RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 FRMPD3Q5JV73 1810 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-205ENST00000588780 GH2P01242 217 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-205ENST00000588780 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-205ENST00000588780 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-205ENST00000588780 MCAMP43121 646 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-205ENST00000588780 POTEEQ6S8J3 1075 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-205ENST00000588780 BADQ92934 168 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-205ENST00000588780 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-205ENST00000588780 SNRKQ9NRH2 765 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-205ENST00000588780 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-205ENST00000588780 CNMDO75829 334 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-205ENST00000588780 ANO1Q5XXA6 986 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-205ENST00000588780 DPP9Q86TI2 863 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-205ENST00000588780 NPLOC4Q8TAT6 608 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-205ENST00000588780 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-205ENST00000588780 RAB3GAP1Q15042 981 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-205ENST00000588780 SIPA1L1O43166 1804 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-205ENST00000588780 USP14P54578 494 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-205ENST00000588780 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP26.7■■□□□ 1.861e-7■■■■■ 27.3
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CAPNS1-205ENST00000588780 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-205ENST00000588780 GNAI3P08754 354 aa26.69■■□□□ 1.86
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CAPNS1-205ENST00000588780 GRB14Q14449 540 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-205ENST00000588780 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa26.69■■□□□ 1.86
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CAPNS1-205ENST00000588780 FERMT2Q96AC1 680 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-205ENST00000588780 C12orf42Q96LP6 360 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-205ENST00000588780 BTBD7Q9P203 1132 aa26.68■■□□□ 1.86
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CAPNS1-205ENST00000588780 CYBAP13498 195 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-205ENST00000588780 ADGRA1Q86SQ6 560 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-205ENST00000588780 DNAH12Q6ZR08 3092 aa26.66■■□□□ 1.86
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CAPNS1-205ENST00000588780 ADCYAP1R1P41586 468 aa26.66■■□□□ 1.86
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CAPNS1-205ENST00000588780 CCDC158Q5M9N0 1113 aa26.66■■□□□ 1.86
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CAPNS1-205ENST00000588780 PDLIM7Q9NR12 457 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-205ENST00000588780 ADORA2AP29274 412 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-205ENST00000588780 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-205ENST00000588780 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-205ENST00000588780 CYP7A1P22680 504 aa26.63■■□□□ 1.85
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CAPNS1-205ENST00000588780 ABCB5Q2M3G0 1257 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-205ENST00000588780 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-205ENST00000588780 ACER1Q8TDN7 264 aa26.63■■□□□ 1.85
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CAPNS1-205ENST00000588780 SEPT4O43236 478 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-205ENST00000588780 COL9A1P20849 921 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-205ENST00000588780 OLFML2BQ68BL8 750 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-205ENST00000588780 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-205ENST00000588780 CDCA7LQ96GN5 454 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC5A4Q9NY91 659 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-205ENST00000588780 SERPINB13Q9UIV8 391 aa26.62■■□□□ 1.85
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CAPNS1-205ENST00000588780 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
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CAPNS1-205ENST00000588780 TATDN1Q6P1N9 297 aa26.6■■□□□ 1.85
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CAPNS1-205ENST00000588780 TMEM265A0A087WTH1 108 aa26.59■■□□□ 1.85
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CAPNS1-205ENST00000588780 FOCADQ5VW36 1801 aa26.58■■□□□ 1.84
CAPNS1-205ENST00000588780 IDH1O75874 414 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-205ENST00000588780 CLTBP09497 229 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-205ENST00000588780 ERCC3P19447 782 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-205ENST00000588780 COG2Q14746 738 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-205ENST00000588780 GRIN2CQ14957 1233 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-205ENST00000588780 FAM47AQ5JRC9 791 aa26.57■■□□□ 1.84
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