RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557444.5

AFG3L1P-217, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, humanhuman

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Gene AFG3L1P, Length 2,447 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L1P-217ENST00000557444 CYP2D6P10635 497 aa22.84■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 MECOMQ03112 1051 aa22.84■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.84■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 IQCA1Q86XH1 822 aa22.84■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.84■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF174Q15697 407 aa22.84■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 SLC51AQ86UW1 340 aa22.84■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 NRAPQ86VF7 1730 aa22.84■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 ADAMTS3O15072 1205 aa22.83■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 FANCGO15287 622 aa22.83■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 SLU7O95391 586 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF18P17022 549 aa22.83■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 PRDX5P30044 214 aa22.83■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 KCNJ6P48051 423 aa22.83■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 NPY5RQ15761 445 aa22.83■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 TMEM139Q8IV31 216 aa22.83■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 XBP1P17861 261 aa22.82■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 KMT5BQ4FZB7 885 aa22.82■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 MLKLQ8NB16 471 aa22.82■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 ERO1AQ96HE7 468 aa22.82■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 DNAI1Q9UI46 699 aa22.82■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 SCN7AQ01118 1682 aa22.82■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 ADKP55263 362 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 KLHL10Q6JEL2 608 aa22.82■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 FBXO33Q7Z6M2 555 aa22.82■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 STAMQ92783 540 aa22.82■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 TMTC3Q6ZXV5 915 aa22.81■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 TXNRD3Q86VQ6 643 aa22.81■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 FGRP09769 529 aa22.81■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 STX17P56962 302 aa22.81■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 PPP2R5BQ15173 497 aa22.81■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 SPATA20Q8TB22 786 aa22.81■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 L2HGDHQ9H9P8 463 aa22.81■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 CD44P16070 742 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 TRIM65Q6PJ69 517 aa22.8■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 REXO1L1PQ8IX06 675 aa22.8■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa22.8■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 RPS8P62241 208 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 ETF1P62495 437 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa22.8■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.8■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 VWA3AA6NCI4 1184 aa22.79■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 COBLO75128 1261 aa22.79■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa22.79■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCDC93Q567U6 631 aa22.79■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 TNFRSF25Q93038 417 aa22.79■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 PAGE5Q96GU1 130 aa22.79■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 TC2NQ8N9U0 490 aa22.79■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 MYO1BO43795 1136 aa22.78■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 PLCD1P51178 756 aa22.78■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 KANK3Q6NY19 840 aa22.78■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 DACH1Q9UI36 760 aa22.78■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 PTGDRQ13258 359 aa22.78■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 TTC38Q5R3I4 469 aa22.78■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa22.78■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 TRIML1Q8N9V2 468 aa22.78■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 TEX33O43247 280 aa22.77■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 SLFN14P0C7P3 912 aa22.77■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa22.77■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 DDAH1O94760 285 aa22.77■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa22.77■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 FEZ1Q99689 392 aa22.77■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa22.77■■□□□ 1.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa22.76■■□□□ 1.23
AFG3L1P-217ENST00000557444 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.76■■□□□ 1.23
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
AFG3L1P-217ENST00000557444 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP22.76■■□□□ 1.239e-8■■■□□ 17.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 USP17L8P0C7I0 530 aa22.76■■□□□ 1.23
AFG3L1P-217ENST00000557444 CALM1P0DP23 149 aa22.76■■□□□ 1.23
AFG3L1P-217ENST00000557444 CALM2P0DP24 149 aa22.76■■□□□ 1.23
AFG3L1P-217ENST00000557444 CALM3P0DP25 149 aa22.76■■□□□ 1.23
AFG3L1P-217ENST00000557444 SLC10A5Q5PT55 438 aa22.76■■□□□ 1.23
AFG3L1P-217ENST00000557444 BARGINQ6ZT62 677 aa22.76■■□□□ 1.23
AFG3L1P-217ENST00000557444 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
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