RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567092.1

CFAP20-206, Transcript of cilia and flagella associated protein 20, human

TSL 2

Gene CFAP20, Length 710 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CFAP20-206	ENST00000567092	FAM196B	A6NMK8	535 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	PTPRA	P18433	802 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	DNAJC18	Q9H819	358 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	EFCC1	Q9HA90	598 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	SNRK	Q9NRH2	765 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	BCR	P11274	1271 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	PICALM	Q13492	652 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	GORAB	Q5T7V8	394 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	ZNF333	Q96JL9	665 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	USP26	Q9BXU7	913 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	PDHX	O00330	501 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	RAD50	Q92878	1312 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	MYH7	P12883	1935 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	CXCL11	O14625	94 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	SGSM2	O43147	1006 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	ZAP70	P43403	619 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	JAG1	P78504	1218 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	OXER1	Q8TDS5	423 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	TRIM47	Q96LD4	638 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	CPA4	Q9UI42	421 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	IGSF3	O75054	1194 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CFAP20-206	ENST00000567092	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
CFAP20-206	ENST00000567092	CYP2C8	P10632	490 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CFAP20-206	ENST00000567092	PPP4C	P60510	307 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CFAP20-206	ENST00000567092	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
CFAP20-206	ENST00000567092	SLF2	Q8IX21	1173 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CFAP20-206	ENST00000567092	IL17RA	Q96F46	866 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CFAP20-206	ENST00000567092	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CFAP20-206	ENST00000567092	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CFAP20-206	ENST00000567092	FLT1	P17948	1338 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CFAP20-206	ENST00000567092	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
CFAP20-206	ENST00000567092	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
CFAP20-206	ENST00000567092	PPP1R15B	Q5SWA1	713 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CFAP20-206	ENST00000567092	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
CFAP20-206	ENST00000567092	FSD1	Q9BTV5	496 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CFAP20-206	ENST00000567092	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CFAP20-206	ENST00000567092	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	13.51	□□□□□ -0.25
CFAP20-206	ENST00000567092	RAI14	Q9P0K7	980 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CFAP20-206	ENST00000567092	TK2	O00142	265 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CFAP20-206	ENST00000567092	GSTO1	P78417	241 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CFAP20-206	ENST00000567092	TREML2	Q5T2D2	321 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CFAP20-206	ENST00000567092	TEX11	Q8IYF3	940 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CFAP20-206	ENST00000567092	SHISA4	Q96DD7	197 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CFAP20-206	ENST00000567092	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CFAP20-206	ENST00000567092	ALPK3	Q96L96	1907 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CFAP20-206	ENST00000567092	LDHC	P07864	332 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CFAP20-206	ENST00000567092	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
CFAP20-206	ENST00000567092	OSBP	P22059	807 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CFAP20-206	ENST00000567092	ANAPC15	P60006	121 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CFAP20-206	ENST00000567092	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
CFAP20-206	ENST00000567092	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
CFAP20-206	ENST00000567092	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CFAP20-206	ENST00000567092	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
CFAP20-206	ENST00000567092	ADGRD1	Q6QNK2	874 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CFAP20-206	ENST00000567092	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
CFAP20-206	ENST00000567092	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CFAP20-206	ENST00000567092	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CFAP20-206	ENST00000567092	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CFAP20-206	ENST00000567092	SRRD	Q9UH36	339 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CFAP20-206	ENST00000567092	RLF	Q13129	1914 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CFAP20-206	ENST00000567092	TRIM75P	A6NK02	468 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CFAP20-206	ENST00000567092	MCC	P23508	829 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CFAP20-206	ENST00000567092	CAP2	P40123	477 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CFAP20-206	ENST00000567092	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CFAP20-206	ENST00000567092	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CFAP20-206	ENST00000567092	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CFAP20-206	ENST00000567092	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CFAP20-206	ENST00000567092	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CFAP20-206	ENST00000567092	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CFAP20-206	ENST00000567092	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
CFAP20-206	ENST00000567092	PARP14	Q460N5	1801 aa		13.48	□□□□□ -0.25
CFAP20-206	ENST00000567092	GOLIM4	O00461	696 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CFAP20-206	ENST00000567092	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms