RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578025.5

TSPOAP1-AS1-201, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,229 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PRDM4Q9UKN5 801 aa27.72■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa27.72■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TSPY2A6NKD2 308 aa27.72■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DEXIO95424 95 aa27.72■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C12orf60Q5U649 245 aa27.72■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ANO1Q5XXA6 986 aa27.72■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KCNG4Q8TDN1 519 aa27.72■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SPTLC2O15270 562 aa27.71■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa27.71■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DYNLL2Q96FJ2 89 aa27.71■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KCNJ14Q9UNX9 436 aa27.71■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 A0A1B0GVL5 298 aa27.71■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NDUFA8P51970 172 aa27.71■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 AOPEPQ8N6M6 819 aa27.71■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DLEC1Q9Y238 1755 aa27.71■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PDE6BP35913 854 aa27.7■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CCZ1BP86790 482 aa27.7■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP27.7■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 USP27XA6NNY8 438 aa27.69■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP27.69■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GTF2IP78347 998 aa27.69■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TROAPQ12815 778 aa27.69■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PPP2R5BQ15173 497 aa27.69■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 AMOTL1Q8IY63 956 aa27.69■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FBXW7Q969H0 707 aa27.69■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NAV1Q8NEY1 1877 aa27.69■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa27.69■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PLEKHA8P1O95397 391 aa27.68■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MMP1P03956 469 aa27.68■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SKILP12757 684 aa27.68■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ALDH1B1P30837 517 aa27.68■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NYAP1Q6ZVC0 841 aa27.68■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PRDM10Q9NQV6 1147 aa27.68■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa27.67■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BTBD18B2RXH4 712 aa27.67■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DDAH1O94760 285 aa27.67■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CALM1P0DP23 149 aa27.67■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CALM2P0DP24 149 aa27.67■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CALM3P0DP25 149 aa27.67■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CBX1P83916 185 aa27.67■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP27.67■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TEX11Q8IYF3 940 aa27.67■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TFAP4Q01664 338 aa27.67■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CEP135Q66GS9 1140 aa27.67■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MASTLQ96GX5 879 aa27.67■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SDF4Q9BRK5 362 aa27.67■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MKNK2Q9HBH9 465 aa27.67■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KIAA1468Q9P260 1216 aa27.67■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MYH6P13533 1939 aa27.66■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa27.66■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PLCD1P51178 756 aa27.66■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa27.66■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP27.66■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 COA1Q9GZY4 146 aa27.66■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NOSTRINQ8IVI9 506 aa27.65■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CCDC112Q8NEF3 446 aa27.65■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BPIFA3Q9BQP9 254 aa27.65■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM205AQ6ZU69 1335 aa27.65■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DPCR1Q3MIW9 517 aa27.65■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SLC44A5Q8NCS7 719 aa27.65■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KCND1Q9NSA2 647 aa27.65■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ROBO3Q96MS0 1386 aa27.65■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FUT2Q10981 343 aa27.64■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SLC39A14Q15043 492 aa27.64■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CERS3Q8IU89 383 aa27.64■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SLF2Q8IX21 1173 aa27.64■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa27.64■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DOK7Q18PE1 504 aa27.64■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 F8W031 263 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RCSD1Q6JBY9 416 aa27.63■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 V9GY48 417 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PLCG2P16885 1265 aa27.63■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TMTC3Q6ZXV5 915 aa27.63■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 VPS54Q9P1Q0 977 aa27.63■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RHBDL3P58872 404 aa27.62■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PKN1Q16512 942 aa27.62■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MAP3K14Q99558 947 aa27.62■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IL17RBQ9NRM6 502 aa27.62■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GAKO14976 1311 aa27.62■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FLT1P17948 1338 aa27.62■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.4 ms