RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600058.5

FCHO1-230, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 2

Gene FCHO1, Length 910 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-230ENST00000600058 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
FCHO1-230ENST00000600058 USP17L24Q0WX57 530 aa20.7■□□□□ 0.9
FCHO1-230ENST00000600058 CCDC158Q5M9N0 1113 aa20.7■□□□□ 0.9
FCHO1-230ENST00000600058 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
FCHO1-230ENST00000600058 FLRT1Q9NZU1 646 aa20.7■□□□□ 0.9
FCHO1-230ENST00000600058 VCANP13611 3396 aa20.69■□□□□ 0.9
FCHO1-230ENST00000600058 LTBP2Q14767 1821 aa20.69■□□□□ 0.9
FCHO1-230ENST00000600058 MSCO60682 206 aa20.69■□□□□ 0.9
FCHO1-230ENST00000600058 FEZ1Q99689 392 aa20.69■□□□□ 0.9
FCHO1-230ENST00000600058 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
FCHO1-230ENST00000600058 HOXC6P09630 235 aa20.68■□□□□ 0.9
FCHO1-230ENST00000600058 PTPREP23469 700 aa20.68■□□□□ 0.9
FCHO1-230ENST00000600058 TNNI3KQ59H18 835 aa20.68■□□□□ 0.9
FCHO1-230ENST00000600058 LPAR1Q92633 364 aa20.68■□□□□ 0.9
FCHO1-230ENST00000600058 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
FCHO1-230ENST00000600058 DBNDD2Q9BQY9 259 aa20.68■□□□□ 0.9
FCHO1-230ENST00000600058 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa20.68■□□□□ 0.9
FCHO1-230ENST00000600058 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa20.68■□□□□ 0.9
FCHO1-230ENST00000600058 RLFQ13129 1914 aa20.67■□□□□ 0.9
FCHO1-230ENST00000600058 DNM1LO00429 736 aa20.67■□□□□ 0.9
FCHO1-230ENST00000600058 USP14P54578 494 aa20.67■□□□□ 0.9
FCHO1-230ENST00000600058 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
FCHO1-230ENST00000600058 WDR78Q5VTH9 848 aa20.67■□□□□ 0.9
FCHO1-230ENST00000600058 TATDN1Q6P1N9 297 aa20.67■□□□□ 0.9
FCHO1-230ENST00000600058 LBX2Q6XYB7 198 aa20.67■□□□□ 0.9
FCHO1-230ENST00000600058 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa20.67■□□□□ 0.9
FCHO1-230ENST00000600058 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa20.67■□□□□ 0.9
FCHO1-230ENST00000600058 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
FCHO1-230ENST00000600058 VCAM1P19320 739 aa20.66■□□□□ 0.9
FCHO1-230ENST00000600058 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
FCHO1-230ENST00000600058 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
FCHO1-230ENST00000600058 ATP2B2Q01814 1243 aa20.66■□□□□ 0.9
FCHO1-230ENST00000600058 GRB14Q14449 540 aa20.66■□□□□ 0.9
FCHO1-230ENST00000600058 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
FCHO1-230ENST00000600058 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa20.66■□□□□ 0.9
FCHO1-230ENST00000600058 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa20.66■□□□□ 0.9
FCHO1-230ENST00000600058 TTC28Q96AY4 2481 aa20.66■□□□□ 0.9
FCHO1-230ENST00000600058 TRIM27P14373 513 aa20.65■□□□□ 0.9
FCHO1-230ENST00000600058 CNGA1P29973 690 aa20.65■□□□□ 0.9
FCHO1-230ENST00000600058 ZAP70P43403 619 aa20.65■□□□□ 0.9
FCHO1-230ENST00000600058 CERS3Q8IU89 383 aa20.65■□□□□ 0.9
FCHO1-230ENST00000600058 FAM161BQ96MY7 647 aa20.65■□□□□ 0.9
FCHO1-230ENST00000600058 EHD4Q9H223 541 aa20.65■□□□□ 0.9
FCHO1-230ENST00000600058 BTBD7Q9P203 1132 aa20.65■□□□□ 0.9
FCHO1-230ENST00000600058 SERPINB13Q9UIV8 391 aa20.65■□□□□ 0.9
FCHO1-230ENST00000600058 ZNF236Q9UL36 1845 aa20.64■□□□□ 0.9
FCHO1-230ENST00000600058 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
FCHO1-230ENST00000600058 IGHA2P01877 340 aa20.64■□□□□ 0.89
FCHO1-230ENST00000600058 CYP7A1P22680 504 aa20.64■□□□□ 0.89
FCHO1-230ENST00000600058 CYP2C19P33261 490 aa20.64■□□□□ 0.89
FCHO1-230ENST00000600058 RTP1P59025 263 aa20.64■□□□□ 0.89
FCHO1-230ENST00000600058 RAB3GAP1Q15042 981 aa20.64■□□□□ 0.89
FCHO1-230ENST00000600058 ZNF697Q5TEC3 545 aa20.64■□□□□ 0.89
FCHO1-230ENST00000600058 NPLOC4Q8TAT6 608 aa20.64■□□□□ 0.89
FCHO1-230ENST00000600058 EYSQ5T1H1 3165 aa20.64■□□□□ 0.89
FCHO1-230ENST00000600058 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
FCHO1-230ENST00000600058 CYBAP13498 195 aa20.63■□□□□ 0.89
FCHO1-230ENST00000600058 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
FCHO1-230ENST00000600058 POLA2Q14181 598 aa20.63■□□□□ 0.89
FCHO1-230ENST00000600058 TRPV1Q8NER1 839 aa20.63■□□□□ 0.89
FCHO1-230ENST00000600058 ACER1Q8TDN7 264 aa20.63■□□□□ 0.89
FCHO1-230ENST00000600058 USP5P45974 858 aa20.62■□□□□ 0.89
FCHO1-230ENST00000600058 ABCB5Q2M3G0 1257 aa20.62■□□□□ 0.89
FCHO1-230ENST00000600058 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
FCHO1-230ENST00000600058 TTC6Q86TZ1 520 aa20.62■□□□□ 0.89
FCHO1-230ENST00000600058 MIGA1Q8NAN2 632 aa20.62■□□□□ 0.89
FCHO1-230ENST00000600058 TNNQ9UQP3 1299 aa20.62■□□□□ 0.89
FCHO1-230ENST00000600058 CDH23Q9H251 3354 aa20.61■□□□□ 0.89
FCHO1-230ENST00000600058 IDH1O75874 414 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
FCHO1-230ENST00000600058 ARRDC4Q8NCT1 418 aa20.61■□□□□ 0.89
FCHO1-230ENST00000600058 SSH3Q8TE77 659 aa20.61■□□□□ 0.89
FCHO1-230ENST00000600058 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
FCHO1-230ENST00000600058 CABP5Q9NP86 173 aa20.61■□□□□ 0.89
FCHO1-230ENST00000600058 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
FCHO1-230ENST00000600058 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa20.61■□□□□ 0.89
FCHO1-230ENST00000600058 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
FCHO1-230ENST00000600058 OLFML2BQ68BL8 750 aa20.6■□□□□ 0.89
FCHO1-230ENST00000600058 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
FCHO1-230ENST00000600058 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa20.6■□□□□ 0.89
FCHO1-230ENST00000600058 A0A0G2JMZ2 1700 aa20.59■□□□□ 0.89
FCHO1-230ENST00000600058 KBTBD13C9JR72 458 aa20.59■□□□□ 0.89
FCHO1-230ENST00000600058 SHMT1P34896 483 aa20.59■□□□□ 0.89
FCHO1-230ENST00000600058 SHHQ15465 462 aa20.59■□□□□ 0.89
FCHO1-230ENST00000600058 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
FCHO1-230ENST00000600058 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa20.59■□□□□ 0.89
FCHO1-230ENST00000600058 DPP9Q86TI2 863 aa20.59■□□□□ 0.89
FCHO1-230ENST00000600058 MAGEB6Q8N7X4 407 aa20.59■□□□□ 0.89
FCHO1-230ENST00000600058 CLUAP1Q96AJ1 413 aa20.59■□□□□ 0.89
FCHO1-230ENST00000600058 STRNO43815 780 aa20.58■□□□□ 0.89
FCHO1-230ENST00000600058 SURF6O75683 361 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
FCHO1-230ENST00000600058 ADORA2AP29274 412 aa20.58■□□□□ 0.89
FCHO1-230ENST00000600058 GUCY1A2P33402 732 aa20.58■□□□□ 0.89
FCHO1-230ENST00000600058 SNX17Q15036 470 aa20.58■□□□□ 0.89
FCHO1-230ENST00000600058 C9orf50Q5SZB4 431 aa20.58■□□□□ 0.89
FCHO1-230ENST00000600058 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
FCHO1-230ENST00000600058 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
FCHO1-230ENST00000600058 SEMA6BQ9H3T3 888 aa20.58■□□□□ 0.89
FCHO1-230ENST00000600058 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
FCHO1-230ENST00000600058 NAV1Q8NEY1 1877 aa20.58■□□□□ 0.88
FCHO1-230ENST00000600058 SEPT4O43236 478 aa20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms