RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 CFAP45Q9UL16 551 aa29.66■■■□□ 2.34
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CAPNS1-204ENST00000587718 H3BQV1 296 aa29.64■■■□□ 2.34
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CAPNS1-204ENST00000587718 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
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CAPNS1-204ENST00000587718 IRF6O14896 467 aa29.5■■■□□ 2.31
CAPNS1-204ENST00000587718 ADD1P35611 737 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
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