RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	STAP2	Q9UGK3	403 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	USP17L15	C9J2P7	530 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	USP17L11	C9JVI0	530 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	USP17L18	D6R9N7	530 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	USP17L22	D6RA61	530 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	USP17L19	D6RCP7	530 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	USP17L20	D6RJB6	530 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	CYP2D6	P10635	497 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	USP17L24	Q0WX57	530 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	CTR9	Q6PD62	1173 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	ACER1	Q8TDN7	264 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	COA7	Q96BR5	231 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	CAPN2	P17655	700 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	GNAT2	P19087	354 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	CDK8	P49336	464 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	FLT3LG	P49771	235 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	SEPT2	Q15019	361 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	SMC5	Q8IY18	1101 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	GJD2	Q9UKL4	321 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	GABRQ	Q9UN88	632 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137		A0A1W2PRG0	241 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	VCAM1	P19320	739 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	FEZ1	Q99689	392 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	SMIM22	K7EJ46	135 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	GPAA1	O43292	621 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	ADCY3	O60266	1144 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	GJB1	P08034	283 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	MAPK4	P31152	587 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	LPAR1	Q92633	364 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	TMX2	Q9Y320	296 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	MYH8	P13535	1937 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	AKR1B1	P15121	316 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	PDE1A	P54750	535 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	ERVK-9	P63128	1117 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	ERVK-24	P63145	666 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	UBXN2A	P68543	259 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	MTFR1	Q15390	333 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137		Q3C1V9	767 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	SH2D4A	Q9H788	454 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137		M0R2C6	588 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	GJA8	P48165	433 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	USP6NL	Q92738	828 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	EVI5L	Q96CN4	794 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	CNMD	O75829	334 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	CCL5	P13501	91 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	RASA1	P20936	1047 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	CCNA1	P78396	465 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	ICA1	Q05084	483 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	COG2	Q14746	738 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	FSD1	Q9BTV5	496 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	13.74	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	VCPKMT	Q9H867	229 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CS-223	ENST00000551137	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21

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