RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552294.1

CTDSP2-208, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP2, Length 436 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-208ENST00000552294 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
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CTDSP2-208ENST00000552294 ZBTB22O15209 634 aa8.4□□□□□ -1.06
CTDSP2-208ENST00000552294 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
CTDSP2-208ENST00000552294 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
CTDSP2-208ENST00000552294 CNGA1P29973 690 aa8.4□□□□□ -1.06
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CTDSP2-208ENST00000552294 C16orf59Q7L2K0 433 aa8.4□□□□□ -1.06
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CTDSP2-208ENST00000552294 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
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CTDSP2-208ENST00000552294 TLE2Q04725 743 aa8.39□□□□□ -1.07
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CTDSP2-208ENST00000552294 GRB14Q14449 540 aa8.39□□□□□ -1.07
CTDSP2-208ENST00000552294 SLFNL1Q499Z3 407 aa8.39□□□□□ -1.07
CTDSP2-208ENST00000552294 FAM47AQ5JRC9 791 aa8.39□□□□□ -1.07
CTDSP2-208ENST00000552294 WDR78Q5VTH9 848 aa8.39□□□□□ -1.07
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CTDSP2-208ENST00000552294 CYP2D6P10635 497 aa8.38□□□□□ -1.07
CTDSP2-208ENST00000552294 FOSL2P15408 326 aa8.38□□□□□ -1.07
CTDSP2-208ENST00000552294 SHMT1P34896 483 aa8.38□□□□□ -1.07
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CTDSP2-208ENST00000552294 LRRC41Q15345 812 aa8.38□□□□□ -1.07
CTDSP2-208ENST00000552294 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
CTDSP2-208ENST00000552294 PPM1EQ8WY54 764 aa8.38□□□□□ -1.07
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CTDSP2-208ENST00000552294 SMC4Q9NTJ3 1288 aa8.38□□□□□ -1.07
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CTDSP2-208ENST00000552294 SEPT2Q15019 361 aa8.37□□□□□ -1.07
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CTDSP2-208ENST00000552294 TATDN1Q6P1N9 297 aa8.37□□□□□ -1.07
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CTDSP2-208ENST00000552294 C12orf42Q96LP6 360 aa8.37□□□□□ -1.07
CTDSP2-208ENST00000552294 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CTDSP2-208ENST00000552294 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
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CTDSP2-208ENST00000552294 DNAJB2P25686 324 aa8.35□□□□□ -1.07
CTDSP2-208ENST00000552294 FAAP100Q0VG06 881 aa8.35□□□□□ -1.07
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