RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 CPA1P15085 419 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 USP5P45974 858 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 GSTO1P78417 241 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 CTDSPL2Q05D32 466 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 TEX11Q8IYF3 940 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 AGBL3Q8NEM8 1001 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 VEZTQ9HBM0 779 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 MYOZ2Q9NPC6 264 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 RAD50Q92878 1312 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 MINDY4BA8MYZ0 360 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 H3BM21 787 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 WNT10BO00744 389 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC27A2O14975 620 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 FGAP02671 866 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 PTGDRQ13258 359 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 DLGAP5Q15398 846 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 ADCK5Q3MIX3 580 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 CREB3L3Q68CJ9 461 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 HHIPL2Q6UWX4 724 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 STOX1Q6ZVD7 989 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 TBC1D10CQ8IV04 446 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 IFNL3Q8IZI9 196 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 GPC2Q8N158 579 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC44A5Q8NCS7 719 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 THAP11Q96EK4 314 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 DYNLL2Q96FJ2 89 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 TCEANC2Q96MN5 208 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 ZDHHC15Q96MV8 337 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 C22orf23Q9BZE7 217 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 GPRC5DQ9NZD1 345 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 HDAC9Q9UKV0 1011 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 FLT1P17948 1338 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 MYO3BQ8WXR4 1341 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 LAMB1P07942 1786 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 SIPA1L1O43166 1804 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 LAMA4Q16363 1823 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 FOCADQ5VW36 1801 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 MYH1P12882 1939 aa7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 USP17L12C9JPN9 530 aa7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 USP17L21D6R901 530 aa7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 DTNBO60941 627 aa7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 REC8O95072 547 aa7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 BAG3O95817 575 aa7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 CYP21A2P08686 494 aa7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 TDO2P48775 406 aa7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP7.19□□□□□ -1.26
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CAPNS1-208ENST00000589162 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 MSS51Q4VC12 460 aa7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 CTR9Q6PD62 1173 aa7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 OGFOD1Q8N543 542 aa7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 MAP4K1Q92918 833 aa7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 KIF2CQ99661 725 aa7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 DSCC1Q9BVC3 393 aa7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 NAPBQ9H115 298 aa7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 NMRK2Q9NPI5 230 aa7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 MCM9Q9NXL9 1143 aa7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 SERPINA10Q9UK55 444 aa7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 FZD1Q9UP38 647 aa7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 SNX14Q9Y5W7 946 aa7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 CNTNAP1P78357 1384 aa7.19□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 GLTPD2A6NH11 291 aa7.18□□□□□ -1.26
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CAPNS1-208ENST00000589162 PRDM1O75626 825 aa7.18□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 RPS12P25398 132 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 HSPA4P34932 840 aa7.18□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 PLCD1P51178 756 aa7.18□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 PPARAQ07869 468 aa7.18□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 TRIM32Q13049 653 aa7.18□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 MORN1Q5T089 497 aa7.18□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 CHST3Q7LGC8 479 aa7.18□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 DPF2Q92785 391 aa7.18□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 MRGPRX2Q96LB1 330 aa7.18□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 TBC1D32Q96NH3 1257 aa7.18□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 RRAGCQ9HB90 399 aa7.18□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 GGA3Q9NZ52 723 aa7.18□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CAPNS1-208ENST00000589162 HACL1Q9UJ83 578 aa7.18□□□□□ -1.26
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