RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587465.6

TNNT1-208, Transcript of troponin T1, slow skeletal type, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TNNT1, Length 1,065 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1-208ENST00000587465 TTC6Q86TZ1 520 aa23.53■■□□□ 1.36
TNNT1-208ENST00000587465 DEFB118Q96PH6 123 aa23.53■■□□□ 1.36
TNNT1-208ENST00000587465 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
TNNT1-208ENST00000587465 CNMDO75829 334 aa23.52■■□□□ 1.36
TNNT1-208ENST00000587465 PDE3AQ14432 1141 aa23.52■■□□□ 1.36
TNNT1-208ENST00000587465 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
TNNT1-208ENST00000587465 USP17L2Q6R6M4 530 aa23.52■■□□□ 1.36
TNNT1-208ENST00000587465 FEZ1Q99689 392 aa23.52■■□□□ 1.36
TNNT1-208ENST00000587465 HAUS7Q99871 368 aa23.52■■□□□ 1.36
TNNT1-208ENST00000587465 GINM1Q9NU53 330 aa23.52■■□□□ 1.36
TNNT1-208ENST00000587465 RLFQ13129 1914 aa23.52■■□□□ 1.36
TNNT1-208ENST00000587465 SGPL1O95470 568 aa23.51■■□□□ 1.35
TNNT1-208ENST00000587465 CYP2B6P20813 491 aa23.51■■□□□ 1.35
TNNT1-208ENST00000587465 CERS3Q8IU89 383 aa23.51■■□□□ 1.35
TNNT1-208ENST00000587465 TRIB2Q92519 343 aa23.51■■□□□ 1.35
TNNT1-208ENST00000587465 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
TNNT1-208ENST00000587465 A0A1W2PRG0 241 aa23.5■■□□□ 1.35
TNNT1-208ENST00000587465 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
TNNT1-208ENST00000587465 VCAM1P19320 739 aa23.5■■□□□ 1.35
TNNT1-208ENST00000587465 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa23.5■■□□□ 1.35
TNNT1-208ENST00000587465 C12orf42Q96LP6 360 aa23.5■■□□□ 1.35
TNNT1-208ENST00000587465 LRRCC1Q9C099 1032 aa23.5■■□□□ 1.35
TNNT1-208ENST00000587465 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
TNNT1-208ENST00000587465 ERVK-9P63128 1117 aa23.49■■□□□ 1.35
TNNT1-208ENST00000587465 ERVK-24P63145 666 aa23.49■■□□□ 1.35
TNNT1-208ENST00000587465 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa23.49■■□□□ 1.35
TNNT1-208ENST00000587465 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
TNNT1-208ENST00000587465 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP23.49■■□□□ 1.35
TNNT1-208ENST00000587465 CCL14Q16627 93 aa23.48■■□□□ 1.35
TNNT1-208ENST00000587465 NKX2-3Q8TAU0 364 aa23.48■■□□□ 1.35
TNNT1-208ENST00000587465 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa23.48■■□□□ 1.35
TNNT1-208ENST00000587465 PARP14Q460N5 1801 aa23.47■■□□□ 1.35
TNNT1-208ENST00000587465 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
TNNT1-208ENST00000587465 HMGCRP04035 888 aa23.47■■□□□ 1.35
TNNT1-208ENST00000587465 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
TNNT1-208ENST00000587465 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
TNNT1-208ENST00000587465 PCDH10Q9P2E7 1040 aa23.47■■□□□ 1.35
TNNT1-208ENST00000587465 AKR1B1P15121 316 aa23.46■■□□□ 1.35
TNNT1-208ENST00000587465 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa23.46■■□□□ 1.35
TNNT1-208ENST00000587465 GPR142Q7Z601 462 aa23.46■■□□□ 1.35
TNNT1-208ENST00000587465 DPF3Q92784 378 aa23.46■■□□□ 1.35
TNNT1-208ENST00000587465 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa23.46■■□□□ 1.35
TNNT1-208ENST00000587465 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
TNNT1-208ENST00000587465 BTBD7Q9P203 1132 aa23.46■■□□□ 1.35
TNNT1-208ENST00000587465 A0A0G2JMZ2 1700 aa23.45■■□□□ 1.34
TNNT1-208ENST00000587465 USP17L15C9J2P7 530 aa23.45■■□□□ 1.34
TNNT1-208ENST00000587465 USP17L13C9JLJ4 530 aa23.45■■□□□ 1.34
TNNT1-208ENST00000587465 USP17L11C9JVI0 530 aa23.45■■□□□ 1.34
TNNT1-208ENST00000587465 USP17L18D6R9N7 530 aa23.45■■□□□ 1.34
TNNT1-208ENST00000587465 USP17L22D6RA61 530 aa23.45■■□□□ 1.34
TNNT1-208ENST00000587465 USP17L17D6RBQ6 530 aa23.45■■□□□ 1.34
TNNT1-208ENST00000587465 USP17L19D6RCP7 530 aa23.45■■□□□ 1.34
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TNNT1-208ENST00000587465 USP17L24Q0WX57 530 aa23.45■■□□□ 1.34
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TNNT1-208ENST00000587465 USP6NLQ92738 828 aa23.45■■□□□ 1.34
TNNT1-208ENST00000587465 CABP5Q9NP86 173 aa23.45■■□□□ 1.34
TNNT1-208ENST00000587465 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa23.45■■□□□ 1.34
TNNT1-208ENST00000587465 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
TNNT1-208ENST00000587465 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
TNNT1-208ENST00000587465 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
TNNT1-208ENST00000587465 FRMPD3Q5JV73 1810 aa23.44■■□□□ 1.34
TNNT1-208ENST00000587465 USP17L12C9JPN9 530 aa23.43■■□□□ 1.34
TNNT1-208ENST00000587465 USP17L21D6R901 530 aa23.43■■□□□ 1.34
TNNT1-208ENST00000587465 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
TNNT1-208ENST00000587465 MORN1Q5T089 497 aa23.43■■□□□ 1.34
TNNT1-208ENST00000587465 GCC1Q96CN9 775 aa23.43■■□□□ 1.34
TNNT1-208ENST00000587465 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
TNNT1-208ENST00000587465 NUDT12Q9BQG2 462 aa23.43■■□□□ 1.34
TNNT1-208ENST00000587465 DCTPP1Q9H773 170 aa23.43■■□□□ 1.34
TNNT1-208ENST00000587465 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
TNNT1-208ENST00000587465 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
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TNNT1-208ENST00000587465 USP14P54578 494 aa23.42■■□□□ 1.34
TNNT1-208ENST00000587465 UBE3CQ15386 1083 aa23.42■■□□□ 1.34
TNNT1-208ENST00000587465 C12orf60Q5U649 245 aa23.42■■□□□ 1.34
TNNT1-208ENST00000587465 CHRDL2Q6WN34 429 aa23.42■■□□□ 1.34
TNNT1-208ENST00000587465 PLEKHH3Q7Z736 793 aa23.42■■□□□ 1.34
TNNT1-208ENST00000587465 ECHDC1Q9NTX5 307 aa23.42■■□□□ 1.34
TNNT1-208ENST00000587465 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa23.42■■□□□ 1.34
TNNT1-208ENST00000587465 MAPK4P31152 587 aa23.41■■□□□ 1.34
TNNT1-208ENST00000587465 CDK8P49336 464 aa23.41■■□□□ 1.34
TNNT1-208ENST00000587465 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP23.41■■□□□ 1.34
TNNT1-208ENST00000587465 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa23.41■■□□□ 1.34
TNNT1-208ENST00000587465 STK11IPQ8N1F8 1099 aa23.41■■□□□ 1.34
TNNT1-208ENST00000587465 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP23.41■■□□□ 1.342e-10■□□□□ 11.1
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TNNT1-208ENST00000587465 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa23.41■■□□□ 1.34
TNNT1-208ENST00000587465 RPTORQ8N122 1335 aa23.4■■□□□ 1.34
TNNT1-208ENST00000587465 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
TNNT1-208ENST00000587465 WDR78Q5VTH9 848 aa23.4■■□□□ 1.34
TNNT1-208ENST00000587465 CTR9Q6PD62 1173 aa23.4■■□□□ 1.34
TNNT1-208ENST00000587465 SPICE1Q8N0Z3 855 aa23.4■■□□□ 1.34
TNNT1-208ENST00000587465 SOCS4Q8WXH5 440 aa23.4■■□□□ 1.34
TNNT1-208ENST00000587465 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
TNNT1-208ENST00000587465 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa23.4■■□□□ 1.34
TNNT1-208ENST00000587465 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
TNNT1-208ENST00000587465 TMEM179Q6ZVK1 233 aa23.39■■□□□ 1.33
TNNT1-208ENST00000587465 OSBP2Q969R2 916 aa23.39■■□□□ 1.33
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