RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562664.5

PPP4C-204, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 3

Gene PPP4C, Length 941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-204	ENST00000562664	PDE6A	P16499	860 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PPP4C-204	ENST00000562664	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PPP4C-204	ENST00000562664	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PPP4C-204	ENST00000562664	GPR142	Q7Z601	462 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PPP4C-204	ENST00000562664	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	28.76	■■■□□ 2.19
PPP4C-204	ENST00000562664	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PPP4C-204	ENST00000562664	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		28.75	■■■□□ 2.19
PPP4C-204	ENST00000562664	CNMD	O75829	334 aa		28.75	■■■□□ 2.19
PPP4C-204	ENST00000562664	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	28.75	■■■□□ 2.19
PPP4C-204	ENST00000562664	GABPA	Q06546	454 aa		28.75	■■■□□ 2.19
PPP4C-204	ENST00000562664	PDE3A	Q14432	1141 aa		28.75	■■■□□ 2.19
PPP4C-204	ENST00000562664	MORN1	Q5T089	497 aa		28.75	■■■□□ 2.19
PPP4C-204	ENST00000562664	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		28.75	■■■□□ 2.19
PPP4C-204	ENST00000562664	ACER1	Q8TDN7	264 aa		28.75	■■■□□ 2.19
PPP4C-204	ENST00000562664	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		28.75	■■■□□ 2.19
PPP4C-204	ENST00000562664	USP17L15	C9J2P7	530 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PPP4C-204	ENST00000562664	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PPP4C-204	ENST00000562664	USP17L11	C9JVI0	530 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PPP4C-204	ENST00000562664	USP17L18	D6R9N7	530 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PPP4C-204	ENST00000562664	USP17L22	D6RA61	530 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PPP4C-204	ENST00000562664	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PPP4C-204	ENST00000562664	USP17L19	D6RCP7	530 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PPP4C-204	ENST00000562664	USP17L20	D6RJB6	530 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PPP4C-204	ENST00000562664	MS4A1	P11836	297 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PPP4C-204	ENST00000562664	VCAM1	P19320	739 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PPP4C-204	ENST00000562664	GUCY1A2	P33402	732 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PPP4C-204	ENST00000562664	USP14	P54578	494 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PPP4C-204	ENST00000562664	EVX2	Q03828	476 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PPP4C-204	ENST00000562664	USP17L24	Q0WX57	530 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PPP4C-204	ENST00000562664	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PPP4C-204	ENST00000562664	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	28.74	■■■□□ 2.19
PPP4C-204	ENST00000562664	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PPP4C-204	ENST00000562664	PARP14	Q460N5	1801 aa		28.73	■■■□□ 2.19
PPP4C-204	ENST00000562664	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		28.73	■■■□□ 2.19
PPP4C-204	ENST00000562664	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	28.73	■■■□□ 2.19
PPP4C-204	ENST00000562664	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		28.73	■■■□□ 2.19
PPP4C-204	ENST00000562664	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		28.73	■■■□□ 2.19
PPP4C-204	ENST00000562664	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	28.73	■■■□□ 2.19
PPP4C-204	ENST00000562664	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	28.73	■■■□□ 2.19
PPP4C-204	ENST00000562664	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		28.73	■■■□□ 2.19
PPP4C-204	ENST00000562664	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		28.72	■■■□□ 2.19
PPP4C-204	ENST00000562664	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		28.72	■■■□□ 2.19
PPP4C-204	ENST00000562664	RGS2	P41220	211 aa		28.72	■■■□□ 2.19
PPP4C-204	ENST00000562664	APBA2	Q99767	749 aa		28.72	■■■□□ 2.19
PPP4C-204	ENST00000562664	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	28.72	■■■□□ 2.19
PPP4C-204	ENST00000562664	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		28.72	■■■□□ 2.19
PPP4C-204	ENST00000562664	APBB1	O00213	710 aa		28.71	■■■□□ 2.19
PPP4C-204	ENST00000562664	GOLIM4	O00461	696 aa		28.71	■■■□□ 2.19
PPP4C-204	ENST00000562664	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	28.71	■■■□□ 2.19
PPP4C-204	ENST00000562664	CCL14	Q16627	93 aa		28.71	■■■□□ 2.19
PPP4C-204	ENST00000562664	LBX2	Q6XYB7	198 aa		28.71	■■■□□ 2.19
PPP4C-204	ENST00000562664	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	28.71	■■■□□ 2.19
PPP4C-204	ENST00000562664	NBPF3	Q9H094	633 aa		28.71	■■■□□ 2.19
PPP4C-204	ENST00000562664	CABP5	Q9NP86	173 aa		28.71	■■■□□ 2.19
PPP4C-204	ENST00000562664	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		28.71	■■■□□ 2.19
PPP4C-204	ENST00000562664	COG6	Q9Y2V7	657 aa		28.71	■■■□□ 2.19
PPP4C-204	ENST00000562664		A0A1W2PPC1	479 aa		28.7	■■■□□ 2.18
PPP4C-204	ENST00000562664	HMMR	O75330	724 aa		28.7	■■■□□ 2.18
PPP4C-204	ENST00000562664	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	28.7	■■■□□ 2.18
PPP4C-204	ENST00000562664	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	28.7	■■■□□ 2.18
PPP4C-204	ENST00000562664	LCORL	Q8N3X6	602 aa		28.7	■■■□□ 2.18
PPP4C-204	ENST00000562664	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	28.7	■■■□□ 2.18
PPP4C-204	ENST00000562664	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	28.69	■■■□□ 2.18
PPP4C-204	ENST00000562664	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		28.69	■■■□□ 2.18
PPP4C-204	ENST00000562664	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		28.69	■■■□□ 2.18
PPP4C-204	ENST00000562664	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	28.69	■■■□□ 2.18
PPP4C-204	ENST00000562664	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		28.69	■■■□□ 2.18
PPP4C-204	ENST00000562664	MAP2K5	Q13163	448 aa		28.68	■■■□□ 2.18
PPP4C-204	ENST00000562664	SEPT2	Q15019	361 aa		28.68	■■■□□ 2.18
PPP4C-204	ENST00000562664	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		28.68	■■■□□ 2.18
PPP4C-204	ENST00000562664	BTBD7	Q9P203	1132 aa		28.68	■■■□□ 2.18
PPP4C-204	ENST00000562664	LAMA3	Q16787	3333 aa		28.68	■■■□□ 2.18
PPP4C-204	ENST00000562664	PFAS	O15067	1338 aa		28.68	■■■□□ 2.18
PPP4C-204	ENST00000562664	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	28.67	■■■□□ 2.18
PPP4C-204	ENST00000562664	CCNA1	P78396	465 aa		28.67	■■■□□ 2.18
PPP4C-204	ENST00000562664	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	28.67	■■■□□ 2.18
PPP4C-204	ENST00000562664		A0A1W2PRG0	241 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PPP4C-204	ENST00000562664	RAB11FIP3	O75154	756 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PPP4C-204	ENST00000562664	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	28.66	■■■□□ 2.18
PPP4C-204	ENST00000562664	STAP2	Q9UGK3	403 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PPP4C-204	ENST00000562664	CYP2D6	P10635	497 aa		28.65	■■■□□ 2.18
PPP4C-204	ENST00000562664	LHX8	Q68G74	356 aa		28.65	■■■□□ 2.18
PPP4C-204	ENST00000562664	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		28.65	■■■□□ 2.18
PPP4C-204	ENST00000562664	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	28.65	■■■□□ 2.18
PPP4C-204	ENST00000562664	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		28.65	■■■□□ 2.18
PPP4C-204	ENST00000562664	GDF15	Q99988	308 aa		28.64	■■■□□ 2.18
PPP4C-204	ENST00000562664	ARMT1	Q9H993	441 aa		28.64	■■■□□ 2.18
PPP4C-204	ENST00000562664	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		28.64	■■■□□ 2.18
PPP4C-204	ENST00000562664	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	28.64	■■■□□ 2.17
PPP4C-204	ENST00000562664	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PPP4C-204	ENST00000562664	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	28.63	■■■□□ 2.17
PPP4C-204	ENST00000562664	COL6A1	P12109	1028 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PPP4C-204	ENST00000562664	PTPRE	P23469	700 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PPP4C-204	ENST00000562664	ADD2	P35612	726 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PPP4C-204	ENST00000562664	GRB14	Q14449	540 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PPP4C-204	ENST00000562664	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PPP4C-204	ENST00000562664	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PPP4C-204	ENST00000562664	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	28.63	■■■□□ 2.17
PPP4C-204	ENST00000562664	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	28.62	■■■□□ 2.17
PPP4C-204	ENST00000562664	HOXC6	P09630	235 aa		28.62	■■■□□ 2.17

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