RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	RIN3	Q8TB24	985 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AKAP13-223	ENST00000560957	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AKAP13-223	ENST00000560957	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AKAP13-223	ENST00000560957	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
AKAP13-223	ENST00000560957	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AKAP13-223	ENST00000560957	CITED4	Q96RK1	184 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AKAP13-223	ENST00000560957	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AKAP13-223	ENST00000560957	ZC3H12D	A2A288	527 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
AKAP13-223	ENST00000560957	SUV39H1	O43463	412 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AKAP13-223	ENST00000560957	NDUFB5	O43674	189 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AKAP13-223	ENST00000560957	ICMT	O60725	284 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AKAP13-223	ENST00000560957	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
AKAP13-223	ENST00000560957	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AKAP13-223	ENST00000560957	SAMM50	Q9Y512	469 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AKAP13-223	ENST00000560957	IRAK3	Q9Y616	596 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AKAP13-223	ENST00000560957	HRK	O00198	91 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	PDE6B	P35913	854 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	SERPINB4	P48594	390 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	ARHGAP4	P98171	946 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	NKG7	Q16617	165 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	PANK1	Q8TE04	598 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	INSRR	P14616	1297 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRC14	Q15048	493 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	BCO2	Q9BYV7	579 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	WASH4P	A8MWX3	477 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	ENC1	O14682	589 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	GPR182	O15218	404 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	CHRNE	Q04844	493 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	HID1	Q8IV36	788 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	SHISA4	Q96DD7	197 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	DUSP13	Q9UII6	198 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	OR14I1	A6ND48	311 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957		H3BRB1	525 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	PLP2	Q04941	152 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	EGR3	Q06889	387 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	INPP5A	Q14642	412 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	PRAMEF13	Q5VWM6	474 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	CRELD1	Q96HD1	420 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	CEP44	Q9C0F1	390 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	N4BP3	O15049	544 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	PAGE1	O75459	146 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	HDX	Q7Z353	690 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	SYT8	Q8NBV8	401 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957		Q96M66	194 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	GPR160	Q9UJ42	338 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	CILP	O75339	1184 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	ETV3	P41162	512 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	EPHB3	P54753	998 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	RASIP1	Q5U651	963 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	PI16	Q6UXB8	463 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	CDH24	Q86UP0	819 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	BDH2	Q9BUT1	245 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		4.84	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	DUSP4	Q13115	394 aa		4.84	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	RETREG2	Q8NC44	543 aa		4.84	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		4.84	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms