RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552985.5

TPCN1-223, Transcript of two pore segment channel 1, human

TSL 3

Gene TPCN1, Length 762 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPCN1-223	ENST00000552985	MGAM	O43451	1857 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985		A0A1W2PRG0	241 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	C19orf81	C9J6K1	198 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	BCR	P11274	1271 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	SDS	P20132	328 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	FEZ1	Q99689	392 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	RASA1	P20936	1047 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	TTC22	Q5TAA0	569 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	NAPB	Q9H115	298 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	EFCC1	Q9HA90	598 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	PRDM1	O75626	825 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	SKAP1	Q86WV1	359 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	TICAM2	Q86XR7	235 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	C12orf42	Q96LP6	360 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	CCDC17	Q96LX7	622 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	13.43	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	PNMA3	Q9UL41	463 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	PEX10	O60683	326 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	OSBP	P22059	807 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	PSMC4	P43686	418 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	ICA1	Q05084	483 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	PPARA	Q07869	468 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	13.42	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	TRIM47	Q96LD4	638 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	RLF	Q13129	1914 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	VCAM1	P19320	739 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	USP14	P54578	494 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	KIF22	Q14807	665 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	ALX1	Q15699	326 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	INCENP	Q9NQS7	918 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	MYH4	Q9Y623	1939 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	FGA	P02671	866 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	HERVK_113	P62684	666 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	IL25	Q9H293	177 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	TMX2	Q9Y320	296 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	CENPF	P49454	3210 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	USP17L15	C9J2P7	530 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	USP17L11	C9JVI0	530 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	USP17L18	D6R9N7	530 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	USP17L22	D6RA61	530 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	USP17L19	D6RCP7	530 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	USP17L20	D6RJB6	530 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	ATP2B2	Q01814	1243 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	USP17L24	Q0WX57	530 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	13.39	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	PARP14	Q460N5	1801 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	HIP1	O00291	1037 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	FCGRT	P55899	365 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	PDE4B	Q07343	736 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	ARHGEF6	Q15052	776 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27

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