RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558455.1

TMOD3-203, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-203ENST00000558455 CPA4Q9UI42 421 aa24.98■■□□□ 1.59
TMOD3-203ENST00000558455 CCDC171Q6TFL3 1326 aa24.97■■□□□ 1.59
TMOD3-203ENST00000558455 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
TMOD3-203ENST00000558455 C17orf99Q6UX52 265 aa24.97■■□□□ 1.59
TMOD3-203ENST00000558455 EMILIN3Q9NT22 766 aa24.97■■□□□ 1.59
TMOD3-203ENST00000558455 MYH8P13535 1937 aa24.96■■□□□ 1.59
TMOD3-203ENST00000558455 HIP1O00291 1037 aa24.96■■□□□ 1.59
TMOD3-203ENST00000558455 USP17L2Q6R6M4 530 aa24.96■■□□□ 1.59
TMOD3-203ENST00000558455 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
TMOD3-203ENST00000558455 CLEC10AQ8IUN9 316 aa24.96■■□□□ 1.59
TMOD3-203ENST00000558455 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa24.96■■□□□ 1.59
TMOD3-203ENST00000558455 PNMA3Q9UL41 463 aa24.96■■□□□ 1.59
TMOD3-203ENST00000558455 RASA1P20936 1047 aa24.95■■□□□ 1.58
TMOD3-203ENST00000558455 CAP1Q01518 475 aa24.95■■□□□ 1.58
TMOD3-203ENST00000558455 PPARAQ07869 468 aa24.95■■□□□ 1.58
TMOD3-203ENST00000558455 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP24.95■■□□□ 1.58
TMOD3-203ENST00000558455 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
TMOD3-203ENST00000558455 MKNK2Q9HBH9 465 aa24.95■■□□□ 1.58
TMOD3-203ENST00000558455 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
TMOD3-203ENST00000558455 ICA1Q05084 483 aa24.94■■□□□ 1.58
TMOD3-203ENST00000558455 ALX1Q15699 326 aa24.94■■□□□ 1.58
TMOD3-203ENST00000558455 CCDC136Q96JN2 1154 aa24.94■■□□□ 1.58
TMOD3-203ENST00000558455 C12orf42Q96LP6 360 aa24.94■■□□□ 1.58
TMOD3-203ENST00000558455 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
TMOD3-203ENST00000558455 A0A1W2PRG0 241 aa24.93■■□□□ 1.58
TMOD3-203ENST00000558455 PRDM1O75626 825 aa24.93■■□□□ 1.58
TMOD3-203ENST00000558455 BCRP11274 1271 aa24.93■■□□□ 1.58
TMOD3-203ENST00000558455 USP14P54578 494 aa24.93■■□□□ 1.58
TMOD3-203ENST00000558455 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
TMOD3-203ENST00000558455 OTOP1Q7RTM1 612 aa24.93■■□□□ 1.58
TMOD3-203ENST00000558455 ABHD8Q96I13 439 aa24.93■■□□□ 1.58
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF287Q9HBT7 754 aa24.93■■□□□ 1.58
TMOD3-203ENST00000558455 TRIM17Q9Y577 477 aa24.93■■□□□ 1.58
TMOD3-203ENST00000558455 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
TMOD3-203ENST00000558455 OSBPP22059 807 aa24.92■■□□□ 1.58
TMOD3-203ENST00000558455 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
TMOD3-203ENST00000558455 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
TMOD3-203ENST00000558455 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
TMOD3-203ENST00000558455 SKAP1Q86WV1 359 aa24.92■■□□□ 1.58
TMOD3-203ENST00000558455 SIAH1Q8IUQ4 282 aa24.92■■□□□ 1.58
TMOD3-203ENST00000558455 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP24.92■■□□□ 1.58
TMOD3-203ENST00000558455 FGAP02671 866 aa24.91■■□□□ 1.58
TMOD3-203ENST00000558455 VCAM1P19320 739 aa24.91■■□□□ 1.58
TMOD3-203ENST00000558455 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
TMOD3-203ENST00000558455 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa24.91■■□□□ 1.58
TMOD3-203ENST00000558455 KANSL2Q9H9L4 492 aa24.91■■□□□ 1.58
TMOD3-203ENST00000558455 EFCC1Q9HA90 598 aa24.91■■□□□ 1.58
TMOD3-203ENST00000558455 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa24.91■■□□□ 1.58
TMOD3-203ENST00000558455 ZMYM6O95789 1325 aa24.9■■□□□ 1.58
TMOD3-203ENST00000558455 CTDSPL2Q05D32 466 aa24.9■■□□□ 1.58
TMOD3-203ENST00000558455 PDE4BQ07343 736 aa24.9■■□□□ 1.58
TMOD3-203ENST00000558455 KIF22Q14807 665 aa24.9■■□□□ 1.58
TMOD3-203ENST00000558455 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
TMOD3-203ENST00000558455 EEF2P13639 858 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
TMOD3-203ENST00000558455 ANAPC4Q9UJX5 808 aa24.89■■□□□ 1.58
TMOD3-203ENST00000558455 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
TMOD3-203ENST00000558455 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
TMOD3-203ENST00000558455 ATP2B2Q01814 1243 aa24.88■■□□□ 1.57
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TMOD3-203ENST00000558455 IFFO2Q5TF58 517 aa24.88■■□□□ 1.57
TMOD3-203ENST00000558455 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa24.88■■□□□ 1.57
TMOD3-203ENST00000558455 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
TMOD3-203ENST00000558455 IL25Q9H293 177 aa24.88■■□□□ 1.57
TMOD3-203ENST00000558455 SH2D4AQ9H788 454 aa24.88■■□□□ 1.57
TMOD3-203ENST00000558455 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP24.88■■□□□ 1.57
TMOD3-203ENST00000558455 TMX2Q9Y320 296 aa24.88■■□□□ 1.57
TMOD3-203ENST00000558455 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa24.87■■□□□ 1.57
TMOD3-203ENST00000558455 CTGFP29279 349 aa24.87■■□□□ 1.57
TMOD3-203ENST00000558455 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa24.87■■□□□ 1.57
TMOD3-203ENST00000558455 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
TMOD3-203ENST00000558455 TACC3Q9Y6A5 838 aa24.87■■□□□ 1.57
TMOD3-203ENST00000558455 USP17L15C9J2P7 530 aa24.86■■□□□ 1.57
TMOD3-203ENST00000558455 USP17L13C9JLJ4 530 aa24.86■■□□□ 1.57
TMOD3-203ENST00000558455 USP17L11C9JVI0 530 aa24.86■■□□□ 1.57
TMOD3-203ENST00000558455 USP17L18D6R9N7 530 aa24.86■■□□□ 1.57
TMOD3-203ENST00000558455 USP17L22D6RA61 530 aa24.86■■□□□ 1.57
TMOD3-203ENST00000558455 USP17L17D6RBQ6 530 aa24.86■■□□□ 1.57
TMOD3-203ENST00000558455 USP17L19D6RCP7 530 aa24.86■■□□□ 1.57
TMOD3-203ENST00000558455 USP17L20D6RJB6 530 aa24.86■■□□□ 1.57
TMOD3-203ENST00000558455 CHMLP26374 656 aa24.86■■□□□ 1.57
TMOD3-203ENST00000558455 PSMC4P43686 418 aa24.86■■□□□ 1.57
TMOD3-203ENST00000558455 HERVK_113P62684 666 aa24.86■■□□□ 1.57
TMOD3-203ENST00000558455 USP17L24Q0WX57 530 aa24.86■■□□□ 1.57
TMOD3-203ENST00000558455 FAM110CQ1W6H9 321 aa24.86■■□□□ 1.57
TMOD3-203ENST00000558455 TRIM47Q96LD4 638 aa24.86■■□□□ 1.57
TMOD3-203ENST00000558455 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
TMOD3-203ENST00000558455 INCENPQ9NQS7 918 aa24.86■■□□□ 1.57
TMOD3-203ENST00000558455 PLIN4Q96Q06 1357 aa24.85■■□□□ 1.57
TMOD3-203ENST00000558455 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa24.85■■□□□ 1.57
TMOD3-203ENST00000558455 CAPN15O75808 1086 aa24.85■■□□□ 1.57
TMOD3-203ENST00000558455 TSPY3P0CV98 308 aa24.85■■□□□ 1.57
TMOD3-203ENST00000558455 TSPY8P0CW00 308 aa24.85■■□□□ 1.57
TMOD3-203ENST00000558455 HAND2P61296 217 aa24.85■■□□□ 1.57
TMOD3-203ENST00000558455 FAM47AQ5JRC9 791 aa24.85■■□□□ 1.57
TMOD3-203ENST00000558455 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa24.85■■□□□ 1.57
TMOD3-203ENST00000558455 SPICE1Q8N0Z3 855 aa24.85■■□□□ 1.57
TMOD3-203ENST00000558455 VCPKMTQ9H867 229 aa24.85■■□□□ 1.57
TMOD3-203ENST00000558455 HPS5Q9UPZ3 1129 aa24.85■■□□□ 1.57
TMOD3-203ENST00000558455 PTPN22Q9Y2R2 807 aa24.85■■□□□ 1.57
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