RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562881.1

FAN1-204, Transcript of FANCD2 and FANCI associated nuclease 1, humanhuman

TSL 3

Gene FAN1, Length 525 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1-204ENST00000562881 YEATS4O95619 227 aa14.7□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 VIL1P09327 827 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 TOP1P11387 765 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 MRE11P49959 708 aa14.7□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 PICALMQ13492 652 aa14.7□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa14.7□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 NBPF11Q86T75 865 aa14.7□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 OGFOD1Q8N543 542 aa14.7□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 PNMA1Q8ND90 353 aa14.7□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 AGBL3Q8NEM8 1001 aa14.7□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 KCNG4Q8TDN1 519 aa14.7□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 PHKBQ93100 1093 aa14.7□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 TRIM34Q9BYJ4 488 aa14.7□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 RTEL1Q9NZ71 1219 aa14.7□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 ZNRF3Q9ULT6 936 aa14.7□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 ECM29Q5VYK3 1845 aa14.7□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 FSD2A1L4K1 749 aa14.69□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 SMARCA1P28370 1054 aa14.69□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 FOSBP53539 338 aa14.69□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 GUCY1B3Q02153 619 aa14.69□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 GABPAQ06546 454 aa14.69□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 GRM4Q14833 912 aa14.69□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 RCSD1Q6JBY9 416 aa14.69□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 JMYQ8N9B5 988 aa14.69□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 MXD3Q9BW11 206 aa14.69□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 POLR3EQ9NVU0 708 aa14.69□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 SCN9AQ15858 1988 aa14.68□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 SMIM22K7EJ46 135 aa14.68□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 MMP1P03956 469 aa14.68□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 NOVP48745 357 aa14.68□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 TNIP1Q15025 636 aa14.68□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 MYSM1Q5VVJ2 828 aa14.68□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 JDP2Q8WYK2 163 aa14.68□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 CHAMP1Q96JM3 812 aa14.68□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 SGIP1Q9BQI5 828 aa14.68□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 TAOK3Q9H2K8 898 aa14.68□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 IL17RBQ9NRM6 502 aa14.68□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 PI4KBQ9UBF8 816 aa14.68□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 LTBP3Q9NS15 1303 aa14.67□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 YDJCA8MPS7 323 aa14.67□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 DTNBO60941 627 aa14.67□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 FUT2Q10981 343 aa14.67□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 CFAP100Q494V2 611 aa14.67□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 FKBP1CQ5VVH2 108 aa14.67□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 SH3GLB2Q9NR46 395 aa14.67□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 KCNQ5Q9NR82 932 aa14.67□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 STX8Q9UNK0 236 aa14.67□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 MYH6P13533 1939 aa14.66□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 NMT2O60551 498 aa14.66□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 RPS12P25398 132 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 CALML3P27482 149 aa14.66□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 NASPP49321 788 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 STK38Q15208 465 aa14.66□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 DLGAP5Q15398 846 aa14.66□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa14.66□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 FAM173BQ6P4H8 233 aa14.66□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 LRSAM1Q6UWE0 723 aa14.66□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 NOSTRINQ8IVI9 506 aa14.66□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 MTMR14Q8NCE2 650 aa14.66□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 SLC44A5Q8NCS7 719 aa14.66□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 BICD2Q8TD16 824 aa14.66□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 TMEM47Q9BQJ4 181 aa14.66□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 TMEM63CQ9P1W3 806 aa14.66□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 CEP131Q9UPN4 1083 aa14.66□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa14.66□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 MYH8P13535 1937 aa14.65□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 ATRNL1Q5VV63 1379 aa14.65□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 PSMD14O00487 310 aa14.65□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 MYO1BO43795 1136 aa14.65□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 PPFIA3O75145 1194 aa14.65□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 TTLL1O95922 423 aa14.65□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 BMP15O95972 392 aa14.65□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 EVX2Q03828 476 aa14.65□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 RILPL1Q5EBL4 403 aa14.65□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 ANO1Q5XXA6 986 aa14.65□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa14.65□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 GALNT17Q6IS24 598 aa14.65□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa14.65□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 USP28Q96RU2 1077 aa14.65□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 GMLQ99445 158 aa14.65□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 V9GY48 417 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
FAN1-204ENST00000562881 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
FAN1-204ENST00000562881 A0A1W2PQ27 194 aa14.64□□□□□ -0.07
FAN1-204ENST00000562881 A0A1W2PQ64 194 aa14.64□□□□□ -0.07
FAN1-204ENST00000562881 A0A1W2PQD8 194 aa14.64□□□□□ -0.07
FAN1-204ENST00000562881 SPDYE2BA6NHP3 402 aa14.64□□□□□ -0.07
FAN1-204ENST00000562881 hCG_1984214I3L0E3 225 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms