10.12□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa10.12□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 SH2D4AQ9H788 454 aa10.12□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 TMOD4Q9NZQ9 345 aa10.12□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 TACC3Q9Y6A5 838 aa10.12□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 NEDD4P46934 1319 aa10.11□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 ORC4O43929 436 aa10.11□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 PCP11498 1178 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 LBX1P52954 281 aa10.11□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 USP14P54578 494 aa10.11□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 ATP2B2Q01814 1243 aa10.11□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 FAM47AQ5JRC9 791 aa10.11□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 AKNAD1Q5T1N1 836 aa10.11□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 TREML2Q5T2D2 321 aa10.11□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 GPAT2Q6NUI2 795 aa10.11□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 USP17L2Q6R6M4 530 aa10.11□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 MFSD6Q6ZSS7 791 aa10.11□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 C12orf42Q96LP6 360 aa10.11□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP10.11□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 USP26Q9BXU7 913 aa10.11□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 KANSL2Q9H9L4 492 aa10.11□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa10.11□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 ANO2Q9NQ90 1003 aa10.11□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 PNMA3Q9UL41 463 aa10.11□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa10.11□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa10.1□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 A0A1W2PRG0 241 aa10.1□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 FGRP09769 529 aa10.1□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 EEF2P13639 858 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 TFAP4Q01664 338 aa10.1□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP10.1□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 NEDD1Q8NHV4 660 aa10.1□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 MAP4K1Q92918 833 aa10.1□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 CEP95Q96GE4 821 aa10.1□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 INCENPQ9NQS7 918 aa10.1□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 EMILIN3Q9NT22 766 aa10.1□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 TMX2Q9Y320 296 aa10.1□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 ADGRA2Q96PE1 1338 aa10.09□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 TLR2O60603 784 aa10.09□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 CYP2C8P10632 490 aa10.09□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 VCAM1P19320 739 aa10.09□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-212ENST00000607066 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms