RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558954.5

RABGGTA-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-208ENST00000558954 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.43■■□□□ 1.18
RABGGTA-208ENST00000558954 PLIN4Q96Q06 1357 aa22.42■■□□□ 1.18
RABGGTA-208ENST00000558954 CDC45O75419 566 aa22.42■■□□□ 1.18
RABGGTA-208ENST00000558954 PRDM1O75626 825 aa22.42■■□□□ 1.18
RABGGTA-208ENST00000558954 ICA1Q05084 483 aa22.42■■□□□ 1.18
RABGGTA-208ENST00000558954 CTDSPL2Q05D32 466 aa22.42■■□□□ 1.18
RABGGTA-208ENST00000558954 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
RABGGTA-208ENST00000558954 CTNNA3Q9UI47 895 aa22.42■■□□□ 1.18
RABGGTA-208ENST00000558954 MGAMO43451 1857 aa22.42■■□□□ 1.18
RABGGTA-208ENST00000558954 SH3D19Q5HYK7 790 aa22.41■■□□□ 1.18
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
RABGGTA-208ENST00000558954 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa22.41■■□□□ 1.18
RABGGTA-208ENST00000558954 TMOD4Q9NZQ9 345 aa22.41■■□□□ 1.18
RABGGTA-208ENST00000558954 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa22.41■■□□□ 1.18
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa22.41■■□□□ 1.18
RABGGTA-208ENST00000558954 PDHXO00330 501 aa22.4■■□□□ 1.18
RABGGTA-208ENST00000558954 TBC1D8O95759 1140 aa22.4■■□□□ 1.18
RABGGTA-208ENST00000558954 PCP11498 1178 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
RABGGTA-208ENST00000558954 LBX1P52954 281 aa22.4■■□□□ 1.18
RABGGTA-208ENST00000558954 USP14P54578 494 aa22.4■■□□□ 1.18
RABGGTA-208ENST00000558954 HAND2P61296 217 aa22.4■■□□□ 1.18
RABGGTA-208ENST00000558954 CRHR2Q13324 411 aa22.4■■□□□ 1.18
RABGGTA-208ENST00000558954 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa22.4■■□□□ 1.18
RABGGTA-208ENST00000558954 SH2D4AQ9H788 454 aa22.4■■□□□ 1.18
RABGGTA-208ENST00000558954 KANSL2Q9H9L4 492 aa22.4■■□□□ 1.18
RABGGTA-208ENST00000558954 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.4■■□□□ 1.18
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF213O14771 459 aa22.39■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 GPAT2Q6NUI2 795 aa22.39■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 USP17L2Q6R6M4 530 aa22.39■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa22.39■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa22.39■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 ORC4O43929 436 aa22.38■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 TSPY3P0CV98 308 aa22.38■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 TSPY8P0CW00 308 aa22.38■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.38■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 CLEC10AQ8IUN9 316 aa22.38■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 ACER1Q8TDN7 264 aa22.38■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 C12orf42Q96LP6 360 aa22.38■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 PNMA3Q9UL41 463 aa22.38■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 FGRP09769 529 aa22.37■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 AKNAD1Q5T1N1 836 aa22.37■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 TREML2Q5T2D2 321 aa22.37■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 STAG1Q8WVM7 1258 aa22.37■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 NBPF3Q9H094 633 aa22.37■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.37■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 TOMM22Q9NS69 142 aa22.37■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 RLFQ13129 1914 aa22.37■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 TSPY2A6NKD2 308 aa22.36■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 PTH1RQ03431 593 aa22.36■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 DGKZQ13574 1117 aa22.36■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 MFSD6Q6ZSS7 791 aa22.36■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 TBC1D10CQ8IV04 446 aa22.36■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 NEDD1Q8NHV4 660 aa22.36■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP22.36■■□□□ 1.17
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RABGGTA-208ENST00000558954 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 A0A1W2PRG0 241 aa22.35■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 EEF2P13639 858 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 TFAP4Q01664 338 aa22.35■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 ATP2B2Q01814 1243 aa22.35■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa22.35■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 EMILIN3Q9NT22 766 aa22.35■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa22.35■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 A0A0G2JMZ2 1700 aa22.34■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa22.34■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 GPR25O00155 361 aa22.34■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 TLR2O60603 784 aa22.34■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 NT5C2P49902 561 aa22.34■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 FAM47AQ5JRC9 791 aa22.34■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa22.34■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 CEP95Q96GE4 821 aa22.34■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 NYAP2Q9P242 653 aa22.34■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 TMX2Q9Y320 296 aa22.34■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.34■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 ADGRA2Q96PE1 1338 aa22.33■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 VCAM1P19320 739 aa22.33■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 IFFO2Q5TF58 517 aa22.33■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 SIAH1Q8IUQ4 282 aa22.33■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 LPAR1Q92633 364 aa22.33■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 MAP4K1Q92918 833 aa22.33■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 GOPCQ9HD26 462 aa22.33■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 ANO2Q9NQ90 1003 aa22.33■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 INCENPQ9NQS7 918 aa22.33■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 MTMR4Q9NYA4 1195 aa22.33■■□□□ 1.17
RABGGTA-208ENST00000558954 NEDD4P46934 1319 aa22.32■■□□□ 1.16
RABGGTA-208ENST00000558954 TTLL1O95922 423 aa22.32■■□□□ 1.16
RABGGTA-208ENST00000558954 CYP2C8P10632 490 aa22.32■■□□□ 1.16
RABGGTA-208ENST00000558954 OSBPP22059 807 aa22.32■■□□□ 1.16
RABGGTA-208ENST00000558954 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
RABGGTA-208ENST00000558954 ESR2Q92731 530 aa22.32■■□□□ 1.16
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